More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1749 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  100 
 
 
264 aa  545  1e-154  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  43.4 
 
 
255 aa  198  9e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  37.45 
 
 
246 aa  162  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0277  methyltransferase type 11  43.21 
 
 
244 aa  150  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  36.17 
 
 
268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  30 
 
 
263 aa  132  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  30.6 
 
 
263 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  30.6 
 
 
263 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  30.6 
 
 
263 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  32.47 
 
 
258 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  30.98 
 
 
263 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000802206  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  35.68 
 
 
268 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0112  Methyltransferase type 11  25.77 
 
 
258 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.387929 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  29.83 
 
 
262 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.17 
 
 
257 aa  94  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  28.79 
 
 
258 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 
264 aa  92.8  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 
337 aa  90.5  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  29.28 
 
 
258 aa  89.4  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.14 
 
 
260 aa  88.2  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  30.22 
 
 
251 aa  88.6  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.17 
 
 
259 aa  87  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  28.78 
 
 
259 aa  86.7  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  30.8 
 
 
251 aa  86.7  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.27 
 
 
253 aa  86.7  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  27.36 
 
 
252 aa  85.9  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4335  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.78 
 
 
254 aa  85.5  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  32.16 
 
 
258 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  29.8 
 
 
254 aa  85.5  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  31.74 
 
 
267 aa  84  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  31.1 
 
 
262 aa  84.3  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 
253 aa  84  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  28.65 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  36.55 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.84 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.86 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.86 
 
 
258 aa  82  0.000000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  23.6 
 
 
263 aa  82  0.000000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  32.06 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2136  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.85 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000208135  decreased coverage  0.00294275 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.15 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  27.51 
 
 
259 aa  80.1  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3451  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.4 
 
 
256 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2149  Methyltransferase type 11  28.5 
 
 
260 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  29.94 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2673  trans-aconitate methyltransferase  33.59 
 
 
280 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.09 
 
 
258 aa  77  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1621  trans-aconitate methyltransferase  34.38 
 
 
344 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898496  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4126  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.94 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01476  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2127  Trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01487  hypothetical protein  33.33 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2139  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  41.74 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2132  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.58 
 
 
252 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523623  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.58 
 
 
252 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.335531  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2075  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.09 
 
 
287 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.864232  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  38.52 
 
 
294 aa  75.1  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3885  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2425  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.68 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.576064 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1601  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.58 
 
 
252 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.767111  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  31.71 
 
 
269 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0608  Trans-aconitate 2-methyltransferase  27.27 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2430  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.85 
 
 
268 aa  72.4  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2481  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.82 
 
 
256 aa  72  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0101749  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17170  trans-aconitate methyltransferase  27.35 
 
 
255 aa  72  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00821566  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1653  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.82 
 
 
252 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.217982  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1498  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.27 
 
 
258 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.87545e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2909  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.06 
 
 
256 aa  72  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0465109  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6020  Trans-aconitate 2-methyltransferase  22.76 
 
 
252 aa  70.5  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4146  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.65 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4057  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.65 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4175  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.65 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4354  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.65 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.556022  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1922  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.11 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.146762  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.57 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4305  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.65 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  30.87 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5274  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.65 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.123369  normal  0.211011 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4216  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.65 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227535 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  31.58 
 
 
292 aa  70.1  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0992  Trans-aconitate 2-methyltransferase  26.17 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  30.87 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1770  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.62 
 
 
258 aa  70.5  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480921  hitchhiker  0.00972565 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.57 
 
 
258 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2432  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.22 
 
 
260 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1603  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.62 
 
 
258 aa  70.5  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.463552  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1690  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.78 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00892197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8614  Trans-aconitate 2-methyltransferase  32.09 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  30.71 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1261  hypothetical protein  27.13 
 
 
250 aa  69.7  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1455  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.32 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1136  Methyltransferase type 11  22.8 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.224282  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1410  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.32 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5169  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.09 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2412  Methyltransferase type 11  35.64 
 
 
240 aa  69.3  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.125357  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2996  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.43 
 
 
254 aa  69.3  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  30.08 
 
 
269 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2668  hypothetical protein  24.9 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>