More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2377 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  100 
 
 
421 aa  847    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  38.69 
 
 
426 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  38.92 
 
 
445 aa  237  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  37.59 
 
 
412 aa  237  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  38.03 
 
 
426 aa  236  4e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  36.02 
 
 
444 aa  236  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  38.01 
 
 
405 aa  235  9e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  36.41 
 
 
426 aa  232  1e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  38.08 
 
 
408 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  38.08 
 
 
408 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  38.08 
 
 
408 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  38.8 
 
 
440 aa  227  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  36.14 
 
 
414 aa  225  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  37.5 
 
 
480 aa  224  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  35.75 
 
 
417 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  35.75 
 
 
417 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  35.75 
 
 
417 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  36.47 
 
 
429 aa  222  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  36.02 
 
 
430 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  38.07 
 
 
419 aa  219  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  36.54 
 
 
411 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  36.01 
 
 
424 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  34.11 
 
 
428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  34.03 
 
 
431 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  35.9 
 
 
430 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  36.47 
 
 
426 aa  210  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  34.87 
 
 
422 aa  209  7e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  33.72 
 
 
441 aa  208  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  34.79 
 
 
421 aa  207  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  35.4 
 
 
402 aa  206  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  34.69 
 
 
438 aa  206  8e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  36.59 
 
 
455 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  33.41 
 
 
433 aa  202  8e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  35.8 
 
 
402 aa  199  7.999999999999999e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  35.48 
 
 
404 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  37.04 
 
 
433 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  34.99 
 
 
403 aa  197  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  33.41 
 
 
423 aa  197  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  34.91 
 
 
409 aa  196  6e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  35.15 
 
 
428 aa  196  7e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  33.25 
 
 
470 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  33.33 
 
 
432 aa  193  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  32.56 
 
 
431 aa  191  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  33.64 
 
 
426 aa  190  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  36.14 
 
 
444 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  34.29 
 
 
423 aa  188  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  34.14 
 
 
407 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  35.45 
 
 
433 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  34.27 
 
 
419 aa  180  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  33.02 
 
 
432 aa  179  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  33.5 
 
 
459 aa  179  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2932  amidohydrolase  32.54 
 
 
431 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  35.12 
 
 
444 aa  178  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  32.23 
 
 
407 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  33.83 
 
 
423 aa  176  5e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  35.33 
 
 
437 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  33.56 
 
 
419 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  33.97 
 
 
434 aa  173  5.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  36.1 
 
 
407 aa  172  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  33.01 
 
 
405 aa  169  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  30.79 
 
 
445 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  33.08 
 
 
411 aa  164  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  29.8 
 
 
443 aa  164  3e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  33.17 
 
 
417 aa  164  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  31.99 
 
 
414 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  31.08 
 
 
411 aa  162  9e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  29.17 
 
 
412 aa  159  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  31.4 
 
 
411 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  31.03 
 
 
421 aa  159  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  32.07 
 
 
425 aa  159  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  31.35 
 
 
413 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  31.81 
 
 
415 aa  157  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  31.29 
 
 
408 aa  157  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  29.3 
 
 
412 aa  156  6e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  32.41 
 
 
461 aa  155  9e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  31.21 
 
 
413 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  30.02 
 
 
401 aa  155  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  30.5 
 
 
416 aa  153  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  31.72 
 
 
436 aa  152  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  32.81 
 
 
478 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  29.82 
 
 
486 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  31.63 
 
 
461 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  31.83 
 
 
412 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  28.76 
 
 
451 aa  145  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  31.07 
 
 
407 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  31.3 
 
 
396 aa  145  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  31.49 
 
 
409 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  31.49 
 
 
409 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  31.49 
 
 
409 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  29.88 
 
 
407 aa  144  3e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  28.03 
 
 
413 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  29.15 
 
 
434 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  28.81 
 
 
413 aa  140  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  32.35 
 
 
415 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  29.76 
 
 
400 aa  139  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3671  amidohydrolase  31.94 
 
 
428 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  31.6 
 
 
418 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1275  amidohydrolase  28.05 
 
 
415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  29 
 
 
413 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  29 
 
 
413 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>