More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1819 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
323 aa  674    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  54.58 
 
 
315 aa  349  3e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  57.48 
 
 
309 aa  348  7e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4159  ornithine carbamoyltransferase  56.67 
 
 
338 aa  348  9e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171177  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  55.3 
 
 
314 aa  345  8e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  54.13 
 
 
312 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  54.64 
 
 
313 aa  342  5.999999999999999e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  55.05 
 
 
313 aa  333  2e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  53.27 
 
 
320 aa  333  3e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  53.16 
 
 
307 aa  330  1e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  54.43 
 
 
306 aa  330  1e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  54.72 
 
 
313 aa  328  8e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  52.23 
 
 
305 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  54.64 
 
 
309 aa  324  1e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  52.84 
 
 
309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  51.16 
 
 
316 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  50.99 
 
 
316 aa  318  5e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  52.32 
 
 
312 aa  318  1e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  50.66 
 
 
316 aa  317  2e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  50.66 
 
 
316 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2889  ornithine carbamoyltransferase  53.64 
 
 
317 aa  316  3e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  50.66 
 
 
316 aa  316  4e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1176  ornithine carbamoyltransferase  51.64 
 
 
311 aa  315  5e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  50.66 
 
 
316 aa  315  7e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1394  ornithine carbamoyltransferase  51.32 
 
 
311 aa  314  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.819554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  50.66 
 
 
316 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0794  ornithine carbamoyltransferase  51.66 
 
 
313 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
316 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1203  ornithine carbamoyltransferase  51.33 
 
 
317 aa  312  4.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0366728  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
316 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 
316 aa  311  6.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  54.79 
 
 
312 aa  309  4e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3171  ornithine carbamoyltransferase  50.81 
 
 
340 aa  308  9e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 
303 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  49.51 
 
 
303 aa  305  6e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  52.01 
 
 
308 aa  305  6e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 
303 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  49.03 
 
 
355 aa  304  1.0000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  48.84 
 
 
302 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
305 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  48.01 
 
 
304 aa  301  1e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28754  Ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 
312 aa  300  2e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  48.5 
 
 
301 aa  300  3e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  49.35 
 
 
305 aa  299  5e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  49 
 
 
316 aa  299  6e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  46.69 
 
 
309 aa  295  5e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  48.37 
 
 
300 aa  294  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16811  ornithine carbamoyltransferase  48.82 
 
 
318 aa  293  2e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1741  ornithine carbamoyltransferase  50.32 
 
 
317 aa  293  4e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  46.53 
 
 
303 aa  293  4e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  47.35 
 
 
305 aa  291  7e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
312 aa  291  7e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25590  ornithine carbamoyltransferase  50.16 
 
 
309 aa  291  7e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  46.53 
 
 
303 aa  291  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1048  ornithine carbamoyltransferase  44.22 
 
 
316 aa  291  1e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  46.86 
 
 
303 aa  290  2e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  48.34 
 
 
302 aa  290  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3903  ornithine carbamoyltransferase  48.99 
 
 
301 aa  290  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.394712 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 
312 aa  290  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3707  ornithine carbamoyltransferase  48.99 
 
 
301 aa  290  3e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  49.35 
 
 
312 aa  290  3e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0193  ornithine carbamoyltransferase  48.49 
 
 
301 aa  289  4e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0354  ornithine carbamoyltransferase  47.64 
 
 
304 aa  288  6e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.140894  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0238  ornithine carbamoyltransferase  48.66 
 
 
301 aa  288  7e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1234  ornithine carbamoyltransferase  48.67 
 
 
304 aa  288  8e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.011055  normal  0.156338 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3715  ornithine carbamoyltransferase  48.99 
 
 
301 aa  288  9e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.523544  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
311 aa  288  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0829  ornithine carbamoyltransferase  48.15 
 
 
318 aa  287  1e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  46.18 
 
 
302 aa  288  1e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2837  ornithine carbamoyltransferase  48.5 
 
 
307 aa  287  1e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.10311  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
311 aa  288  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0008  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 
302 aa  288  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  48.53 
 
 
312 aa  287  2e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0182  ornithine carbamoyltransferase  45.25 
 
 
305 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.533049  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4127  ornithine carbamoyltransferase  49 
 
 
312 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239827  hitchhiker  0.0000294127 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  47.71 
 
 
312 aa  286  2.9999999999999996e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1046  ornithine carbamoyltransferase  45.19 
 
 
330 aa  286  4e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0258  ornithine carbamoyltransferase  48.83 
 
 
301 aa  286  5e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0277  ornithine carbamoyltransferase  48.32 
 
 
301 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0704  ornithine carbamoyltransferase  47.54 
 
 
332 aa  285  1.0000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1291  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 
310 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0246  ornithine carbamoyltransferase  47.14 
 
 
298 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0128  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 
303 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2810  ornithine carbamoyltransferase  48.68 
 
 
313 aa  284  2.0000000000000002e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0741916 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1605  ornithine carbamoyltransferase  48.85 
 
 
307 aa  283  3.0000000000000004e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.416404 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3007  ornithine carbamoyltransferase  46.67 
 
 
309 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3057  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 
315 aa  282  5.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00484569  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  48.5 
 
 
323 aa  282  5.000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  48.37 
 
 
321 aa  282  5.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2968  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 
307 aa  282  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59447  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3112  ornithine carbamoyltransferase  46.67 
 
 
309 aa  282  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3012  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 
307 aa  282  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.296238  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11674  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 
307 aa  281  7.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.25899e-16  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0479  ornithine carbamoyltransferase  49.49 
 
 
305 aa  281  7.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1497  ornithine carbamoyltransferase  48.49 
 
 
297 aa  281  7.000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.651165  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2983  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 
307 aa  281  8.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.886443  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4012  ornithine carbamoyltransferase  47.99 
 
 
301 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.875127 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5258  ornithine carbamoyltransferase  48.32 
 
 
309 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2946  ornithine carbamoyltransferase  48.01 
 
 
313 aa  281  1e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4122  ornithine carbamoyltransferase  47.99 
 
 
301 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>