More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2460 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2460  glycine cleavage system protein H  100 
 
 		 126 aa  255  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  57.38 
 
 		 126 aa  143  7.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  52.71 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1328  glycine cleavage system H protein  59.29 
 
 		 126 aa  141  3e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0132  glycine cleavage system H protein  55.83 
 
 		 153 aa  140  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  55.56 
 
 		 127 aa  140  7e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  59.17 
 
 		 127 aa  139  9e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  59.17 
 
 		 127 aa  139  9e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  59.17 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  55.28 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  52.76 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  53.17 
 
 		 126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  58.33 
 
 		 127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  58.33 
 
 		 127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  58.33 
 
 		 127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  55.56 
 
 		 126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  58.33 
 
 		 127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  55.56 
 
 		 126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  58.33 
 
 		 127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  58.33 
 
 		 127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  58.33 
 
 		 127 aa  138  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  58.33 
 
 		 127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2994  glycine cleavage system H protein  55.83 
 
 		 126 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3310  glycine cleavage system H protein  55.83 
 
 		 126 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0128  glycine cleavage system H protein  55.83 
 
 		 126 aa  137  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3254  glycine cleavage system H protein  55.83 
 
 		 126 aa  137  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3927  glycine cleavage system H protein  55.83 
 
 		 126 aa  137  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0419405  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3060  glycine cleavage system H protein  55.83 
 
 		 126 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1543  glycine cleavage system H protein  55.83 
 
 		 126 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532725  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3998  glycine cleavage system H protein  55.83 
 
 		 126 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0144  glycine cleavage system protein H  54.17 
 
 		 126 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.87599 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  53.33 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68860  glycine cleavage system protein H  52.54 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1738  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 122 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000301495  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0177  glycine cleavage system protein H  51.56 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 128 aa  134  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 128 aa  134  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 128 aa  134  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3300  glycine cleavage system H protein  56.67 
 
 		 123 aa  134  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906564  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  52.8 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3324  glycine cleavage H-protein  54.17 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  52.38 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  48.39 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  52.03 
 
 		 126 aa  130  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0158  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3330  glycine cleavage system protein H  53.72 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0213  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2910  glycine cleavage system protein H  54.17 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0145  glycine cleavage system protein H  54.17 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  49.61 
 
 		 129 aa  130  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  52.42 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4011  glycine cleavage system H protein  47.73 
 
 		 134 aa  130  7.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109498  normal  0.181592 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5959  glycine cleavage system protein H  52.68 
 
 		 142 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3481  glycine cleavage system protein H  52.07 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1654  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  48.36 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2055  glycine cleavage system H protein  53.78 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 		 126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5100  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.831636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 126 aa  127  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  50.82 
 
 		 127 aa  126  8.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5193  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.458089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  53.23 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3161  glycine cleavage system protein H  54.24 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.876766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1732  glycine cleavage H-protein  51.59 
 
 		 125 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  49.17 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3363  glycine cleavage system H protein  57.85 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  47.62 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0187  glycine cleavage system H protein  47.97 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.717665  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  47.62 
 
 		 128 aa  125  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  48.33 
 
 		 122 aa  124  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  50.4 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  50.4 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1982  glycine cleavage system H protein  46.09 
 
 		 130 aa  124  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0297807  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5253  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 		 127 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0225  glycine cleavage system protein H  51.56 
 
 		 127 aa  124  6e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0929838 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3488  glycine cleavage system protein H  53.39 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  53.78 
 
 		 127 aa  123  7e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  47.11 
 
 		 135 aa  123  9e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  47.58 
 
 		 125 aa  122  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0131  glycine cleavage system protein H  50.82 
 
 		 125 aa  122  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0116  glycine cleavage system protein H  50.82 
 
 		 125 aa  122  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3310  glycine cleavage system protein H  47.11 
 
 		 136 aa  123  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0332  glycine cleavage system protein H  51.79 
 
 		 129 aa  123  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 131 aa  122  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1560  glycine cleavage system H protein  54.24 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>