More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1933 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  100 
 
 		 805 aa  1609    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.66 
 
 		 807 aa  473  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  36.06 
 
 		 821 aa  470  1.0000000000000001e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  36.12 
 
 		 869 aa  456  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.97 
 
 		 813 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  35.02 
 
 		 814 aa  442  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.46 
 
 		 823 aa  437  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  37.48 
 
 		 871 aa  435  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.53 
 
 		 817 aa  431  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.69 
 
 		 822 aa  428  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  34.62 
 
 		 796 aa  410  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  32.8 
 
 		 797 aa  404  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.81 
 
 		 805 aa  402  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.25 
 
 		 862 aa  402  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.13 
 
 		 882 aa  397  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  35.23 
 
 		 809 aa  394  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.47 
 
 		 809 aa  394  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.71 
 
 		 816 aa  380  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.01 
 
 		 805 aa  382  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  34.26 
 
 		 805 aa  377  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.6 
 
 		 807 aa  375  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  31.67 
 
 		 802 aa  373  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  33.62 
 
 		 803 aa  358  1.9999999999999998e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  31.34 
 
 		 831 aa  357  5.999999999999999e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.47 
 
 		 805 aa  355  1e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.52 
 
 		 893 aa  346  1e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.52 
 
 		 808 aa  343  5.999999999999999e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  31.79 
 
 		 804 aa  343  9e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  33.86 
 
 		 800 aa  341  2.9999999999999998e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31 
 
 		 874 aa  340  5.9999999999999996e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.71 
 
 		 915 aa  340  7e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  32.76 
 
 		 819 aa  335  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  32.28 
 
 		 808 aa  333  9e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  32.18 
 
 		 817 aa  330  8e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  31.45 
 
 		 798 aa  327  5e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.92 
 
 		 812 aa  324  5e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.36 
 
 		 879 aa  321  3e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.95 
 
 		 821 aa  320  9e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  30.34 
 
 		 809 aa  318  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  32.25 
 
 		 804 aa  314  2.9999999999999996e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.84 
 
 		 913 aa  313  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.89 
 
 		 878 aa  311  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  31.15 
 
 		 887 aa  311  4e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  30.3 
 
 		 805 aa  310  5.9999999999999995e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  30.4 
 
 		 808 aa  307  6e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  27.76 
 
 		 845 aa  307  6e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  30.48 
 
 		 865 aa  306  8.000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.38 
 
 		 849 aa  306  8.000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.83 
 
 		 820 aa  304  4.0000000000000003e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  32.48 
 
 		 808 aa  302  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  28.95 
 
 		 803 aa  301  4e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.94 
 
 		 855 aa  300  6e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.28 
 
 		 810 aa  300  8e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  29.58 
 
 		 810 aa  299  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.77 
 
 		 883 aa  298  3e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  29.09 
 
 		 803 aa  298  3e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  33.05 
 
 		 808 aa  297  6e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.15 
 
 		 817 aa  292  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  30.22 
 
 		 816 aa  291  4e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.81 
 
 		 844 aa  288  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  30.73 
 
 		 887 aa  288  2.9999999999999996e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  31.93 
 
 		 806 aa  288  2.9999999999999996e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  29.61 
 
 		 843 aa  281  3e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  30.67 
 
 		 811 aa  280  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  31.4 
 
 		 810 aa  276  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.63 
 
 		 919 aa  274  5.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  30.47 
 
 		 835 aa  263  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  26.41 
 
 		 813 aa  262  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.77 
 
 		 888 aa  261  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.1 
 
 		 884 aa  261  4e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  26.9 
 
 		 809 aa  254  3e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  31.19 
 
 		 848 aa  251  4e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.59 
 
 		 846 aa  249  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.92 
 
 		 880 aa  243  9e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  28.93 
 
 		 844 aa  241  5.999999999999999e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  30.12 
 
 		 861 aa  236  9e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  26.11 
 
 		 810 aa  235  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  25.27 
 
 		 810 aa  229  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  28.43 
 
 		 819 aa  219  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.5 
 
 		 828 aa  212  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  29.35 
 
 		 931 aa  204  5e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  24.41 
 
 		 807 aa  190  7e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2978  protein of unknown function DUF214  23.33 
 
 		 788 aa  157  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2178  protein of unknown function DUF214  24.88 
 
 		 790 aa  156  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.424889 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4594  protein of unknown function DUF214  26.04 
 
 		 813 aa  150  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4840  protein of unknown function DUF214  24.4 
 
 		 810 aa  145  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.259968 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5420  protein of unknown function DUF214  23.43 
 
 		 784 aa  138  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0066196  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0140  protein of unknown function DUF214  23.57 
 
 		 816 aa  136  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4905  protein of unknown function DUF214  24.68 
 
 		 798 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0532186 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4368  protein of unknown function DUF214  23.25 
 
 		 800 aa  131  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.129517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  23.63 
 
 		 795 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  22.52 
 
 		 770 aa  128  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2744  protein of unknown function DUF214  23.47 
 
 		 799 aa  128  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4844  protein of unknown function DUF214  23.72 
 
 		 793 aa  127  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357668  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1120  protein of unknown function DUF214  23.99 
 
 		 811 aa  127  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00406203  normal  0.905875 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4591  protein of unknown function DUF214  23.22 
 
 		 795 aa  127  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0603  protein of unknown function DUF214  24.16 
 
 		 809 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.237353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1753  protein of unknown function DUF214  23.54 
 
 		 801 aa  125  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  24.57 
 
 		 805 aa  124  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0957  protein of unknown function DUF214  23.95 
 
 		 785 aa  124  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439448  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>