More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1672 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
904 aa  1834    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1526  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.37 
 
 
858 aa  413  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.787952  normal  0.35844 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2984  chemotaxis sensory transducer  55.31 
 
 
545 aa  311  5e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.48 
 
 
545 aa  290  8e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2942  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.23 
 
 
1049 aa  290  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4229  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.16 
 
 
1150 aa  288  4e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3602  chemotaxis sensory transducer  54.78 
 
 
518 aa  286  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.67 
 
 
1048 aa  285  3.0000000000000004e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0818053 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.25 
 
 
546 aa  274  5.000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1293  chemotaxis sensory transducer  53.42 
 
 
542 aa  272  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320257  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.25 
 
 
537 aa  271  4e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30970  methyl-accepting chemotaxis protein  61.98 
 
 
562 aa  270  7e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36630  methyl-accepting chemotaxis protein  50.16 
 
 
540 aa  269  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06110  methyl-accepting chemotaxis protein  54.87 
 
 
533 aa  269  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.232988  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05890  methyl-accepting chemotaxis protein  55.85 
 
 
538 aa  266  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5010  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.98 
 
 
538 aa  264  4e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36620  methyl-accepting chemotaxis protein  54.81 
 
 
543 aa  262  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0835028  normal  0.811978 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1995  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.21 
 
 
394 aa  253  8.000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1751  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.35 
 
 
547 aa  252  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.84 
 
 
544 aa  251  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32370  methyl-accepting chemotaxis protein  55.81 
 
 
531 aa  251  5e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0109  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
528 aa  251  6e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268294  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  32.84 
 
 
1046 aa  249  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.925436  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4449  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.95 
 
 
538 aa  249  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018308  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2197  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.12 
 
 
522 aa  249  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2095  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.36 
 
 
538 aa  247  8e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27420  methyl-accepting chemotaxis protein  48.31 
 
 
540 aa  246  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.141989  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32360  methyl-accepting chemotaxis protein  58.85 
 
 
530 aa  245  3e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30950  methyl-accepting chemotaxis protein  51.56 
 
 
540 aa  244  6e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.664181  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03110  methyl-accepting chemotaxis protein  46.56 
 
 
347 aa  243  9e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0123169  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30940  methyl-accepting chemotaxis protein  46.23 
 
 
407 aa  243  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.682285  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.37 
 
 
532 aa  241  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.570256  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1755  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.23 
 
 
538 aa  240  8e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0421  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.23 
 
 
623 aa  238  3e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.308823 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2989  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.82 
 
 
1093 aa  238  5.0000000000000005e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.653084  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1294  methyl-accepting chemotaxis protein  29.44 
 
 
962 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.16 
 
 
536 aa  236  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483396  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1909  chemotaxis sensory transducer  55.25 
 
 
965 aa  236  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.11776  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1613  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.36 
 
 
523 aa  235  3e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00385179  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.13 
 
 
1088 aa  234  8.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000517956 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30960  methyl-accepting chemotaxis protein  57.44 
 
 
540 aa  232  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0359  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.76 
 
 
542 aa  228  4e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2847  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  32.06 
 
 
1089 aa  228  5.0000000000000005e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000851175  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07600  methyl-accepting chemotaxis protein  56.45 
 
 
533 aa  227  7e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0696595 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1974  chemotaxis sensory transducer  44.69 
 
 
535 aa  224  8e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.04 
 
 
731 aa  224  8e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.94 
 
 
675 aa  221  7e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.04 
 
 
741 aa  216  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0330  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  44.44 
 
 
676 aa  216  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0869057 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.96 
 
 
702 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105528  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  42.9 
 
 
688 aa  215  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.57 
 
 
535 aa  214  4.9999999999999996e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.286616  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.92 
 
 
566 aa  213  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0651  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.38 
 
 
535 aa  213  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.406234  normal  0.0260089 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.6 
 
 
688 aa  213  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.88 
 
 
655 aa  213  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  46.92 
 
 
691 aa  212  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4077  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.17 
 
 
545 aa  212  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.72 
 
 
572 aa  211  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2710  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.7 
 
 
969 aa  211  5e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.81 
 
 
730 aa  211  5e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.82 
 
 
567 aa  211  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.28 
 
 
529 aa  211  6e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.99 
 
 
566 aa  211  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.56 
 
 
562 aa  211  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2460  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.28 
 
 
531 aa  210  8e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.19 
 
 
689 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.19 
 
 
560 aa  209  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.77 
 
 
563 aa  209  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.15 
 
 
530 aa  209  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376441  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.32 
 
 
567 aa  208  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.67 
 
 
688 aa  208  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.05 
 
 
563 aa  208  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2484  chemotaxis sensory transducer  51.88 
 
 
563 aa  207  5e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1562  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.19 
 
 
656 aa  207  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.54 
 
 
573 aa  207  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3379  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.71 
 
 
587 aa  206  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787169  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.09 
 
 
563 aa  205  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0360  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.88 
 
 
544 aa  205  3e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0885  putative methyl-accepting chemotaxis protein  45.42 
 
 
691 aa  204  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.58 
 
 
670 aa  204  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  41.19 
 
 
688 aa  204  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3089  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.02 
 
 
526 aa  204  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.7 
 
 
730 aa  204  6e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2241  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.8 
 
 
566 aa  204  7e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.88 
 
 
674 aa  204  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.57 
 
 
561 aa  204  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.09 
 
 
563 aa  203  9e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0026  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.09 
 
 
686 aa  203  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04751  chemotaxis protein  30.37 
 
 
698 aa  203  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.62 
 
 
673 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.12 
 
 
450 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0127  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.81 
 
 
397 aa  202  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.362921  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2996  methyl-accepting chemotaxis protein  41.67 
 
 
698 aa  201  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0718  chemotaxis sensory transducer  48.28 
 
 
669 aa  202  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.845917  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2906  putative methyl-accepting chemotaxis protein  41.82 
 
 
564 aa  202  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  44.23 
 
 
716 aa  202  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  45.32 
 
 
602 aa  202  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  47.31 
 
 
566 aa  202  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0337  chemotaxis sensory transducer  49.45 
 
 
563 aa  201  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.760858  normal  0.789667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>