More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2523 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
281 aa  575  1.0000000000000001e-163  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  30.49 
 
 
313 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  39.66 
 
 
349 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  39.08 
 
 
348 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  39.08 
 
 
349 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  35.93 
 
 
335 aa  102  8e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  37.65 
 
 
354 aa  96.3  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  31.07 
 
 
265 aa  91.3  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  28.98 
 
 
263 aa  90.5  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  33.99 
 
 
307 aa  85.9  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  36.42 
 
 
172 aa  84.3  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0894  DSBA oxidoreductase  36.81 
 
 
188 aa  84.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  31.75 
 
 
671 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  31.97 
 
 
652 aa  83.6  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  32.42 
 
 
671 aa  83.2  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  32.54 
 
 
671 aa  82.8  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  28.97 
 
 
652 aa  82.8  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  30.39 
 
 
664 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  28.16 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 
196 aa  80.1  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 
339 aa  80.1  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  29.94 
 
 
224 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  30.34 
 
 
629 aa  79.7  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  30.46 
 
 
288 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  33.77 
 
 
553 aa  79  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  32.76 
 
 
270 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  29.34 
 
 
268 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  30.63 
 
 
228 aa  78.2  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  31.14 
 
 
216 aa  78.6  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  29.19 
 
 
624 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1068  twin-arginine translocation pathway signal  29.34 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  26.97 
 
 
240 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1197  twin-arginine translocation pathway signal  29.94 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  28.74 
 
 
218 aa  76.6  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  29.86 
 
 
182 aa  75.9  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  29.94 
 
 
220 aa  75.5  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  29.94 
 
 
220 aa  75.1  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  29.73 
 
 
233 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  29.17 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  26.76 
 
 
229 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  25.27 
 
 
247 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  31.37 
 
 
246 aa  73.2  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  30.36 
 
 
267 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  30.2 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2828  DSBA oxidoreductase  32.28 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  25.42 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3782  DSBA oxidoreductase  31.96 
 
 
311 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  32.6 
 
 
251 aa  71.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.8 
 
 
244 aa  71.6  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  29.07 
 
 
236 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2538  DSBA oxidoreductase  28.1 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171459  normal  0.017866 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5326  DSBA oxidoreductase  32.28 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.950308  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5684  DSBA oxidoreductase  32.28 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.287578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3690  DSBA oxidoreductase  32.28 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3641  DsbA oxidoreductase  32.46 
 
 
311 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3699  DSBA oxidoreductase  31.44 
 
 
311 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  28.77 
 
 
876 aa  70.1  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0019  DSBA oxidoreductase  26.9 
 
 
276 aa  69.7  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000575449  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  29.73 
 
 
219 aa  69.3  0.00000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.61 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3177  DsbA oxidoreductase  30.07 
 
 
217 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3372  DsbA oxidoreductase  30.72 
 
 
217 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3392  DSBA oxidoreductase  27.67 
 
 
182 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.536541  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3501  DsbA oxidoreductase  30.07 
 
 
217 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  31.03 
 
 
173 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0908  DSBA oxidoreductase  28.97 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0400  protein-disulfide isomerase-like protein  33.33 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  28.95 
 
 
220 aa  68.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  25.7 
 
 
230 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  30.87 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  28.81 
 
 
241 aa  67  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1716  DSBA oxidoreductase  28.4 
 
 
226 aa  67  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127948  normal  0.514316 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0115  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  30.41 
 
 
223 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1464  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  30.41 
 
 
228 aa  66.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336066  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2720  DSBA oxidoreductase  28.99 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  30.92 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2358  DSBA oxidoreductase  28.48 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147165  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1819  DSBA oxidoreductase  31.55 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.621459  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  27.54 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2862  DSBA oxidoreductase  28.48 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.898425  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4951  DSBA oxidoreductase  33.79 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.120355  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  27.71 
 
 
217 aa  64.7  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  30.65 
 
 
228 aa  65.1  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  30.36 
 
 
263 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2436  DSBA oxidoreductase  29.8 
 
 
255 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5236  DSBA oxidoreductase  27.18 
 
 
276 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4714  DSBA oxidoreductase  27.18 
 
 
273 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0528991  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0863  DSBA oxidoreductase  27.61 
 
 
254 aa  63.9  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00216121  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0667  Na+/H+ antiporter NhaA  27.03 
 
 
617 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.74457  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1491  DSBA oxidoreductase  28.28 
 
 
227 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144456  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  25.14 
 
 
262 aa  63.2  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  27.45 
 
 
232 aa  62.8  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0238  Na+/H+ antiporter NhaA  26.35 
 
 
617 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2484  DSBA oxidoreductase  28.03 
 
 
235 aa  62.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215444  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0900  hypothetical protein  29.17 
 
 
230 aa  62.4  0.000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000692645  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1468  DSBA oxidoreductase  28.28 
 
 
313 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  28 
 
 
253 aa  62.4  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2185  DSBA oxidoreductase  27.22 
 
 
255 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  25.16 
 
 
275 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2411  disulfide bond formation protein  24.53 
 
 
207 aa  61.6  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>