More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2467 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2467  patatin  100 
 
 		 324 aa  659    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  43.31 
 
 		 273 aa  202  6e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  40.78 
 
 		 263 aa  195  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  42.86 
 
 		 262 aa  192  8e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  40 
 
 		 263 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  40 
 
 		 263 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  40 
 
 		 263 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  40 
 
 		 263 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  40 
 
 		 263 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  40 
 
 		 263 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  39.61 
 
 		 263 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  39.22 
 
 		 263 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  37.65 
 
 		 263 aa  188  9e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  38.43 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  39.23 
 
 		 275 aa  183  3e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  37.97 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  38.96 
 
 		 256 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  37.97 
 
 		 318 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  38.82 
 
 		 260 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  39.45 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  37.07 
 
 		 275 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  38.02 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  37.84 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  38.17 
 
 		 275 aa  171  2e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  37.64 
 
 		 302 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  37.74 
 
 		 301 aa  169  6e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  36.64 
 
 		 319 aa  169  7e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  37.89 
 
 		 305 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  37.89 
 
 		 305 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  37.89 
 
 		 306 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  39.37 
 
 		 320 aa  169  8e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  38.82 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  37.17 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  36.19 
 
 		 358 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  37.45 
 
 		 349 aa  166  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  38.34 
 
 		 333 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  35.55 
 
 		 347 aa  165  9e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  35.55 
 
 		 306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  35.55 
 
 		 474 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  35.55 
 
 		 347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  34.8 
 
 		 250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  35.55 
 
 		 347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  37.94 
 
 		 320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  36.74 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2157  patatin  36.22 
 
 		 257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0732494  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  37.94 
 
 		 320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  36.74 
 
 		 315 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2488  Patatin  36.65 
 
 		 262 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  36.5 
 
 		 317 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2340  alpha-beta hydrolase family esterase  34.54 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  35.42 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  33.33 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  36.98 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  33.33 
 
 		 346 aa  156  3e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  38.78 
 
 		 298 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  36.14 
 
 		 253 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  34.92 
 
 		 272 aa  155  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  34.69 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  38.21 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  35.38 
 
 		 345 aa  154  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  33.33 
 
 		 728 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  37.21 
 
 		 323 aa  152  8e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  35.83 
 
 		 330 aa  152  8.999999999999999e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  37.34 
 
 		 358 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  32.4 
 
 		 728 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  33.8 
 
 		 727 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  32.99 
 
 		 751 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  38.14 
 
 		 327 aa  149  8e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  34.77 
 
 		 348 aa  146  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  37.04 
 
 		 250 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1338  Patatin  36.51 
 
 		 280 aa  145  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  35.29 
 
 		 315 aa  144  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  38.22 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2119  Patatin  33.07 
 
 		 265 aa  144  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000166594  decreased coverage  0.00184806 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  34.78 
 
 		 728 aa  143  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  28.57 
 
 		 760 aa  144  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1917  Patatin  36.33 
 
 		 267 aa  143  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  33.47 
 
 		 347 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  33.47 
 
 		 347 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000473323  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0066  alpha-beta hydrolase family esterase  32.27 
 
 		 310 aa  142  6e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5123  Patatin  32.82 
 
 		 354 aa  142  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0301  hypothetical protein  35.17 
 
 		 259 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714292  unclonable  0.000000738191 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  29.45 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0303  patatin  31.06 
 
 		 314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0052982  hitchhiker  0.00220393 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0664  patatin  33.45 
 
 		 299 aa  139  6e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  32.43 
 
 		 738 aa  138  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  38.89 
 
 		 287 aa  138  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  31.45 
 
 		 728 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4068  patatin  31.99 
 
 		 733 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.288798 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  41.71 
 
 		 327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  36.69 
 
 		 707 aa  136  4e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  33.97 
 
 		 259 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  32.5 
 
 		 777 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  34.94 
 
 		 276 aa  135  7.000000000000001e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  34.94 
 
 		 803 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  34.94 
 
 		 803 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  43.33 
 
 		 323 aa  135  9e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  34.94 
 
 		 803 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  33.57 
 
 		 728 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  32.5 
 
 		 748 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>