More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1993 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1993  exodeoxyribonuclease III (xth)  100 
 
 		 260 aa  541  1e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0563751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3018  exodeoxyribonuclease III Xth  49.03 
 
 		 261 aa  251  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176682  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2159  exodeoxyribonuclease III Xth  49.02 
 
 		 260 aa  249  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2758  exodeoxyribonuclease III  46.9 
 
 		 276 aa  245  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.30939 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3202  exodeoxyribonuclease III Xth  47.83 
 
 		 263 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.840556  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2804  exodeoxyribonuclease III  47.04 
 
 		 263 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.96481  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2122  exodeoxyribonuclease III  50.8 
 
 		 262 aa  241  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443475  normal  0.589868 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5283  exodeoxyribonuclease III Xth  46.85 
 
 		 269 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.974803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  45.14 
 
 		 262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  49.81 
 
 		 262 aa  239  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  45.38 
 
 		 261 aa  238  6.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.515839  normal  0.110771 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3456  exodeoxyribonuclease III Xth  48.24 
 
 		 303 aa  237  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1784  exodeoxyribonuclease III  47.74 
 
 		 266 aa  238  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.144543  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2061  exodeoxyribonuclease III (exonuclease III)  46.99 
 
 		 255 aa  237  1e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240867  normal  0.343531 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4438  exodeoxyribonuclease III  46.25 
 
 		 263 aa  236  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5986  exodeoxyribonuclease III Xth  47.49 
 
 		 270 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.294616 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2221  exodeoxyribonuclease III  47.88 
 
 		 270 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1402  exodeoxyribonuclease III  47.86 
 
 		 258 aa  235  4e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.632012 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0929  exodeoxyribonuclease III Xth  45.91 
 
 		 261 aa  235  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3378  exodeoxyribonuclease III Xth  45.49 
 
 		 259 aa  235  5.0000000000000005e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0851015 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1886  putative Exodeoxyribonuclease III  44.92 
 
 		 259 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0111436  normal  0.144129 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1964  exodeoxyribonuclease III Xth  44.09 
 
 		 258 aa  235  5.0000000000000005e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0747161  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0946  exodeoxyribonuclease III Xth  47.43 
 
 		 256 aa  234  8e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.416202  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2815  exodeoxyribonuclease III  44.36 
 
 		 261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0879261  normal  0.730816 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  45.14 
 
 		 267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0897  exodeoxyribonuclease III  44.15 
 
 		 268 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1683  exodeoxyribonuclease III  49.61 
 
 		 258 aa  231  6e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.122396 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1755  exodeoxyribonuclease III (xth)  44.75 
 
 		 266 aa  231  7.000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1195  exodeoxyribonuclease III Xth  45.7 
 
 		 259 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206462  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_004310  BR0873  exodeoxyribonuclease III  43.19 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0864  exodeoxyribonuclease III  43.19 
 
 		 279 aa  230  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  47.01 
 
 		 257 aa  229  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1810  exodeoxyribonuclease III xth  43.97 
 
 		 266 aa  229  3e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2898  exodeoxyribonuclease III  46.39 
 
 		 284 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.696489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2232  exodeoxyribonuclease III Xth  45.77 
 
 		 264 aa  227  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2668  exodeoxyribonuclease III Xth  47.06 
 
 		 260 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.276969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1386  exodeoxyribonuclease III Xth  45.1 
 
 		 263 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.031293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1315  exodeoxyribonuclease III  44.92 
 
 		 259 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3424  exodeoxyribonuclease III  45.1 
 
 		 272 aa  226  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.903718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1491  exodeoxyribonuclease III Xth  45.1 
 
 		 264 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.74554 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2657  exodeoxyribonuclease III  44.53 
 
 		 259 aa  225  6e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.107023  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4910  exodeoxyribonuclease III  45.17 
 
 		 283 aa  225  7e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.38033  decreased coverage  0.000445359 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1868  exodeoxyribonuclease III  45.49 
 
 		 264 aa  224  8e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0445089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4240  exodeoxyribonuclease III Xth  46.51 
 
