More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1526 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1526  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
858 aa  1721    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.787952  normal  0.35844 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.84 
 
 
904 aa  429  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4229  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.92 
 
 
1150 aa  299  2e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.7 
 
 
545 aa  294  4e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2984  chemotaxis sensory transducer  55 
 
 
545 aa  278  3e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3602  chemotaxis sensory transducer  55.22 
 
 
518 aa  277  6e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05890  methyl-accepting chemotaxis protein  53.16 
 
 
538 aa  261  6e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5010  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.29 
 
 
538 aa  256  9e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06110  methyl-accepting chemotaxis protein  57.68 
 
 
533 aa  256  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.232988  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1995  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.02 
 
 
394 aa  255  2.0000000000000002e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.82 
 
 
546 aa  253  9.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36630  methyl-accepting chemotaxis protein  55.21 
 
 
540 aa  253  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36620  methyl-accepting chemotaxis protein  53.26 
 
 
543 aa  252  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0835028  normal  0.811978 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.82 
 
 
537 aa  251  4e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1293  chemotaxis sensory transducer  55.84 
 
 
542 aa  249  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320257  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32370  methyl-accepting chemotaxis protein  50.65 
 
 
531 aa  248  4e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0109  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.22 
 
 
528 aa  246  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268294  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30940  methyl-accepting chemotaxis protein  50.56 
 
 
407 aa  243  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.682285  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30970  methyl-accepting chemotaxis protein  58.47 
 
 
562 aa  242  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27420  methyl-accepting chemotaxis protein  51.43 
 
 
540 aa  239  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.141989  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2197  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.5 
 
 
522 aa  239  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1909  chemotaxis sensory transducer  55.2 
 
 
965 aa  235  3e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.11776  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1755  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.36 
 
 
538 aa  235  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.32 
 
 
532 aa  233  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.570256  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1613  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.81 
 
 
523 aa  232  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00385179  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4449  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.12 
 
 
538 aa  231  4e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018308  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.67 
 
 
544 aa  231  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32360  methyl-accepting chemotaxis protein  50.33 
 
 
530 aa  230  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0421  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.03 
 
 
623 aa  229  2e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.308823 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.24 
 
 
536 aa  227  7e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483396  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1974  chemotaxis sensory transducer  46.58 
 
 
535 aa  227  8e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30950  methyl-accepting chemotaxis protein  48.72 
 
 
540 aa  225  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.664181  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30960  methyl-accepting chemotaxis protein  55.83 
 
 
540 aa  223  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2095  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.95 
 
 
538 aa  223  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1751  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.22 
 
 
547 aa  223  9.999999999999999e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03110  methyl-accepting chemotaxis protein  46.49 
 
 
347 aa  221  5e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0123169  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.96 
 
 
702 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105528  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0359  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.28 
 
 
542 aa  217  9e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0360  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.05 
 
 
544 aa  215  2.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07600  methyl-accepting chemotaxis protein  53.57 
 
 
533 aa  213  9e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0696595 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.72 
 
 
675 aa  211  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.13 
 
 
535 aa  207  9e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.286616  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2484  chemotaxis sensory transducer  49.23 
 
 
563 aa  206  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1562  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3563  chemotaxis sensory transducer  41.48 
 
 
563 aa  204  4e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4077  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.83 
 
 
545 aa  204  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1913  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.36 
 
 
524 aa  204  7e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0934644  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0651  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.2 
 
 
535 aa  204  7e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.406234  normal  0.0260089 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.52 
 
 
529 aa  201  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1068  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  29.42 
 
 
885 aa  201  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.122951 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.75 
 
 
563 aa  201  6e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.02 
 
 
655 aa  201  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.79 
 
 
566 aa  200  9e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2460  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.57 
 
 
531 aa  200  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  42.41 
 
 
563 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.44 
 
 
563 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.55 
 
 
530 aa  199  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376441  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.18 
 
 
670 aa  199  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.68 
 
 
560 aa  198  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.06 
 
 
566 aa  199  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.27 
 
 
563 aa  198  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.27 
 
 
731 aa  197  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2975  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.13 
 
 
758 aa  197  7e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3504  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.3 
 
 
657 aa  196  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193477  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1197  chemotaxis sensory transducer  44.81 
 
 
688 aa  196  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.49 
 
 
563 aa  196  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.5 
 
 
573 aa  196  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.58 
 
 
563 aa  196  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0718  chemotaxis sensory transducer  41.91 
 
 
669 aa  194  4e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.845917  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.59 
 
 
730 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.99 
 
 
673 aa  195  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  44.85 
 
 
691 aa  194  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.69 
 
 
688 aa  194  6e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2241  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.92 
 
 
566 aa  194  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.37 
 
 
567 aa  194  6e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.01 
 
 
712 aa  194  7e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991242  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0330  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  46.86 
 
 
676 aa  194  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0869057 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.38 
 
 
563 aa  194  8e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.32 
 
 
730 aa  193  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.36 
 
 
562 aa  193  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.18 
 
 
563 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0061  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.15 
 
 
674 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.33 
 
 
565 aa  192  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.11 
 
 
545 aa  192  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0156977  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  43.07 
 
 
716 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0885  putative methyl-accepting chemotaxis protein  41.91 
 
 
691 aa  192  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.18 
 
 
563 aa  192  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.04 
 
 
550 aa  191  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.37871  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1735  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.76 
 
 
868 aa  192  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6993  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  48.72 
 
 
697 aa  191  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0840  chemotaxis sensory transducer  46.25 
 
 
712 aa  191  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.174635 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.44 
 
 
672 aa  191  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.51 
 
 
561 aa  191  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0134  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.08 
 
 
565 aa  191  5.999999999999999e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.46 
 
 
567 aa  191  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.96 
 
 
563 aa  190  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  38.32 
 
 
688 aa  190  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.19 
 
 
573 aa  189  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.54 
 
 
687 aa  190  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.92 
 
 
572 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0191  chemotaxis sensory transducer  45.99 
 
 
565 aa  189  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.731843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>