More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1618 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  100 
 
 
394 aa  792    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.656867  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1512  hypothetical protein  45.34 
 
 
396 aa  315  9e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.574186  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2216  hypothetical protein  40.2 
 
 
388 aa  300  2e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5859  hypothetical protein  41.88 
 
 
388 aa  298  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1794  hypothetical protein  39.95 
 
 
388 aa  286  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0173513  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1459  hypothetical protein  41.98 
 
 
388 aa  286  4e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.789839  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2405  hypothetical protein  40.05 
 
 
387 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0262818  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1164  ABC transporter, permease protein  40.31 
 
 
387 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.440199  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1986  hypothetical protein  39.95 
 
 
388 aa  281  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0204  hypothetical protein  40.46 
 
 
388 aa  276  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20132  unclonable  0.000000000008111 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2805  hypothetical protein  39.95 
 
 
388 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.275109  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0301  hypothetical protein  39.95 
 
 
388 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157711  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0282  hypothetical protein  39.69 
 
 
388 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.548142  hitchhiker  0.0000619818 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3709  hypothetical protein  39.65 
 
 
388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.392463  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0228  hypothetical protein  39.69 
 
 
388 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000368299 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3400  ABC efflux pump, inner membrane subunit  39.44 
 
 
388 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.089365  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0220  hypothetical protein  39.44 
 
 
388 aa  272  7e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0251  protein of unknown function DUF214  43.67 
 
 
440 aa  271  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.170274  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0988  protein of unknown function DUF214  38.68 
 
 
388 aa  270  5e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3263  protein of unknown function DUF214  38.93 
 
 
388 aa  269  7e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0255  hypothetical protein  37.11 
 
 
389 aa  267  2.9999999999999995e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0817  hypothetical protein  38.89 
 
 
393 aa  266  4e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000337382 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03340  ABC transporter permease  43.3 
 
 
431 aa  265  8.999999999999999e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1759  hypothetical protein  37.89 
 
 
396 aa  258  9e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0628  protein of unknown function DUF214  37.03 
 
 
391 aa  249  9e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0398137 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2023  hypothetical protein  31.88 
 
 
395 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2258  protein of unknown function DUF214  35.14 
 
 
402 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2580  protein of unknown function DUF214  33.52 
 
 
400 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3164  protein of unknown function DUF214  27.23 
 
 
454 aa  138  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.512918  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  24.02 
 
 
414 aa  90.1  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  27.87 
 
 
421 aa  89  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  26.81 
 
 
406 aa  87.4  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  26.5 
 
 
371 aa  87  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  25.87 
 
 
646 aa  85.5  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  24.66 
 
 
409 aa  83.2  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  24.21 
 
 
391 aa  82.4  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  26.16 
 
 
409 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  24.52 
 
 
398 aa  82.8  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  24.58 
 
 
414 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.64 
 
 
382 aa  80.5  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  26.14 
 
 
421 aa  79.7  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  27.16 
 
 
403 aa  79.7  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  24.19 
 
 
410 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  24.19 
 
 
410 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3734  hypothetical protein  28.89 
 
 
412 aa  78.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637974  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  27.27 
 
 
421 aa  77.4  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  27.93 
 
 
409 aa  76.6  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5104  ABC transporter permease  23.95 
 
 
399 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  26.95 
 
 
421 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5495  ABC transporter permease  23.95 
 
 
399 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5578  ABC transporter, permease  24.85 
 
 
400 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.707712 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  26.57 
 
 
402 aa  75.5  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0476  ABC transporter, permease protein  24.19 
 
 
399 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.02 
 
 
412 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  23.91 
 
 
406 aa  73.9  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  28.39 
 
 
407 aa  73.9  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  26.95 
 
 
668 aa  74.3  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  26.95 
 
 
668 aa  74.3  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  25.83 
 
 
400 aa  73.6  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  25.42 
 
 
658 aa  73.9  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1201  putative permease  21.4 
 
 
431 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0390517  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  23.88 
 
 
406 aa  73.6  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  26.62 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5048  hypothetical protein  23.75 
 
 
399 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  27.59 
 
 
415 aa  73.2  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4950  ABC transporter, permease  24.56 
 
 
400 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5426  ABC transporter, permease  24.56 
 
 
400 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5345  ABC transporter, permease  24.56 
 
 
400 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3785  hypothetical protein  26.05 
 
 
398 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  27.52 
 
 
403 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  29.5 
 
 
420 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  23.54 
 
 
405 aa  72.4  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  23.46 
 
 
412 aa  72.8  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  25.06 
 
 
443 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4414  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.17 
 
 
413 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2283  permease, putative  29.83 
 
 
412 aa  71.6  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.14949  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  25.3 
 
 
406 aa  72  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  30.67 
 
 
420 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  25.26 
 
 
405 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0490  protein of unknown function DUF214  29.5 
 
 
443 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  23.19 
 
 
410 aa  71.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  30.25 
 
 
420 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  28.28 
 
 
409 aa  70.9  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  26.16 
 
 
406 aa  71.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  26.19 
 
 
400 aa  71.2  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  23.63 
 
 
647 aa  70.9  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  28.81 
 
 
412 aa  70.9  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  26.55 
 
 
861 aa  70.5  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  25.57 
 
 
401 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4935  ABC transporter, permease  24.2 
 
 
399 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0742  protein of unknown function DUF214  23.62 
 
 
387 aa  70.1  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0302807  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5372  ABC transporter, permease protein  25.16 
 
 
400 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  26.07 
 
 
385 aa  69.3  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  24.75 
 
 
401 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  24.75 
 
 
401 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5053  hypothetical protein  22.63 
 
 
414 aa  69.3  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.662722  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  26.32 
 
 
412 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  26.12 
 
 
650 aa  69.7  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  26.91 
 
 
423 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3709  ABC transporter permease protein  25.94 
 
 
404 aa  69.3  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>