More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2580 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2580  peptidylprolyl isomerase  100 
 
 
266 aa  540  1e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3601  Peptidylprolyl isomerase  57.67 
 
 
241 aa  191  9e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.840173  hitchhiker  0.00334322 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4444  peptidylprolyl isomerase  55.69 
 
 
175 aa  186  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  0.482225 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0124  peptidylprolyl isomerase  54.12 
 
 
175 aa  186  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.671624  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6492  Peptidylprolyl isomerase  52.76 
 
 
287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2561  peptidylprolyl isomerase  55.09 
 
 
176 aa  179  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00710  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  51.46 
 
 
176 aa  173  2.9999999999999996e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5243  Peptidylprolyl isomerase  53.57 
 
 
174 aa  172  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0323546  hitchhiker  0.0050054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0105  Peptidylprolyl isomerase  50.28 
 
 
178 aa  168  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268329  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2912  Peptidylprolyl isomerase  48.19 
 
 
172 aa  166  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.530558  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3069  peptidylprolyl isomerase  52.41 
 
 
174 aa  166  5e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00667109  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1668  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  45 
 
 
201 aa  163  3e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00512404  normal  0.631105 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0817  peptidylprolyl isomerase  50.6 
 
 
181 aa  162  6e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104667  normal  0.714543 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2820  peptidylprolyl isomerase  52.12 
 
 
206 aa  162  7e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.400749  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0059  peptidylprolyl isomerase  48.85 
 
 
176 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.958253  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0017  peptidylprolyl isomerase  50.6 
 
 
187 aa  161  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.516433 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00130  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  48.62 
 
 
179 aa  160  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0019  Peptidylprolyl isomerase  51.46 
 
 
173 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567765  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0518  Peptidylprolyl isomerase  46.39 
 
 
172 aa  159  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0013  Peptidylprolyl isomerase  47.95 
 
 
181 aa  159  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000477678 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0018  Peptidylprolyl isomerase  47.75 
 
 
179 aa  158  9e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1936  hypothetical protein  48.8 
 
 
188 aa  156  3e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0012  peptidylprolyl isomerase  46.86 
 
 
181 aa  155  9e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0508371  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1946  hypothetical protein  48.19 
 
 
188 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0057  Peptidylprolyl isomerase  52.91 
 
 
176 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0028  Peptidylprolyl isomerase  48.21 
 
 
177 aa  152  8e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0893  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  44.57 
 
 
178 aa  150  3e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2157  peptidylprolyl isomerase  57.43 
 
 
168 aa  148  9e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00260  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  52.05 
 
 
182 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.06558 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1652  peptidylprolyl isomerase  57.43 
 
 
168 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1854  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  47.24 
 
 
376 aa  145  6e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0045  Peptidylprolyl isomerase  49.17 
 
 
193 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2206  Peptidylprolyl isomerase  58.09 
 
 
168 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2294  Peptidylprolyl isomerase  58.09 
 
 
168 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0333378  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2368  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  53.38 
 
 
357 aa  142  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0638959  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0068  Peptidylprolyl isomerase  48.81 
 
 
178 aa  142  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0010  peptidylprolyl isomerase  49.7 
 
 
175 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0010  peptidylprolyl isomerase  49.7 
 
 
175 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0018  peptidylprolyl isomerase  49.7 
 
 
175 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381111  normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10009  iron-regulated peptidyl-prolyl-cis-trans-isomerase A ppiA  49.7 
 
 
182 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0012  peptidylprolyl isomerase  50.3 
 
 
180 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2367  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  53.47 
 
 
372 aa  140  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153158  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0022  Peptidylprolyl isomerase  49.71 
 
 
177 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.721658  normal  0.0469829 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02090  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  50 
 
 
184 aa  139  4.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.499869  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10708  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  47.44 
 
 
378 aa  137  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11224  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4482  peptidylprolyl isomerase  50 
 
 
176 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0108931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0013  Peptidylprolyl isomerase  49.41 
 
 
182 aa  136  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1444  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  47.37 
 
