More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2615 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  100 
 
 
793 aa  1625    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  43.9 
 
 
784 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  42.36 
 
 
785 aa  526  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  41.94 
 
 
796 aa  523  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  41.94 
 
 
796 aa  523  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  41.4 
 
 
792 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  41.1 
 
 
790 aa  514  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  53.58 
 
 
390 aa  379  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  50 
 
 
452 aa  346  1e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  49.87 
 
 
428 aa  345  2e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1692  beta-lactamase  43.08 
 
 
531 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499627  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1715  beta-lactamase  42.66 
 
 
528 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102688  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1761  beta-lactamase  42.66 
 
 
528 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5895  beta-lactamase  41.67 
 
 
496 aa  295  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0495  beta-lactamase  43 
 
 
471 aa  294  5e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3234  hypothetical protein  40.1 
 
 
488 aa  291  4e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1366  hypothetical protein  42.58 
 
 
391 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.092066  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1462  hypothetical protein  40.85 
 
 
417 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2096  hypothetical protein  40.77 
 
 
403 aa  280  7e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.846287  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1452  hypothetical protein  39.55 
 
 
413 aa  273  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.535979  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  41.44 
 
 
391 aa  269  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1547  hypothetical protein  39.59 
 
 
413 aa  267  5e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0404742  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1897  hypothetical protein  39.69 
 
 
385 aa  267  7e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.167595  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  42.73 
 
 
395 aa  263  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2487  beta-lactamase  40.31 
 
 
408 aa  259  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2411  hypothetical protein  39.59 
 
 
413 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  41.76 
 
 
966 aa  257  5e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  43.12 
 
 
392 aa  257  5e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  39.95 
 
 
483 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3717  hypothetical protein  37.31 
 
 
390 aa  256  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1124  hypothetical protein  37.6 
 
 
381 aa  249  1e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  40.71 
 
 
430 aa  249  1e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2687  beta-lactamase  42.78 
 
 
381 aa  248  4e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000287138 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1529  beta-lactamase  42.78 
 
 
381 aa  248  4e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303701  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2217  hypothetical protein  38.06 
 
 
430 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.310797  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  40 
 
 
459 aa  243  7e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1365  hypothetical protein  36.3 
 
 
418 aa  243  9e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173694  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1185  hypothetical protein  37.47 
 
 
476 aa  243  1e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.153905 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2755  hypothetical protein  43.56 
 
 
399 aa  241  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47118  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0233  hypothetical protein  40.54 
 
 
386 aa  240  5.999999999999999e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2762  hypothetical protein  36.13 
 
 
388 aa  239  1e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0628  hypothetical protein  37.01 
 
 
442 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0262  hypothetical protein  34.83 
 
 
387 aa  234  6e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.96944  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1662  hypothetical protein  39.94 
 
 
370 aa  234  6e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.739394  normal  0.154555 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2008  hypothetical protein  35.6 
 
 
388 aa  233  1e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0194  hypothetical protein  35.62 
 
 
386 aa  233  1e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  40.4 
 
 
416 aa  233  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1198  hypothetical protein  36.18 
 
 
417 aa  231  3e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1074  hypothetical protein  34.78 
 
 
405 aa  231  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.408971  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1513  hypothetical protein  38.72 
 
 
388 aa  231  4e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1081  hypothetical protein  37.13 
 
 
417 aa  231  6e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7058500000000006e-24 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  38.42 
 
 
574 aa  230  9e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0955  hypothetical protein  35.62 
 
 
407 aa  229  2e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  36.22 
 
 
381 aa  228  4e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0535  hypothetical protein  36.66 
 
 
390 aa  227  5.0000000000000005e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  40.97 
 
 
582 aa  226  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3179  hypothetical protein  36.82 
 
 
444 aa  226  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0164032  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1396  hypothetical protein  36.9 
 
 
397 aa  223  9.999999999999999e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.32411  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  35.05 
 
 
379 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  34.81 
 
 
395 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1364  hypothetical protein  35.2 
 
 
420 aa  222  3e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000043565  normal  0.463886 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  36.62 
 
 
379 aa  221  3e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  41.25 
 
 
566 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  40.79 
 
 
361 aa  221  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2357  hypothetical protein  36.04 
 
 
387 aa  221  6e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  35.71 
 
 
385 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1114  hypothetical protein  34 
 
 
413 aa  217  7e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35960  hypothetical protein  38.63 
 
 
423 aa  216  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.579943  normal  0.373005 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  36.5 
 
 
379 aa  211  3e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  39.08 
 
 
717 aa  210  8e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5695  hypothetical protein  37.95 
 
 
381 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1984  hypothetical protein  33.87 
 
 
390 aa  208  3e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000750429  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  37.5 
 
 
354 aa  207  5e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2362  beta-lactamase  39.88 
 
 
357 aa  203  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.73 
 
 
953 aa  200  7e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0479  beta-lactamase  34.64 
 
 
603 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000533746  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0271  hypothetical protein  37.4 
 
 
443 aa  199  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2113  beta-lactamase  33.75 
 
 
597 aa  197  8.000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.226997 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  35.08 
 
 
1012 aa  197  9e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4513  hypothetical protein  36.22 
 
 
393 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.710596  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0205  hypothetical protein  37.46 
 
 
387 aa  196  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.27 
 
 
1018 aa  194  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2616  beta-lactamase  35 
 
 
366 aa  193  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4515  beta-lactamase  38.86 
 
 
369 aa  192  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.942067 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0459  hypothetical protein  34.01 
 
 
390 aa  191  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  33.71 
 
 
381 aa  191  4e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0591  beta-lactamase  36.34 
 
 
360 aa  191  7e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000780172  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1571  hypothetical protein  34.41 
 
 
424 aa  190  8e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0240807  normal  0.246584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4819  hypothetical protein  32.44 
 
 
420 aa  189  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.389749  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0301  beta-lactamase  35.26 
 
 
351 aa  188  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0665  hypothetical protein  31.34 
 
 
529 aa  188  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000994581  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4816  hypothetical protein  33 
 
 
399 aa  188  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.786963  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0923  hypothetical protein  32.54 
 
 
418 aa  188  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.808008 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0483  hypothetical protein  35.31 
 
 
384 aa  187  8e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.33087  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00140  hypothetical protein  33.7 
 
 
421 aa  186  1.0000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1224  hypothetical protein  32.98 
 
 
408 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367395  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1238  beta-lactamase  35.91 
 
 
361 aa  186  2.0000000000000003e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5693  beta-lactamase  38.04 
 
 
415 aa  184  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3541  hypothetical protein  31.86 
 
 
409 aa  183  9.000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383323  normal  0.81555 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1664  beta-lactamase  35.71 
 
 
348 aa  183  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.15284 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>