More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2380 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  100 
 
 
474 aa  949    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  49.66 
 
 
446 aa  385  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  48.96 
 
 
447 aa  383  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  48.5 
 
 
441 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  47.74 
 
 
440 aa  364  2e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  46.98 
 
 
424 aa  363  3e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1049  major facilitator superfamily MFS_1  51.9 
 
 
421 aa  350  3e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  46.54 
 
 
432 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  47.01 
 
 
419 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  45.09 
 
 
428 aa  321  1.9999999999999998e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  44.04 
 
 
414 aa  313  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  42.57 
 
 
413 aa  306  6e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  47.34 
 
 
412 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  45.11 
 
 
413 aa  301  2e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  45.63 
 
 
414 aa  299  7e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  44.3 
 
 
474 aa  297  3e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  40.83 
 
 
418 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  44.36 
 
 
418 aa  286  5e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1008  major facilitator superfamily MFS_1  44.5 
 
 
414 aa  286  5e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1011  major facilitator superfamily MFS_1  44.5 
 
 
414 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  42.56 
 
 
401 aa  282  1e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  36.52 
 
 
423 aa  280  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  37.16 
 
 
430 aa  280  4e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  40.32 
 
 
409 aa  279  9e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  40.15 
 
 
412 aa  278  1e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  42.09 
 
 
413 aa  274  3e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  36.38 
 
 
440 aa  273  7e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  35.78 
 
 
436 aa  272  8.000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  39.24 
 
 
410 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  38.69 
 
 
423 aa  268  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  39.28 
 
 
431 aa  267  4e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  40.25 
 
 
426 aa  265  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  39.44 
 
 
408 aa  264  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  38.4 
 
 
421 aa  263  6.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  34.85 
 
 
413 aa  260  3e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  36.88 
 
 
418 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  35.64 
 
 
442 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0746  hypothetical protein  35.47 
 
 
431 aa  252  9.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0165656  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  35.64 
 
 
433 aa  251  1e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  41.75 
 
 
414 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  40.43 
 
 
426 aa  239  9e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3035  MFS family transporter  35.1 
 
 
425 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  33.26 
 
 
426 aa  238  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  36.18 
 
 
450 aa  237  3e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3762  major facilitator transporter  35.1 
 
 
425 aa  237  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  37.04 
 
 
431 aa  237  4e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  37.68 
 
 
446 aa  236  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5797  hypothetical protein  37.28 
 
 
419 aa  234  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  36.64 
 
 
435 aa  233  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 
410 aa  233  5e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  36.24 
 
 
453 aa  228  1e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  35.92 
 
 
414 aa  227  3e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  34.12 
 
 
456 aa  227  3e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  33.25 
 
 
429 aa  227  4e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  35.71 
 
 
452 aa  225  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  35.34 
 
 
417 aa  225  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  34.29 
 
 
441 aa  224  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  33.94 
 
 
457 aa  225  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  34.1 
 
 
435 aa  224  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  39.46 
 
 
418 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  36.14 
 
 
446 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3542  major facilitator superfamily MFS_1  39.19 
 
 
405 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00114528  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  35.77 
 
 
461 aa  219  7e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  35.43 
 
 
442 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  34.97 
 
 
413 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  33.77 
 
 
405 aa  216  5e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  35.31 
 
 
413 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  35.31 
 
 
413 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  35.66 
 
 
413 aa  216  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  35.7 
 
 
412 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  34.47 
 
 
424 aa  214  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  34.55 
 
 
412 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  35.64 
 
 
416 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  36.5 
 
 
441 aa  213  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  34.53 
 
 
428 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  35.04 
 
 
441 aa  212  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  35.93 
 
 
407 aa  212  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  32.72 
 
 
420 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 
402 aa  211  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  35.87 
 
 
450 aa  211  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  36.27 
 
 
403 aa  211  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  35.12 
 
 
416 aa  209  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  35.58 
 
 
419 aa  209  6e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  38.2 
 
 
378 aa  209  7e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  34.01 
 
 
418 aa  209  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  34.96 
 
 
417 aa  207  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  33.58 
 
 
419 aa  207  4e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  34.72 
 
 
429 aa  206  6e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  34.41 
 
 
494 aa  206  8e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  32.43 
 
 
415 aa  206  9e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  33.84 
 
 
404 aa  205  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  33.33 
 
 
403 aa  205  1e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  35.8 
 
 
405 aa  205  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  33.77 
 
 
428 aa  203  5e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 
433 aa  203  6e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  32.01 
 
 
406 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  35.1 
 
 
404 aa  202  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 
425 aa  202  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  34.07 
 
 
415 aa  199  7e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  34.11 
 
 
450 aa  199  7e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>