298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1746 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  100 
 
 		 316 aa  652    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  33.87 
 
 		 309 aa  186  6e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  31.95 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  35.74 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  36.54 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  33.44 
 
 		 311 aa  172  6.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  35.76 
 
 		 337 aa  171  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  30.99 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  33.99 
 
 		 324 aa  170  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  33.11 
 
 		 309 aa  169  8e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  33.66 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  33 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  32.89 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  33.22 
 
 		 277 aa  155  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  35.42 
 
 		 310 aa  155  9e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2441  Phytoene synthase  35 
 
 		 289 aa  154  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.214033  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  35.44 
 
 		 293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  35.44 
 
 		 280 aa  152  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2244  Phytoene synthase  30.36 
 
 		 303 aa  150  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  35.1 
 
 		 288 aa  149  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  35.12 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  33.33 
 
 		 279 aa  147  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  33.33 
 
 		 279 aa  147  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  34.23 
 
 		 285 aa  146  5e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  33.33 
 
 		 280 aa  145  7.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  33.22 
 
 		 277 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  33.12 
 
 		 300 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  32.09 
 
 		 278 aa  145  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  34.04 
 
 		 279 aa  143  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  30.7 
 
 		 308 aa  139  7e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13432  phytoene synthase phyA  31.74 
 
 		 302 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  30.52 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0026  squalene/phytoene synthase  33.33 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3828  Phytoene synthase  30.62 
 
 		 299 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.597595  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  30.33 
 
 		 313 aa  135  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  33.67 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  33.01 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6667  squalene synthase HpnD  31.92 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  29.51 
 
 		 310 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0820  squalene/phytoene synthase  31.63 
 
 		 304 aa  133  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  32.76 
 
 		 303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  30.65 
 
 		 332 aa  132  6.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  29.18 
 
 		 310 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2501  Phytoene synthase  30.59 
 
 		 293 aa  132  9e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000012826  normal  0.0149177 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1456  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  32.63 
 
 		 286 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1549  squalene/phytoene synthase  33.68 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2572  squalene synthase HpnD  32.98 
 
 		 281 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  32.62 
 
 		 278 aa  130  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  27.16 
 
 		 312 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  28.57 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  27.85 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  27.71 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  27.85 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  28.76 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  29.45 
 
 		 302 aa  125  7e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2842  squalene/phytoene synthase  33.33 
 
 		 338 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5132  squalene/phytoene synthase  28.57 
 
 		 326 aa  125  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126114  normal  0.060719 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  29.47 
 
 		 312 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  29.97 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2442  squalene synthase HpnC  30.13 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.337802  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2819  Phytoene synthase  33.33 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  28.03 
 
 		 310 aa  124  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  29.47 
 
 		 312 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1042  squalene/phytoene synthase  28.37 
 
 		 286 aa  123  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.100807  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_56481  phytoene synthase  30.25 
 
 		 505 aa  122  7e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1371  squalene/phytoene synthase  31.86 
 
 		 302 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  28.62 
 
 		 302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  28.03 
 
 		 313 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5076  phytoene synthase  29.49 
 
 		 316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5164  phytoene synthase  29.49 
 
 		 316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  26.02 
 
 		 325 aa  119  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5455  phytoene synthase  29.49 
 
 		 316 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0351935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  30.1 
 
 		 281 aa  116  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3572  Phytoene synthase  28.29 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.873206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  28.66 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3405  squalene synthase HpnC  26.3 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151553  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2267  Squalene/phytoene synthase  30.13 
 
 		 292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3811  Squalene/phytoene synthase  28.17 
 
 		 310 aa  113  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3241  squalene synthase HpnD  29.43 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154532 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3735  squalene/phytoene synthase  29.35 
 
 		 351 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0802479 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1745  squalene/phytoene synthase  26.52 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1579  squalene/phytoene synthase  30.35 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212502  normal  0.0425272 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1700  Squalene/phytoene synthase  28.91 
 
 		 355 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.898001  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1383  phytoene synthase  30.19 
 
 		 339 aa  110  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.244204  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0494  phytoene synthase  29.79 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1287  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  33.78 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.200444  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1262  squalene/phytoene synthase  29.97 
 
 		 348 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.238367  normal  0.0709995 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26420  phytoene synthase  27.33 
 
 		 321 aa  106  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4010  squalene/phytoene synthase  28.23 
 
 		 349 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  hitchhiker  0.005496 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0306  squalene/phytoene synthase  27.49 
 
 		 288 aa  106  6e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23120  squalene synthase HpnC  28.41 
 
 		 300 aa  105  9e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47471  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2212  Phytoene synthase  29.41 
 
 		 333 aa  105  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3509  phytoene synthase  30.67 
 
 		 361 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0010  putative squalene/phytoene synthase  29.51 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6668  squalene synthase HpnC  29.49 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3173  squalene synthase HpnD  28.82 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3765  squalene/phytoene synthase  28.23 
 
 		 349 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.142197  hitchhiker  0.00585073 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7144  squalene synthase HpnD  28.93 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0469  Squalene/phytoene synthase  27.72 
 
 		 294 aa  103  4e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3578  squalene/phytoene synthase  29.87 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270096  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>