More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1826 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  100 
 
 
426 aa  867    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  52.32 
 
 
445 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  46.41 
 
 
444 aa  345  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  44.47 
 
 
405 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  44.58 
 
 
430 aa  322  5e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  46.42 
 
 
459 aa  316  6e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  43.9 
 
 
438 aa  315  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  43.41 
 
 
441 aa  312  9e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  42.37 
 
 
431 aa  310  2e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  45.22 
 
 
440 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  43.94 
 
 
433 aa  306  5.0000000000000004e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  43.53 
 
 
432 aa  301  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  40.37 
 
 
430 aa  299  5e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  39.16 
 
 
431 aa  296  6e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  41.84 
 
 
428 aa  292  6e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  44.12 
 
 
433 aa  292  7e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  40.93 
 
 
455 aa  291  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  41.3 
 
 
426 aa  288  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  43.83 
 
 
419 aa  285  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  43.86 
 
 
402 aa  283  4.0000000000000003e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  40.19 
 
 
423 aa  281  1e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  40.74 
 
 
426 aa  281  2e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  40.1 
 
 
429 aa  280  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  41.79 
 
 
424 aa  279  7e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  40.39 
 
 
412 aa  278  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  42.42 
 
 
428 aa  277  2e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  40.79 
 
 
437 aa  277  3e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  40.61 
 
 
422 aa  276  5e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  39.81 
 
 
414 aa  272  8.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  40.55 
 
 
434 aa  268  1e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  41.11 
 
 
433 aa  268  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  41.02 
 
 
421 aa  268  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  41.48 
 
 
402 aa  268  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  41.3 
 
 
444 aa  267  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  39.56 
 
 
411 aa  266  7e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  39.17 
 
 
408 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  39.17 
 
 
408 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  39.17 
 
 
408 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  40.53 
 
 
417 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  40.53 
 
 
417 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  40.53 
 
 
417 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  41.55 
 
 
426 aa  260  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  40.69 
 
 
403 aa  259  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  41.08 
 
 
404 aa  259  8e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  37.73 
 
 
407 aa  257  3e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  38.69 
 
 
421 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  41.58 
 
 
423 aa  250  3e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  39.07 
 
 
407 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  37.59 
 
 
407 aa  238  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  37 
 
 
444 aa  235  9e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  37.9 
 
 
421 aa  229  5e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  37.01 
 
 
405 aa  225  9e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  35.93 
 
 
417 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  36.39 
 
 
401 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  36.15 
 
 
443 aa  217  4e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  35.31 
 
 
419 aa  215  9e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  34.04 
 
 
470 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  35.76 
 
 
480 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  33.96 
 
 
436 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  34.09 
 
 
409 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  35 
 
 
416 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  35.42 
 
 
425 aa  213  7e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  33.9 
 
 
408 aa  212  9e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  34.62 
 
 
419 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  37.77 
 
 
432 aa  208  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2932  amidohydrolase  34.02 
 
 
431 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  33.33 
 
 
413 aa  206  7e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  33.65 
 
 
445 aa  205  1e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  32.94 
 
 
413 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  34.16 
 
 
407 aa  202  9.999999999999999e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  35.71 
 
 
415 aa  202  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  33.1 
 
 
420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  32.7 
 
 
413 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  35.05 
 
 
423 aa  200  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  35.82 
 
 
403 aa  199  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  34.15 
 
 
412 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  33.82 
 
 
411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  34.09 
 
 
410 aa  198  1.0000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  33.18 
 
 
426 aa  197  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  33.17 
 
 
413 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  34.29 
 
 
413 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  35.75 
 
 
415 aa  196  8.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  33 
 
 
391 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  34.86 
 
 
411 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  30.14 
 
 
413 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  33.67 
 
 
400 aa  191  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  32.45 
 
 
414 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  36.46 
 
 
408 aa  186  8e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  33.09 
 
 
409 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  31.8 
 
 
432 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  35.93 
 
 
409 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  35.93 
 
 
409 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  35.93 
 
 
409 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  32.92 
 
 
391 aa  183  6e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  32.38 
 
 
418 aa  182  7e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5218  amidohydrolase  36.66 
 
 
393 aa  182  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.392557  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  32.94 
 
 
456 aa  182  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  29.48 
 
 
412 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  32.38 
 
 
405 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  34.61 
 
 
461 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>