250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2652 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2652  ABC Fe3+-hydroxamate transporter, periplasmic ligand binding protein  100 
 
 		 270 aa  548  1e-155  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  30.15 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  29.01 
 
 		 338 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  28.2 
 
 		 337 aa  102  9e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  31.15 
 
 		 328 aa  102  9e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0114  periplasmic binding protein  28.36 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0137  periplasmic binding protein  29.17 
 
 		 263 aa  99  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  31.4 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4146  periplasmic binding protein  28.68 
 
 		 288 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0746656  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  27 
 
 		 307 aa  98.2  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0241  periplasmic binding protein  29.66 
 
 		 310 aa  96.7  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3425  putative iron transport system substrate-binding protein  26.12 
 
 		 310 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2656  periplasmic binding protein  28.63 
 
 		 269 aa  96.3  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  27.72 
 
 		 338 aa  95.9  6e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  27.72 
 
 		 338 aa  95.9  6e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  27.76 
 
 		 341 aa  95.9  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2623  periplasmic binding protein  26.4 
 
 		 292 aa  95.9  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  26.72 
 
 		 339 aa  95.9  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2784  periplasmic binding protein  27.89 
 
 		 303 aa  95.5  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.151329 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3943  periplasmic binding protein  25.42 
 
 		 309 aa  95.1  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00979003 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1145  periplasmic binding protein  30.74 
 
 		 258 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.676996  normal  0.936441 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5271  periplasmic binding protein  26.95 
 
 		 274 aa  94  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2939  periplasmic binding protein  27.4 
 
 		 297 aa  92.8  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0108677  hitchhiker  0.00600632 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  29.84 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3093  periplasmic binding protein  26.55 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712568 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1119  periplasmic binding protein  28.46 
 
 		 270 aa  90.5  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00373301  normal  0.860622 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2491  periplasmic binding protein  31.84 
 
 		 261 aa  90.1  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2945  putative iron transport system substrate-binding protein  25.59 
 
 		 308 aa  89.7  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2366  periplasmic binding protein  25.78 
 
 		 283 aa  89.4  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4030  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  27.13 
 
 		 288 aa  89.4  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0135159  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4715  periplasmic binding protein  28.68 
 
 		 264 aa  89  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1852  periplasmic binding protein  26.44 
 
 		 309 aa  87.4  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.416782  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0602  iron/cobalamin ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  25.29 
 
 		 258 aa  87.8  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  26.47 
 
 		 318 aa  86.3  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1960  periplasmic binding protein  26.42 
 
 		 255 aa  86.3  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.137759  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3024  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 269 aa  86.3  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0976  periplasmic binding protein  22.97 
 
 		 308 aa  85.9  6e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0429383 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  27.1 
 
 		 322 aa  85.5  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2895  periplasmic binding protein  29.89 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0831  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  24.41 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.3337 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  25.75 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2790  periplasmic binding protein  29.89 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.331269  normal  0.578873 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2668  periplasmic binding protein  29.89 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.812853 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2011  periplasmic binding protein  26.36 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0162028  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1533  hypothetical protein  25.34 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  27.13 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4139  putative periplasmic substrate-binding protein  27.42 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0990029 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2234  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  27.04 
 
 		 311 aa  79.3  0.00000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.281475  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0278  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.10405  normal  0.0273457 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  24.9 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1767  putative periplasmic substrate-binding protein  28.52 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.634386 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3494  periplasmic binding protein  28.16 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0904  putative substrate-binding protein  25.87 
 
 		 269 aa  78.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4172  periplasmic binding protein  27.52 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0319081  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  24.51 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0311  periplasmic binding protein  27.03 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  23.46 
 
 		 318 aa  75.5  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  26.15 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2879  periplasmic binding protein  26.49 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0038  periplasmic binding protein  27.59 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000608499  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  24.45 
 
 		 335 aa  72  0.000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  26.3 
 
 		 296 aa  72  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  25.46 
 
 		 309 aa  72  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  23.64 
 
 		 351 aa  72  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  26.98 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3141  substrate-binding protein of ABC transporter  26.37 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0029  periplasmic binding protein  26.82 
 
 		 287 aa  72  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  26.77 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  23.51 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  26.52 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0266  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  25 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0758  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  22.63 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0632  periplasmic binding protein  25.58 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0647  periplasmic binding protein  25.58 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  23.26 
 
 		 300 aa  68.9  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_35058  predicted protein  31.69 
 
 		 672 aa  68.6  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0840  periplasmic binding protein  26.57 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.62088  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  23.19 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  26.42 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0257  periplasmic binding protein  24.33 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000185774  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0149  periplasmic binding protein  27.3 
 
 		 338 aa  67  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  26.05 
 
 		 289 aa  67  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0606  periplasmic binding protein  25.95 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  22.35 
 
 		 322 aa  67  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2791  periplasmic binding protein  22.58 
 
 		 377 aa  66.6  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  26.04 
 
 		 517 aa  66.2  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0038  periplasmic binding protein  23.74 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000039007  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0962  periplasmic binding protein  25.13 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  25.54 
 
 		 305 aa  65.5  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2394  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  25.97 
 
 		 313 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0672231 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0251  periplasmic binding protein  22.05 
 
 		 300 aa  65.5  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1155  periplasmic binding protein  25.19 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3079  periplasmic binding protein  25.47 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498127  normal  0.441233 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0657  periplasmic binding protein  27.45 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.713656  normal  0.916099 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4565  periplasmic binding protein  26.33 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2782  periplasmic binding protein  23.83 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.21111  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3272  periplasmic binding protein  22.92 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0995  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1001  periplasmic binding protein  24.71 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2494  periplasmic binding protein  22.81 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>