More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1661 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1661  ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
242 aa  487  1e-137  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  62.92 
 
 
249 aa  309  2e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  62.5 
 
 
244 aa  305  4.0000000000000004e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  60.92 
 
 
243 aa  303  1.0000000000000001e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  60.58 
 
 
240 aa  301  4.0000000000000003e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  62.4 
 
 
241 aa  299  3e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  61.34 
 
 
245 aa  299  3e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  60.42 
 
 
243 aa  299  3e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  62.24 
 
 
244 aa  298  4e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  59.09 
 
 
241 aa  297  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  62.39 
 
 
243 aa  296  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000937515 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  59.24 
 
 
246 aa  297  1e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  60.92 
 
 
243 aa  297  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1939  hypothetical protein  62.18 
 
 
241 aa  295  4e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  60.17 
 
 
240 aa  295  5e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  59.58 
 
 
244 aa  294  8e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  58.26 
 
 
241 aa  294  8e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  59.09 
 
 
241 aa  294  8e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  60.83 
 
 
244 aa  293  1e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  57.44 
 
 
241 aa  293  2e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  58.68 
 
 
241 aa  293  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1888  ABC transporter, ATP-binding protein  62.5 
 
 
246 aa  291  5e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.986838  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1282  ABC transporter-related protein  63.03 
 
 
246 aa  291  6e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000182009 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2973  ABC transporter related  60.25 
 
 
246 aa  291  6e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000014361  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  60.08 
 
 
254 aa  291  7e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  59.17 
 
 
244 aa  290  1e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3678  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.61 
 
 
241 aa  289  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.156461 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3509  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.61 
 
 
241 aa  289  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3511  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.61 
 
 
241 aa  289  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3580  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.61 
 
 
241 aa  289  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3616  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.61 
 
 
241 aa  289  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.238218 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0898  hypothetical protein  58.68 
 
 
241 aa  289  3e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0867  hypothetical protein  58.68 
 
 
241 aa  289  3e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3684  ABC transporter related  60.5 
 
 
244 aa  289  4e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3637  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.61 
 
 
241 aa  288  4e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.671496  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  57.85 
 
 
241 aa  288  4e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  59.58 
 
 
268 aa  288  5.0000000000000004e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1621  ABC transporter related  58.82 
 
 
247 aa  288  6e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.724922  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0285  ABC transporter related  58.4 
 
 
246 aa  288  7e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4452  ABC transporter, ATP-binding protein  59.09 
 
 
241 aa  287  9e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  58.58 
 
 
239 aa  287  1e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3814  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.61 
 
 
241 aa  287  1e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  58.26 
 
 
241 aa  287  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4146  ABC transporter  58.68 
 
 
241 aa  286  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0960  ABC transporter related  58.68 
 
 
241 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0953  ABC transporter ATP-binding protein  58.68 
 
 
241 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0288  ATPase  59.58 
 
 
244 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.017076 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0992  ABC transporter related  58.68 
 
 
241 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  57.85 
 
 
241 aa  286  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  57.44 
 
 
246 aa  285  4e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4262  ABC transporter related  58.26 
 
 
241 aa  285  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3656  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.2 
 
 
241 aa  285  4e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.875085  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3335  ABC transporter related  56.67 
 
 
250 aa  285  4e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0275  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.61 
 
 
241 aa  285  5e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.314804  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.61 
 
 
241 aa  285  5e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0282  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.61 
 
 
241 aa  285  5e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  57.74 
 
 
244 aa  285  5e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0858  ABC transporter-like  58.26 
 
 
241 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2070  ABC transporter related  60.42 
 
 
245 aa  285  5.999999999999999e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0552622  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  61 
 
 
244 aa  284  8e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0490  ABC transporter related  61 
 
 
243 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.858965  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  58.16 
 
 
258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  57.44 
 
 
241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4208  ABC transporter related  59.17 
 
 
259 aa  283  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.216792  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  58.16 
 
 
258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0973  ABC transporter related  56.67 
 
 
240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.156124  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2167  ABC transporter related  58.16 
 
 
247 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  58.68 
 
 
241 aa  282  4.0000000000000003e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57930  putative ATP-binding component of ABC transporter  57.44 
 
 
241 aa  281  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2605  ABC transporter related  56.3 
 
 
244 aa  281  8.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.675994 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2891  ABC transporter ATP-binding protein  55.79 
 
 
241 aa  281  8.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.724805  normal  0.0929005 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5034  ABC transporter ATP-binding protein  57.02 
 
 
241 aa  280  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0268647  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3026  ABC transporter, ATP-binding protein  59.24 
 
 
241 aa  280  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.808463  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2634  ABC transporter related  59.24 
 
 
241 aa  280  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  58.16 
 
 
261 aa  279  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3960  ABC transporter, ATP-binding protein  58.75 
 
 
243 aa  279  3e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2125  ABC transporter related  57.02 
 
 
241 aa  279  3e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3667  ABC transporter related  58.75 
 
 
243 aa  278  4e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00165948  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0708  ABC transporter related  58.75 
 
 
243 aa  278  4e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658002  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0687  ABC transporter related  58.75 
 
 
243 aa  278  4e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000839172  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0674  ABC transporter related  58.75 
 
 
243 aa  279  4e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.120094  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3348  ABC transporter related  58.75 
 
 
243 aa  279  4e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159492  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0673  ABC transporter related  58.75 
 
 
243 aa  279  4e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.207873  normal  0.0972351 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0717  ABC transporter related  58.75 
 
 
243 aa  278  4e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.759015  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3689  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.44 
 
 
241 aa  278  5e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1488  ABC transporter related  57.02 
 
 
265 aa  278  6e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.123846  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0926  putative ABC transporter, ATPase subunit  57.02 
 
 
265 aa  278  7e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.617438  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0752  ABC transporter related protein  58.58 
 
 
247 aa  278  7e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03066  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  57.44 
 
 
241 aa  278  8e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00157983  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0506  ABC transporter related protein  57.44 
 
 
241 aa  278  8e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03017  hypothetical protein  57.44 
 
 
241 aa  278  8e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00220423  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  58.78 
 
 
255 aa  278  8e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0499  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.44 
 
 
241 aa  278  8e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406255  normal  0.571058 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3497  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.44 
 
 
241 aa  278  8e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4523  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.44 
 
 
241 aa  278  8e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.939154  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3394  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.44 
 
 
241 aa  278  8e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3569  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.44 
 
 
241 aa  278  8e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.863605  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  58.13 
 
 
268 aa  277  9e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  57.72 
 
 
262 aa  277  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2225  ABC transporter related  56.61 
 
 
259 aa  276  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>