More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1702 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  100 
 
 		 331 aa  681    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  55.15 
 
 		 354 aa  376  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  54.98 
 
 		 327 aa  372  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  56.1 
 
 		 328 aa  369  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1509  UDP-glucose 4-epimerase  55.49 
 
 		 326 aa  365  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0386563  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  54.98 
 
 		 328 aa  361  9e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2654  UDP-glucose 4-epimerase  54.57 
 
 		 329 aa  361  1e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.933262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  54.41 
 
 		 328 aa  360  2e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1771  UDP-glucose 4-epimerase  52.74 
 
 		 328 aa  358  6e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333176  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  53.17 
 
 		 331 aa  356  2.9999999999999997e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  53.8 
 
 		 328 aa  356  3.9999999999999996e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  53.99 
 
 		 328 aa  353  2e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  56.7 
 
 		 324 aa  352  7e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  52.89 
 
 		 329 aa  348  6e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  51.68 
 
 		 327 aa  348  7e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  52.13 
 
 		 334 aa  347  1e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2693  UDP-glucose 4-epimerase  52.89 
 
 		 327 aa  345  5e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212619  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  52.89 
 
 		 334 aa  345  7e-94  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  54.83 
 
 		 332 aa  343  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  54.71 
 
 		 329 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  53.35 
 
 		 328 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  50.91 
 
 		 351 aa  342  5e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  51.67 
 
 		 328 aa  341  9e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  52.65 
 
 		 337 aa  340  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  53.03 
 
 		 330 aa  340  1e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  48.34 
 
 		 330 aa  340  2e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  54.01 
 
 		 332 aa  339  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  52.91 
 
 		 332 aa  339  4e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  52.34 
 
 		 337 aa  339  5e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  52.42 
 
 		 333 aa  335  5e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  52.12 
 
 		 332 aa  334  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  50 
 
 		 330 aa  333  3e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  49.55 
 
 		 332 aa  332  4e-90  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  49.85 
 
 		 331 aa  330  3e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  51.52 
 
 		 332 aa  329  4e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  51.35 
 
 		 333 aa  329  4e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  48.77 
 
 		 328 aa  329  5.0000000000000004e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  55.35 
 
 		 319 aa  326  3e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  50.91 
 
 		 333 aa  325  8.000000000000001e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  51.85 
 
 		 329 aa  325  9e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  49.54 
 
 		 325 aa  324  1e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  48.93 
 
 		 330 aa  323  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  48.93 
 
 		 330 aa  323  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  48.93 
 
 		 330 aa  323  2e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  48.93 
 
 		 330 aa  323  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  48.93 
 
 		 330 aa  323  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  48.93 
 
 		 330 aa  323  3e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  48.62 
 
 		 330 aa  323  3e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  48.93 
 
 		 330 aa  322  4e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  49.53 
 
 		 321 aa  322  5e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  52.48 
 
 		 320 aa  322  6e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  53.63 
 
 		 316 aa  321  9.000000000000001e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  51.83 
 
 		 328 aa  320  3e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  48.94 
 
 		 330 aa  320  3e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  51.55 
 
 		 323 aa  320  3e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  47.29 
 
 		 330 aa  319  3.9999999999999996e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  47.29 
 
 		 330 aa  319  3.9999999999999996e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  49.7 
 
 		 330 aa  319  3.9999999999999996e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  48.29 
 
 		 326 aa  318  7.999999999999999e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  52.32 
 
 		 318 aa  317  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  49.85 
 
 		 328 aa  316  4e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  48.9 
 
 		 324 aa  315  8e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  48.49 
 
 		 326 aa  314  9.999999999999999e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  52.73 
 
 		 332 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  48.61 
 
 		 326 aa  313  2.9999999999999996e-84  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  47.15 
 
 		 334 aa  313  2.9999999999999996e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  50.77 
 
 		 323 aa  311  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1261  UDP-glucose 4-epimerase  52.8 
 
 		 321 aa  311  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  46.48 
 
 		 328 aa  309  5e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  51.52 
 
 		 337 aa  307  1.0000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  52.02 
 
 		 350 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  50.15 
 
 		 332 aa  306  2.0000000000000002e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  49.38 
 
 		 327 aa  306  3e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  51.88 
 
 		 331 aa  305  6e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  51.54 
 
 		 327 aa  305  9.000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  49.22 
 
 		 324 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27520  UDP-galactose 4-epimerase  51.41 
 
 		 321 aa  302  5.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  48.33 
 
 		 327 aa  301  9e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 		 327 aa  300  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  47.27 
 
 		 329 aa  299  4e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  51.39 
 
 		 331 aa  298  1e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  48.9 
 
 		 329 aa  297  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  50.16 
 
 		 330 aa  295  5e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  46.93 
 
 		 320 aa  295  7e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  48.28 
 
 		 329 aa  294  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4903  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 320 aa  294  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.027411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1597  UDP-glucose 4-epimerase  48.29 
 
 		 337 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.903427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  51.74 
 
 		 329 aa  295  1e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18321  UDP-glucose 4-epimerase  45.54 
 
 		 348 aa  295  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.161705  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  48.61 
 
 		 329 aa  293  2e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  49.53 
 
 		 326 aa  293  3e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4002  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 327 aa  291  8e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.271936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0777  UDP-galactose 4-epimerase  47.98 
 
 		 329 aa  291  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107594  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1776  UDP-glucose 4-epimerase  46.36 
 
 		 330 aa  290  3e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.098997  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0420  UDP-glucose 4-epimerase  47.35 
 
 		 328 aa  288  7e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1609  UDP-glucose 4-epimerase  47.35 
 
 		 337 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1993  UDP-galactose 4-epimerase  47.35 
 
 		 327 aa  288  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101551  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4513  UDP-glucose 4-epimerase  47.04 
 
 		 337 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  47.24 
 
 		 337 aa  286  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2973  UDP-glucose 4-epimerase  48.6 
 
 		 331 aa  287  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>