More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2047 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  100 
 
 
882 aa  1783    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  37.43 
 
 
871 aa  496  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.23 
 
 
823 aa  489  1e-137  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  35.45 
 
 
869 aa  488  1e-136  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.83 
 
 
813 aa  484  1e-135  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  36.96 
 
 
814 aa  481  1e-134  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.07 
 
 
805 aa  471  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.86 
 
 
817 aa  466  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  37.1 
 
 
796 aa  452  1.0000000000000001e-126  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  37.64 
 
 
805 aa  440  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.41 
 
 
822 aa  435  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  34.26 
 
 
821 aa  427  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  37.47 
 
 
803 aa  413  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.36 
 
 
883 aa  411  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  33 
 
 
802 aa  411  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  34.39 
 
 
831 aa  410  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.88 
 
 
878 aa  408  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.87 
 
 
807 aa  405  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  34.96 
 
 
809 aa  405  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  34.76 
 
 
804 aa  401  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  35.1 
 
 
800 aa  397  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.93 
 
 
807 aa  397  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.91 
 
 
809 aa  398  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.55 
 
 
862 aa  393  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  34.32 
 
 
798 aa  391  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.13 
 
 
805 aa  388  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.53 
 
 
879 aa  385  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  34.83 
 
 
808 aa  378  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  34.07 
 
 
811 aa  370  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  34.07 
 
 
804 aa  370  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  32.53 
 
 
809 aa  370  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.84 
 
 
805 aa  369  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  31.94 
 
 
797 aa  363  1e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  31.05 
 
 
865 aa  362  2e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.76 
 
 
816 aa  358  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  31.03 
 
 
845 aa  358  2.9999999999999997e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.91 
 
 
805 aa  356  1e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.09 
 
 
893 aa  355  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.37 
 
 
821 aa  353  7e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  32.27 
 
 
810 aa  353  8e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  35.21 
 
 
808 aa  351  3e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  32.45 
 
 
816 aa  351  3e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.11 
 
 
808 aa  350  1e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  32.03 
 
 
805 aa  345  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.66 
 
 
915 aa  344  4e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.06 
 
 
812 aa  341  5e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  35.52 
 
 
808 aa  339  9.999999999999999e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  31.38 
 
 
887 aa  339  9.999999999999999e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  31.69 
 
 
817 aa  335  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  31.92 
 
 
803 aa  332  2e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  34.23 
 
 
806 aa  329  1.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.32 
 
 
810 aa  326  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  31.67 
 
 
819 aa  318  3e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.98 
 
 
844 aa  317  5e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  31.03 
 
 
887 aa  317  6e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.1 
 
 
913 aa  313  6.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.04 
 
 
817 aa  312  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  32.48 
 
 
808 aa  313  1e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.17 
 
 
846 aa  306  8.000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.21 
 
 
874 aa  306  9.000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.63 
 
 
919 aa  304  5.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.63 
 
 
855 aa  302  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.43 
 
 
820 aa  300  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.6 
 
 
888 aa  298  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  32.32 
 
 
843 aa  296  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.94 
 
 
849 aa  296  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  30.85 
 
 
810 aa  294  4e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  32.57 
 
 
861 aa  294  5e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  30.77 
 
 
835 aa  278  4e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  29.08 
 
 
848 aa  268  2.9999999999999995e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  28.91 
 
 
803 aa  266  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.05 
 
 
880 aa  266  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.5 
 
 
884 aa  260  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  26.88 
 
 
810 aa  249  2e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  25.74 
 
 
813 aa  244  5e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  28.66 
 
 
844 aa  239  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  29.64 
 
 
819 aa  233  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  25.61 
 
 
809 aa  230  9e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  24.91 
 
 
810 aa  217  8e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.8 
 
 
828 aa  208  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  25.21 
 
 
807 aa  204  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  27.15 
 
 
931 aa  191  5e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4630  protein of unknown function DUF214  27.01 
 
 
816 aa  129  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  25.9 
 
 
805 aa  128  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4861  protein of unknown function DUF214  26.75 
 
 
798 aa  128  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0936  protein of unknown function DUF214  23.33 
 
 
793 aa  125  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146106  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4905  protein of unknown function DUF214  26.68 
 
 
798 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0532186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0931  protein of unknown function DUF214  25.32 
 
 
804 aa  123  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1120  protein of unknown function DUF214  25.09 
 
 
811 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00406203  normal  0.905875 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2247  protein of unknown function DUF214  24.61 
 
 
805 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4617  protein of unknown function DUF214  23.85 
 
 
792 aa  122  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.214222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  23.67 
 
 
805 aa  122  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0946  protein of unknown function DUF214  26.19 
 
 
811 aa  122  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0636154  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4857  protein of unknown function DUF214  23.45 
 
 
793 aa  120  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.586648  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4616  protein of unknown function DUF214  23.4 
 
 
807 aa  120  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.413807 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2089  protein of unknown function DUF214  22.12 
 
 
794 aa  120  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0140  protein of unknown function DUF214  24.46 
 
 
816 aa  119  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4614  protein of unknown function DUF214  24.18 
 
 
801 aa  115  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.122129 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4849  protein of unknown function DUF214  24.31 
 
 
802 aa  115  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.011256  normal  0.10572 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4594  protein of unknown function DUF214  25.09 
 
 
813 aa  115  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>