 		 262 aa  224  9e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1911  exodeoxyribonuclease III Xth  45 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  0.517852 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3266  exodeoxyribonuclease III Xth  47.1 
 
 		 263 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1956  exodeoxyribonuclease III Xth  45 
 
 		 264 aa  223  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0751549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2700  exodeoxyribonuclease III Xth  47.1 
 
 		 270 aa  223  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3010  exodeoxyribonuclease III Xth  45.49 
 
 		 265 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1085  exodeoxyribonuclease III  46.09 
 
 		 259 aa  221  6e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.647883  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2355  exodeoxyribonuclease III Xth  42.15 
 
 		 260 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.936665  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0156  exodeoxyribonuclease III  46.27 
 
 		 259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3045  exodeoxyribonuclease III  45.49 
 
 		 265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0213415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1920  exodeoxyribonuclease III  45.7 
 
 		 262 aa  218  5e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.19654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3799  exodeoxyribonuclease III  45.49 
 
 		 256 aa  218  6e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2707  exodeoxyribonuclease III, putative  45.1 
 
 		 265 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3728  exodeoxyribonuclease III Xth  45.1 
 
 		 256 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4299  exodeoxyribonuclease III Xth  44.71 
 
 		 257 aa  215  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.231101  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0877  exodeoxyribonuclease III Xth  43.7 
 
 		 264 aa  214  8e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278743 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5537  exodeoxyribonuclease III Xth  44.71 
 
 		 308 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3068  exodeoxyribonuclease III Xth  45.1 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.504533 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  45.42 
 
 		 258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  45.42 
 
 		 258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  45.42 
 
 		 258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0921  exodeoxyribonuclease III  44.31 
 
 		 261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  45.42 
 
 		 258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  45.42 
 
 		 258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2921  exodeoxyribonuclease III Xth  46.15 
 
 		 264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  45.42 
 
 		 258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  45.21 
 
 		 258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1964  exodeoxyribonuclease III Xth  45.6 
 
 		 260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  45.42 
 
 		 322 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  44.44 
 
 		 265 aa  212  3.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09930  putative exonuclease III  44.31 
 
 		 266 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0994533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1460  exodeoxyribonuclease III Xth  45.88 
 
 		 254 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178949  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1479  exodeoxyribonuclease III Xth  43.97 
 
 		 263 aa  211  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688806 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0579  exodeoxyribonuclease III (xth)  43.92 
 
 		 274 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1677  exodeoxyribonuclease III Xth  43.97 
 
 		 263 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2071  exodeoxyribonuclease III  43.58 
 
 		 256 aa  210  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.663777 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  44.66 
 
 		 256 aa  209  3e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0172  exodeoxyribonuclease III  43.48 
 
 		 255 aa  209  3e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000298085 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5112  exodeoxyribonuclease III  43.46 
 
 		 260 aa  209  3e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.130446  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3423  exodeoxyribonuclease III  45.02 
 
 		 255 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1207  exodeoxyribonuclease III (xth)  43.75 
 
 		 256 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2680  exonuclease III  43.14 
 
 		 264 aa  208  7e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112967  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  43.08 
 
 		 255 aa  208  8e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1154  exodeoxyribonuclease III Xth  41.63 
 
 		 263 aa  208  9e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.311062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  42.15 
 
 		 262 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  42.15 
 
 		 262 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2180  exodeoxyribonuclease III (xth)  44.8 
 
 		 256 aa  207  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  44.66 
 
 		 277 aa  206  4e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  43.08 
 
 		 267 aa  205  5e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3911  exodeoxyribonuclease III  42.97 
 
 		 271 aa  205  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  43.7 
 
 		 254 aa  204  9e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  41.63 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2776  exodeoxyribonuclease III Xth  42.91 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1126  exodeoxyribonuclease III Xth  43.41 
 
 		 272 aa  203  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00222533  normal  0.38819 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  40.94 
 
 		 256 aa  202  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0692  exodeoxyribonuclease III  39.3 
 
 		 263 aa  202  3e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000190547  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0660  exodeoxyribonuclease III  39.3 
 
 		 263 aa  202  3e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000969043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>