More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1524 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2325  CheA signal transduction histidine kinase  48.21 
 
 		 760 aa  648    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  100 
 
 		 766 aa  1528    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  45.61 
 
 		 801 aa  671    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3604  ATPase domain-containing protein  50.8 
 
 		 742 aa  683    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.864883  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2004  CheA signal transduction histidine kinase  44.28 
 
 		 796 aa  603  1.0000000000000001e-171  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.370377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  46.33 
 
 		 728 aa  590  1e-167  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0521  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  42.26 
 
 		 942 aa  568  1e-160  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58429  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1793  CheA signal transduction histidine kinases  59.25 
 
 		 870 aa  565  1e-160  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.63759  normal  0.833682 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5007  CheA signal transduction histidine kinase  52.95 
 
 		 792 aa  559  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0579075  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0520  CheA kinase  42.2 
 
 		 888 aa  558  1e-157  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.691832 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3376  CheA signal transduction histidine kinase  40.76 
 
 		 911 aa  554  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.163998  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  42.99 
 
 		 910 aa  550  1e-155  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  42.32 
 
 		 878 aa  543  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3920  CheA-like signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 		 934 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0314  CheA signal transduction histidine kinase  51.35 
 
 		 822 aa  518  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.181126  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30990  chemotaxis protein histidine kinase-like protein  49.55 
 
 		 819 aa  499  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1872  CheA signal transduction histidine kinase  46.45 
 
 		 937 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134352  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1817  CheA signal transduction histidine kinase  46.45 
 
 		 937 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0658  CheA signal transduction histidine kinases  45.67 
 
 		 928 aa  472  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231862  normal  0.831096 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3803  CheA signal transduction histidine kinases  45.09 
 
 		 934 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4247  CheA signal transduction histidine kinases  45.09 
 
 		 922 aa  465  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.63903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4838  CheA signal transduction histidine kinase  46.53 
 
 		 935 aa  458  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552774  hitchhiker  0.00614515 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0990  CheA signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 		 1085 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0868  CheA signal transduction histidine kinase  42.52 
 
 		 1063 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  39.72 
 
 		 769 aa  427  1e-118  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  42.16 
 
 		 770 aa  428  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  39.78 
 
 		 769 aa  421  1e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  39.21 
 
 		 769 aa  420  1e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  40.13 
 
 		 770 aa  418  9.999999999999999e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  40.4 
 
 		 601 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  39.28 
 
 		 774 aa  413  1e-114  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  38.19 
 
 		 770 aa  411  1e-113  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  39.24 
 
 		 803 aa  410  1e-113  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  38.53 
 
 		 783 aa  406  1.0000000000000001e-112  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  38.82 
 
 		 785 aa  404  1e-111  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  39.44 
 
 		 610 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  39.87 
 
 		 604 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 		 598 aa  399  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  39.24 
 
 		 607 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0065  CheA signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 812 aa  392  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 		 603 aa  392  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3576  CheA signal transduction histidine kinases  38.51 
 
 		 1104 aa  392  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  39.9 
 
 		 606 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  36.66 
 
 		 639 aa  362  2e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  37.86 
 
 		 625 aa  343  8e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2285  CheA signal transduction histidine kinases  35.63 
 
 		 584 aa  342  2e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 871 aa  339  9.999999999999999e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 		 681 aa  339  9.999999999999999e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1859  CheA signal transduction histidine kinase  45.41 
 
 		 614 aa  338  2.9999999999999997e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  40.49 
 
 		 660 aa  336  7.999999999999999e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06212  chemotaxis protein CheA  44.88 
 
 		 552 aa  336  1e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.186307  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00954  chemotaxis protein CheA  44.88 
 
 		 552 aa  336  1e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.32491  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 		 1031 aa  335  2e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  41.88 
 
 		 754 aa  333  5e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0433  CheA signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 		 730 aa  332  1e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.645464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  45.03 
 
 		 691 aa  332  1e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  43.7 
 
 		 747 aa  332  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  39.91 
 
 		 736 aa  331  2e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  41.69 
 
 		 751 aa  331  3e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  40.84 
 
 		 650 aa  331  4e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03141  hypothetical protein  42.75 
 
 		 744 aa  330  5.0000000000000004e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  44.21 
 
 		 743 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  43.44 
 
 		 747 aa  330  6e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  43.85 
 
 		 1089 aa  330  6e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  44.36 
 
 		 954 aa  330  8e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  44.47 
 
 		 739 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  41.84 
 
 		 745 aa  329  1.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1740  CheA signal transduction histidine kinases  35.39 
 
 		 807 aa  329  1.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0607216 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  40.55 
 
 		 747 aa  328  3e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1178  CheA signal transduction histidine kinase  45.29 
 
 		 715 aa  328  3e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.72434  normal  0.652884 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  42.12 
 
 		 697 aa  327  4.0000000000000003e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 		 654 aa  327  6e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  34.36 
 
 		 654 aa  327  6e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  43.64 
 
 		 713 aa  327  6e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1651  chemotaxis protein CheA  42.39 
 
 		 785 aa  327  6e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.770594  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  42.01 
 
 		 744 aa  326  1e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  34.66 
 
 		 654 aa  325  2e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  42.07 
 
 		 719 aa  325  2e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  34.66 
 
 		 654 aa  325  2e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  34.66 
 
 		 652 aa  325  2e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  34.66 
 
 		 652 aa  325  2e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1346  ATP-binding region, ATPase-like protein  41.88 
 
 		 734 aa  325  2e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  34.66 
 
 		 654 aa  325  2e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  34.51 
 
 		 654 aa  325  3e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1386  CheA signal transduction histidine kinase  43.81 
 
 		 746 aa  324  4e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.524056  normal  0.224897 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  39.78 
 
 		 759 aa  324  4e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3434  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  43.27 
 
 		 758 aa  323  5e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  34.66 
 
 		 654 aa  324  5e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  44.04 
 
 		 748 aa  323  9.000000000000001e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  43.24 
 
 		 754 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0774  CheA signal transduction histidine kinase  43.96 
 
 		 1030 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142014 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1982  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  42.97 
 
 		 748 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  44.13 
 
 		 673 aa  322  1.9999999999999998e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45590  putative two-component sensor  44.3 
 
 		 753 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.267862 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2287  chemotaxis protein CheA  41.2 
 
 		 723 aa  322  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  40.14 
 
 		 767 aa  321  3e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  40.45 
 
 		 675 aa  321  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2802  CheA signal transduction histidine kinase  44.03 
 
 		 737 aa  320  5e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.787874  normal  0.174869 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1638  CheA signal transduction histidine kinase  43.86 
 
 		 733 aa  320  7e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1302  CheA signal transduction histidine kinases  39.96 
 
 		 760 aa  319  1e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.345231  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>