More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1834 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  100 
 
 		 418 aa  838    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  44.92 
 
 		 413 aa  331  1e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  45.19 
 
 		 413 aa  331  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  44.57 
 
 		 413 aa  293  5e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  42.63 
 
 		 416 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  38.24 
 
 		 405 aa  259  5.0000000000000005e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 		 426 aa  257  3e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  35.24 
 
 		 426 aa  256  7e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  35.24 
 
 		 426 aa  255  9e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  33.61 
 
 		 405 aa  162  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 434 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 447 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 448 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  31.08 
 
 		 433 aa  150  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 423 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 443 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 453 aa  144  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 426 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 		 427 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 		 427 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 444 aa  140  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 438 aa  139  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  28.07 
 
 		 440 aa  137  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 430 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  30.5 
 
 		 452 aa  135  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 441 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3034  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.201695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 433 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 472 aa  127  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 506 aa  127  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 438 aa  126  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 467 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 470 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 468 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 467 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 465 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2598  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 		 420 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 465 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  27.34 
 
 		 475 aa  122  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 438 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 418 aa  121  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 464 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  31.39 
 
 		 450 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 442 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1726  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 421 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 464 aa  120  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 441 aa  120  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 461 aa  120  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 443 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  32.47 
 
 		 422 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 426 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  30.04 
 
 		 479 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 490 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  30.22 
 
 		 471 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  28.67 
 
 		 449 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4843  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 442 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000178164  normal  0.0122394 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 461 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  28 
 
 		 442 aa  114  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1588  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 442 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1607  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 442 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164124 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 		 413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  27.51 
 
 		 457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  24.78 
 
 		 422 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  27.13 
 
 		 457 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  28.15 
 
 		 448 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6357  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 441 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  28.23 
 
 		 440 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1442  major facilitator family transporter  27.25 
 
 		 441 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3102  major facilitator family transporter  26.98 
 
 		 441 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 451 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2045  major facilitator family transporter  27.25 
 
 		 441 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2335  major facilitator family transporter  27.25 
 
 		 441 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1353  major facilitator family transporter  27.25 
 
 		 441 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 578 aa  107  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1068  major facilitator family transporter  27.25 
 
 		 441 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  28.11 
 
 		 437 aa  106  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  23.59 
 
 		 416 aa  105  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2132  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 440 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367768  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 449 aa  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 407 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 443 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1145  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 436 aa  104  4e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.667647  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 440 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4054  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 437 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0519542 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 		 478 aa  103  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3254  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 		 416 aa  103  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.254674  normal  0.0467898 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3962  major facilitator transporter  24.3 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 435 aa  102  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 441 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 542 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6228  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 450 aa  101  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  24.27 
 
 		 454 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  25 
 
 		 424 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 451 aa  99.4  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 850 aa  98.2  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  26.08 
 
 		 443 aa  97.8  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 453 aa  97.4  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>