More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2446 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2446  ThiJ/PfpI family protein  100 
 
 
329 aa  675    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2951  ThiJ/PfpI domain protein  41.12 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  normal  0.0783376 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.79 
 
 
199 aa  146  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  40.53 
 
 
198 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.79 
 
 
199 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.11 
 
 
193 aa  141  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0813  hypothetical protein  39.06 
 
 
198 aa  139  7.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.396328  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3414  hypothetical protein  39.47 
 
 
196 aa  138  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30652  normal  0.0495124 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2521  ThiJ/PfpI  38.14 
 
 
205 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.572774  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2641  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.97 
 
 
228 aa  134  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2739  ThiJ/PfpI  36.41 
 
 
201 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.446828 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2901  transcriptional regulator, AraC family; protease  42.11 
 
 
197 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2656  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.05 
 
 
198 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2427  transcriptional regulator, AraC family  42.55 
 
 
198 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.424893 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1334  ThiJ/PfpI  43.08 
 
 
199 aa  129  6e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  37.11 
 
 
202 aa  129  9.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2867  transcriptional regulator, AraC family  42.55 
 
 
198 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2883  hypothetical protein  39.47 
 
 
198 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00738999  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1462  ThiJ/PfpI domain protein  38.46 
 
 
208 aa  125  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2954  ThiJ/PfpI family protein  34.87 
 
 
201 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0165103  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1194  hypothetical protein  37.57 
 
 
241 aa  123  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1200  hypothetical protein  37.57 
 
 
241 aa  123  4e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  38.1 
 
 
225 aa  122  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.31 
 
 
207 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.33 
 
 
233 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2791  ThiJ/PfpI  36.36 
 
 
194 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3383  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.95 
 
 
225 aa  115  6.9999999999999995e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0079  ThiJ/PfpI domain protein  36.04 
 
 
239 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245604  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2579  ThiJ/PfpI  34.03 
 
 
202 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.95 
 
 
210 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  35.61 
 
 
220 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1680  ThiJ/PfpI domain protein  36.27 
 
 
207 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.883371  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  36.26 
 
 
238 aa  113  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3444  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.7 
 
 
188 aa  112  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  34.25 
 
 
198 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6177  ThiJ/PfpI domain protein  37.63 
 
 
207 aa  112  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0454094 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0031  ThiJ/PfpI  36.76 
 
 
232 aa  112  8.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0533722 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  40.64 
 
 
316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.07 
 
 
225 aa  110  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.76 
 
 
242 aa  110  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2109  ThiJ/PfpI domain protein  33.87 
 
 
233 aa  109  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0113293  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3528  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.41 
 
 
198 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  35.16 
 
 
691 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.29 
 
 
225 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  35.16 
 
 
232 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3285  AraC family transcriptional regulator  34.25 
 
 
209 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  35.16 
 
 
232 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1154  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.67 
 
 
234 aa  107  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0937941 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  35.16 
 
 
232 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1313  ThiJ/PfpI domain protein  36.67 
 
 
234 aa  107  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  32.23 
 
 
226 aa  107  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  35.16 
 
 
242 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  35.16 
 
 
242 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  35.71 
 
 
228 aa  106  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2098  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.64 
 
 
231 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  35.45 
 
 
319 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  35.16 
 
 
242 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1507  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.57 
 
 
191 aa  106  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.233301  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  35.45 
 
 
319 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  32.69 
 
 
224 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  34.57 
 
 
322 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  35.45 
 
 
387 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  34.07 
 
 
227 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.07 
 
 
227 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.07 
 
 
227 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  33.33 
 
 
243 aa  103  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  31.55 
 
 
218 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  29.44 
 
 
228 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  29.44 
 
 
228 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.75 
 
 
224 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3881  transcriptional regulator  35.9 
 
 
293 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3031  ThiJ/PfpI  30.64 
 
 
234 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140928  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1967  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.45 
 
 
226 aa  101  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.428082  normal  0.019614 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  33.33 
 
 
199 aa  101  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  34.92 
 
 
319 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1435  ThiJ/PfpI domain protein  31.05 
 
 
199 aa  100  4e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  32.28 
 
 
322 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  33.86 
 
 
324 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  36.9 
 
 
319 aa  99.8  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  35.45 
 
 
323 aa  99.8  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
324 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
324 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5782  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.93 
 
 
206 aa  99.4  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.639034  hitchhiker  0.00267139 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2700  ThiJ/PfpI domain protein  30.43 
 
 
229 aa  99  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0269047  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  32.28 
 
 
334 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2969  ThiJ/PfpI domain protein  32.31 
 
 
205 aa  97.8  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7628  intracellular protease/amidase  34.05 
 
 
261 aa  97.4  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3105  ThiJ/PfpI domain protein  31.15 
 
 
231 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4181  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.1 
 
 
234 aa  97.1  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4063  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.1 
 
 
234 aa  97.1  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2759  ThiJ/PfpI domain protein  32.97 
 
 
211 aa  96.3  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  32.99 
 
 
327 aa  96.3  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1617  transcriptional regulator  32.28 
 
 
344 aa  96.3  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  33.15 
 
 
358 aa  95.9  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  34.59 
 
 
348 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  31.15 
 
 
245 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.15 
 
 
245 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.15 
 
 
245 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  32.28 
 
 
362 aa  95.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0689  transcriptional regulator  29.1 
 
 
297 aa  94.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>