More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2084 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2084  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  100 
 
 
332 aa  672    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.432383  normal  0.0544348 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4423  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  54.18 
 
 
343 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0405  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  50.77 
 
 
315 aa  301  8.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0956264  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10990  threonine dehydratase  51.85 
 
 
330 aa  296  5e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  42.38 
 
 
403 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  45.34 
 
 
320 aa  260  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2761  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  46.88 
 
 
311 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0379414  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  43.65 
 
 
405 aa  255  6e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  45.19 
 
 
401 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5038  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  49.69 
 
 
316 aa  253  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  43.81 
 
 
395 aa  253  3e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4359  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.4 
 
 
321 aa  253  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2731  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  46.56 
 
 
311 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437553  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2775  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  46.56 
 
 
311 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256575  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  41.67 
 
 
402 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  42.31 
 
 
402 aa  250  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  42.19 
 
 
403 aa  250  3e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3022  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  44.48 
 
 
319 aa  249  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.380289  normal  0.480541 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3301  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  44.72 
 
 
317 aa  248  9e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0872906  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2441  threonine dehydratase  43.95 
 
 
406 aa  247  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000148333  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2122  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.77 
 
 
332 aa  247  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113848  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2749  serine/threonine dehydratase  40.62 
 
 
329 aa  243  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.976068  normal  0.188122 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2353  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.77 
 
 
304 aa  242  7e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3024  serine/threonine dehydratase  41.48 
 
 
327 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.657455  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2024  serine/threonine dehydratase  41.72 
 
 
327 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2589  serine/threonine dehydratase  41.72 
 
 
327 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2154  serine/threonine dehydratase  41.72 
 
 
327 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160639  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3108  serine/threonine dehydratase  41.72 
 
 
327 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0755  serine/threonine dehydratase  41.72 
 
 
327 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.284278  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3078  serine/threonine dehydratase  41.72 
 
 
327 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.642158  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1524  serine/threonine dehydratase  42.36 
 
 
327 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00616628  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2436  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  46.6 
 
 
319 aa  238  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014581  normal  0.339712 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  40.31 
 
 
403 aa  236  4e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3081  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.38 
 
 
320 aa  236  5.0000000000000005e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4113  serine/threonine dehydratase  41.59 
 
 
325 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.559381  normal  0.528842 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4000  serine/threonine dehydratase  41.59 
 
 
325 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4417  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.12 
 
 
323 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936913  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  43.26 
 
 
402 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0656  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.77 
 
 
325 aa  232  5e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.360995  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  38.17 
 
 
403 aa  233  5e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  41.02 
 
 
401 aa  232  6e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  43.52 
 
 
506 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  43.52 
 
 
506 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  38.49 
 
 
403 aa  232  8.000000000000001e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5857  serine/threonine dehydratase  42.81 
 
 
324 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3918  serine/threonine dehydratase  42.81 
 
 
324 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4450  serine/threonine dehydratase  42.81 
 
 
324 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4527  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  47.52 
 
 
314 aa  229  5e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201756 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  39.63 
 
 
404 aa  229  6e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  40.88 
 
 
507 aa  229  6e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  37.66 
 
 
403 aa  229  6e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  42.11 
 
 
415 aa  229  7e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  37.66 
 
 
403 aa  228  1e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  45.74 
 
 
403 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0996  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.63 
 
 
338 aa  228  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100397  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1698  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.62 
 
 
328 aa  227  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4106  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  46.89 
 
 
316 aa  227  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14297  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  39.88 
 
 
402 aa  225  7e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  39.16 
 
 
511 aa  225  8e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1999  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.54 
 
 
327 aa  225  9e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.232127  normal  0.0256185 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4343  serine/threonine dehydratase  39.75 
 
 
324 aa  225  9e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675522  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3882  serine/threonine dehydratase  39.75 
 
 
324 aa  225  9e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0375891 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1493  serine/threonine dehydratase  40.84 
 
 
324 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.317282 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3519  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.94 
 
 
339 aa  223  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00283546  normal  0.133146 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4177  serine/threonine dehydratase  42.49 
 
 
326 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4110  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.82 
 
 
333 aa  222  8e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579842  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  40 
 
 
402 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3783  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.12 
 
 
323 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.930239  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  40.06 
 
 
504 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0305  serine/threonine dehydratase  40.19 
 
 
322 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.333559 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  40.06 
 
 
504 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1527  threonine dehydratase  39.75 
 
 
346 aa  219  5e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0934976  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1498  threonine dehydratase  39.75 
 
 
346 aa  219  5e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  41.84 
 
 
520 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  40.25 
 
 
403 aa  218  8.999999999999998e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  42.6 
 
 
401 aa  218  1e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1894  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.43 
 
 
324 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0510457  normal  0.19276 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  38.51 
 
 
408 aa  218  1e-55  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  39.94 
 
 
514 aa  218  1e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0687  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  39.94 
 
 
304 aa  218  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  42.6 
 
 
401 aa  218  1e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  44.38 
 
 
402 aa  217  2e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3470  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.08 
 
 
318 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.380484  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  39.39 
 
 
418 aa  216  2.9999999999999998e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2250  serine/threonine dehydratase  38.2 
 
 
324 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.63083  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  40.66 
 
 
515 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  41.64 
 
 
408 aa  216  4e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0152  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.18 
 
 
318 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  43.08 
 
 
403 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  40.66 
 
 
515 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3492  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.71 
 
 
338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.948459  normal  0.510498 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3217  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  40.89 
 
 
324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555071  normal  0.861719 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1722  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.87 
 
 
320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  42.91 
 
 
509 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  40.2 
 
 
503 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  41.49 
 
 
403 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4825  serine/threonine dehydratase  37.5 
 
 
322 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00349984  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2556  serine/threonine dehydratase  38.41 
 
 
324 aa  212  7.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.867257  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1498  threonine dehydratase  43.3 
 
 
421 aa  212  7.999999999999999e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4347  serine/threonine dehydratase  41.22 
 
 
322 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>