More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2412 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2412  histidine kinase  100 
 
 		 603 aa  1212    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0803  histidine kinase  47.82 
 
 		 718 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0571523  hitchhiker  0.00843936 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0133  histidine kinase  50.32 
 
 		 482 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4974  sensor histidine kinase  52.63 
 
 		 299 aa  297  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2974  histidine kinase  54.83 
 
 		 298 aa  283  8.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.355012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2797  histidine kinase  35.14 
 
 		 583 aa  283  9e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2265  histidine kinase  35.02 
 
 		 562 aa  279  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.135939 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3137  histidine kinase  52.73 
 
 		 291 aa  273  9e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4407  histidine kinase  52.75 
 
 		 286 aa  272  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.449221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3740  histidine kinase  34.35 
 
 		 616 aa  271  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0478  histidine kinase  36.23 
 
 		 560 aa  268  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.676006  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.81 
 
 		 1155 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 		 1155 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.24 
 
 		 1155 aa  252  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 		 1149 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.07 
 
 		 1158 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.76 
 
 		 1163 aa  243  7e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.81 
 
 		 1145 aa  241  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.16 
 
 		 1362 aa  241  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1037  sensor histidine kinase/response regulator  33.48 
 
 		 896 aa  239  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.62 
 
 		 1839 aa  238  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0932  sensor histidine kinase/response regulator  33.48 
 
 		 896 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0917  sensor histidine kinase  33.48 
 
 		 896 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0996  sensor histidine kinase/response regulator  33.48 
 
 		 896 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.77 
 
 		 1203 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.99 
 
 		 1857 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1163  sensor histidine kinase/response regulator  33.71 
 
 		 896 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0900  sensor histidine kinase  33.26 
 
 		 896 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  35.87 
 
 		 1695 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4266  sensor histidine kinase/response regulator  33.63 
 
 		 896 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000252034 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.76 
 
 		 1165 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.985282 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1072  sensor histidine kinase/response regulator  33.26 
 
 		 896 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.88167e-43 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  31.78 
 
 		 1170 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5233  histidine kinase  32.79 
 
 		 638 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.4 
 
 		 791 aa  233  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1090  sensor histidine kinase/response regulator  33.26 
 
 		 896 aa  232  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.358618  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0508  histidine kinase  33.12 
 
 		 632 aa  232  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0907  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.03 
 
 		 896 aa  231  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3343  histidine kinase  32.95 
 
 		 632 aa  231  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  34.82 
 
 		 1200 aa  231  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 		 2099 aa  231  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  36.08 
 
 		 1361 aa  231  4e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2445  response regulator receiver  32.01 
 
 		 1172 aa  230  5e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00053345 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.4 
 
 		 977 aa  228  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  33.69 
 
 		 1137 aa  227  5.0000000000000005e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 		 1168 aa  226  7e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.32 
 
 		 2099 aa  226  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1073  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.92 
 
 		 1158 aa  226  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00830683  normal  0.406928 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.25 
 
 		 917 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.58 
 
 		 1917 aa  224  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4122  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.56 
 
 		 1853 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 		 1137 aa  224  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.24 
 
 		 1143 aa  223  7e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4276  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.56 
 
 		 1847 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.77 
 
 		 975 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.69 
 
 		 974 aa  221  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.29 
 
 		 1356 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2076  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.24 
 
 		 2107 aa  220  5e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 		 1141 aa  220  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2644  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.29 
 
 		 1303 aa  220  5e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229306  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  36.29 
 
 		 1046 aa  219  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.71 
 
 		 1142 aa  218  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4253  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.88 
 
 		 1843 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.53 
 
 		 927 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  33.84 
 
 		 970 aa  217  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2112  Cache sensor hybrid histidine kinase  36.25 
 
 		 1361 aa  218  4e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.39 
 
 		 1195 aa  217  5e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.22 
 
 		 1155 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1267  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.69 
 
 		 916 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5775  histidine kinase  30.97 
 
 		 554 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.941039 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.27 
 
 		 1896 aa  215  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0286  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.84 
 
 		 1406 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4248  ATP-binding region ATPase domain protein  31.62 
 
 		 1196 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1737  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 		 1037 aa  213  5.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476029  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1035  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 		 1201 aa  212  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.05 
 
 		 823 aa  211  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.32 
 
 		 1977 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0185  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.17 
 
 		 1214 aa  211  5e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467777  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.79 
 
 		 1003 aa  210  6e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.56 
 
 		 1713 aa  210  6e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280335  normal  0.123564 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.86 
 
 		 1177 aa  209  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.02 
 
 		 1954 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.38 
 
 		 1038 aa  208  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.21 
 
 		 687 aa  208  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.9 
 
 		 858 aa  207  5e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.03 
 
 		 1022 aa  206  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3558  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.35 
 
 		 984 aa  206  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0144  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.13 
 
 		 1119 aa  206  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0287  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 		 1160 aa  206  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1960  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.39 
 
 		 1680 aa  205  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.0344276 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2180  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.19 
 
 		 922 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.238731  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  33.17 
 
 		 1161 aa  203  7e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3009  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.06 
 
 		 920 aa  203  7e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.59521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1053  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.81 
 
 		 1458 aa  203  8e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0401  sensor histidine kinase/response regulator  30.98 
 
 		 1392 aa  203  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1215  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.27 
 
 		 944 aa  202  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.960151  normal  0.101285 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.41 
 
 		 1159 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1031  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.92 
 
 		 1131 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.768055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2206  histidine kinase  33.74 
 
 		 556 aa  201  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3600  histidine kinase  34.05 
 
 		 548 aa  201  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.94225  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>