More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1623 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1623  6-phosphofructokinase  100 
 
 
399 aa  822    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1542  6-phosphofructokinase  64.23 
 
 
398 aa  521  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2513  6-phosphofructokinase  49.87 
 
 
385 aa  372  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1831  6-phosphofructokinase  49.61 
 
 
385 aa  370  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1392  6-phosphofructokinase  47.07 
 
 
390 aa  365  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.20346 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2820  phosphofructokinase  46.82 
 
 
390 aa  362  6e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.596483  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0616  6-phosphofructokinase  46.13 
 
 
384 aa  347  2e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.675369  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1732  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  44.19 
 
 
394 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.770131  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0376  6-phosphofructokinase  43 
 
 
390 aa  311  1e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.175104 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2085  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  41.94 
 
 
394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1792  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  41.94 
 
 
394 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1871  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  41.94 
 
 
394 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.444059  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0911  6-phosphofructokinase  42.18 
 
 
407 aa  301  1e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178607  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3015  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  40.52 
 
 
366 aa  280  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.494016  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  38.65 
 
 
348 aa  233  6e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  38.44 
 
 
349 aa  230  4e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  35.85 
 
 
341 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  37.2 
 
 
341 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  36.12 
 
 
341 aa  216  5e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  36.74 
 
 
344 aa  216  7e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  36.76 
 
 
340 aa  214  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  35.75 
 
 
346 aa  213  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  36.39 
 
 
341 aa  207  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  35.75 
 
 
341 aa  206  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  37.57 
 
 
342 aa  206  9e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  34.77 
 
 
342 aa  205  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  34.23 
 
 
342 aa  205  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  36.31 
 
 
346 aa  204  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  34.77 
 
 
341 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  34.77 
 
 
341 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  35.58 
 
 
341 aa  200  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  35.14 
 
 
342 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0860  6-phosphofructokinase  33.87 
 
 
365 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113477  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  36.34 
 
 
364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  34.05 
 
 
365 aa  198  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2076  6-phosphofructokinase  35.62 
 
 
362 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000403027  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  35.91 
 
 
342 aa  196  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  33.51 
 
 
368 aa  196  7e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  34.06 
 
 
339 aa  195  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  32.97 
 
 
340 aa  194  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1703  6-phosphofructokinase  33.43 
 
 
363 aa  194  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  34.05 
 
 
341 aa  193  4e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  33.79 
 
 
360 aa  192  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  36.02 
 
 
344 aa  191  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  33.79 
 
 
345 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  35.58 
 
 
341 aa  191  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1640  6-phosphofructokinase  33.7 
 
 
363 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0175906  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  33.15 
 
 
364 aa  190  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  35.49 
 
 
373 aa  189  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  34.34 
 
 
363 aa  188  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  34.15 
 
 
370 aa  188  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  35.07 
 
 
343 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  35.14 
 
 
345 aa  187  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2715  6-phosphofructokinase  33.88 
 
 
341 aa  186  5e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000377285 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  34.07 
 
 
368 aa  186  6e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  34.9 
 
 
343 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3014  phosphofructokinase  34.63 
 
 
359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  35 
 
 
340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1236  phosphofructokinase  34.35 
 
 
361 aa  184  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000140469 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4086  6-phosphofructokinase  33.15 
 
 
368 aa  183  5.0000000000000004e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  34.9 
 
 
343 aa  183  6e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  34.85 
 
 
341 aa  182  7e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  34.25 
 
 
372 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  32.63 
 
 
356 aa  180  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  33.07 
 
 
366 aa  180  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  34.17 
 
 
359 aa  179  7e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  34.35 
 
 
341 aa  179  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2515  6-phosphofructokinase  34.25 
 
 
372 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1941  6-phosphofructokinase  34.07 
 
 
351 aa  178  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.333925  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  33.07 
 
 
365 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  33.52 
 
 
343 aa  177  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  33.6 
 
 
344 aa  177  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1798  6-phosphofructokinase  34.43 
 
 
358 aa  177  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3976  6-phosphofructokinase  34.53 
 
 
362 aa  175  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00297784 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  32.17 
 
 
343 aa  174  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2244  phosphofructokinase  34.9 
 
 
342 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.347651  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  33.33 
 
 
367 aa  173  5e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  32.41 
 
 
343 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  32.41 
 
 
343 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  32.41 
 
 
343 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1260  6-phosphofructokinase  33.79 
 
 
336 aa  171  2e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000838364  decreased coverage  0.000000000440972 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  34.38 
 
 
363 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000980056  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2087  6-phosphofructokinase  31.03 
 
 
372 aa  170  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0296  phosphofructokinase  32.14 
 
 
375 aa  170  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1258  6-phosphofructokinase  32.12 
 
 
319 aa  170  5e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000104743  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11020  6-phosphofructokinase  33.24 
 
 
342 aa  169  8e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  30.16 
 
 
365 aa  169  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3671  phosphofructokinase  30.89 
 
 
370 aa  168  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2934  6-phosphofructokinase  33.81 
 
 
360 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1055  6-phosphofructokinase  32.7 
 
 
320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0558023  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2613  6-phosphofructokinase  30.3 
 
 
350 aa  164  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3260  6-phosphofructokinase  30.11 
 
 
350 aa  162  7e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0688834 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1479  6-phosphofructokinase  32.63 
 
 
369 aa  162  9e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.035174  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0739  6-phosphofructokinase  30.96 
 
 
319 aa  161  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0715  6-phosphofructokinase  30.96 
 
 
319 aa  160  5e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1164  6-phosphofructokinase  30 
 
 
339 aa  159  8e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00769395  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03210  6-phosphofructokinase  30.85 
 
 
332 aa  159  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506953  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1388  6-phosphofructokinase  29.38 
 
 
319 aa  157  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0089995  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3475  6-phosphofructokinase  31.76 
 
 
378 aa  157  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17741  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1194  6-phosphofructokinase  30.08 
 
 
321 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>