 
310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0164  Peptidylprolyl isomerase  48.62 
 
 
179 aa  136  4e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.299152 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4996  peptidylprolyl isomerase  48.84 
 
 
176 aa  135  7.000000000000001e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120878  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2158  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  51.41 
 
 
218 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.130314 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0020  Peptidylprolyl isomerase  48.84 
 
 
173 aa  135  7.000000000000001e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1004  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  40.48 
 
 
195 aa  135  9e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00627317  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3780  Peptidylprolyl isomerase  50.3 
 
 
228 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0011  Peptidylprolyl isomerase  48.59 
 
 
179 aa  133  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1591  Peptidylprolyl isomerase  44.83 
 
 
179 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0022  Peptidylprolyl isomerase  49.11 
 
 
177 aa  132  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.424958  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2191  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  45.51 
 
 
310 aa  132  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00827429  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0109  Peptidylprolyl isomerase  48.5 
 
 
182 aa  132  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00140  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  49.1 
 
 
172 aa  132  6.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.439146  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01790  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative  44.63 
 
 
657 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0294  Peptidylprolyl isomerase  55.22 
 
 
170 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07190  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  46.58 
 
 
310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301434  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1482  peptidylprolyl isomerase  43.75 
 
 
376 aa  126  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40159  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  44.91 
 
 
629 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.152782  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0105  Peptidylprolyl isomerase  47.17 
 
 
172 aa  125  7e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01490  cyclophilin-like peptidyl prolyl cis-trans isomerase, putative  43.45 
 
 
174 aa  125  9e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2391  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  52.03 
 
 
322 aa  124  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0613  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  46.39 
 
 
202 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0308143  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2219  peptidylprolyl isomerase  41.08 
 
 
254 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0949  Peptidylprolyl isomerase  50.32 
 
 
197 aa  124  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.436598  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0551  peptidylprolyl isomerase  46.9 
 
 
164 aa  123  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0319  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  45.66 
 
 
189 aa  123  3e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.63935  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38525  predicted protein  40.1 
 
 
665 aa  123  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0504  peptidylprolyl isomerase  44.07 
 
 
181 aa  123  4e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0486  peptidylprolyl isomerase  46.9 
 
 
164 aa  122  5e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02546  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  44.83 
 
 
164 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1859  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  47.2 
 
 
197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000317427  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1651  peptidylprolyl isomerase  45.71 
 
 
223 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.321717  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2295  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  45.71 
 
 
230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.211892  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0070  peptidylprolyl isomerase  48.99 
 
 
194 aa  119  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2207  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  45.71 
 
 
230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.554867  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1136  Peptidylprolyl isomerase  45.77 
 
 
161 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0175391 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1534  peptidylprolyl isomerase  40.29 
 
 
197 aa  119  6e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.861621  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0017  peptidylprolyl isomerase  49.11 
 
 
170 aa  119  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0498338  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2216  peptidylprolyl isomerase  49.62 
 
 
254 aa  118  7.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000598862 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1852  Peptidylprolyl isomerase  43.02 
 
 
181 aa  118  9e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0789  Peptidylprolyl isomerase  46.21 
 
 
163 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.191731  normal  0.0671641 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39722  predicted protein  40.72 
 
 
571 aa  112  4.0000000000000004e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.184646 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1427  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B (PPIase B)(rotamase B)  45.52 
 
 
162 aa  112  5e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14660  predicted protein  41.67 
 
 
178 aa  112  6e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014674  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00380  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01750)  42.77 
 
 
629 aa  111  9e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1711  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  39.39 
 
 
195 aa  112  9e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.756281  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0676  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  36.06 
 
 
468 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00095762  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2344  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  43.48 
 
 
139 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1305  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B  40.37 
 
 
160 aa  109  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1026  Peptidylprolyl isomerase  50.38 
 
 
167 aa  109  5e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1186  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B  40.37 
 
 
160 aa  109  6e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0729  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  48.95 
 
 
167 aa  108  7.000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0969  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  37.44 
 
 
196 aa  108  7.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>