More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1502 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  100 
 
 
610 aa  1263    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2883  alpha amylase catalytic region  32.27 
 
 
630 aa  338  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.917662  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0362  alpha amylase catalytic region  33.01 
 
 
623 aa  339  9.999999999999999e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000617875  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5089  alpha amylase catalytic region  32.52 
 
 
619 aa  335  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000712833  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1887  alpha amylase, catalytic region  32.73 
 
 
654 aa  333  6e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2207  alpha amylase catalytic region  31.26 
 
 
631 aa  332  1e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.247913  hitchhiker  0.0000287119 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1785  alpha amylase, catalytic region  31.35 
 
 
639 aa  329  9e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48062  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1399  alpha amylase, catalytic region  32.94 
 
 
620 aa  327  3e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2211  alpha amylase, catalytic region  31.97 
 
 
665 aa  323  4e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2313  alpha amylase, catalytic region  32.22 
 
 
686 aa  321  3e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.638219  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05090  putative alpha-amylase  32.49 
 
 
609 aa  319  1e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2031  alpha amylase, catalytic region  32.44 
 
 
641 aa  318  1e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01888  putative alpha-amylase  31.27 
 
 
644 aa  317  4e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2135  alpha amylase, catalytic region  31.66 
 
 
665 aa  316  9e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.269478  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2289  alpha amylase, catalytic region  30.39 
 
 
765 aa  296  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2302  alpha amylase catalytic region  29.74 
 
 
786 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.073428 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2083  alpha amylase catalytic region  29.62 
 
 
778 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2036  cyclomaltodextrinase  29.26 
 
 
774 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.47115  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1660  alpha amylase, catalytic region  31.94 
 
 
683 aa  276  9e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  32.84 
 
 
511 aa  242  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  32.99 
 
 
510 aa  239  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  28.95 
 
 
885 aa  201  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  30.71 
 
 
484 aa  199  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  29.27 
 
 
620 aa  199  2.0000000000000003e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  29.65 
 
 
838 aa  199  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  27.03 
 
 
836 aa  196  8.000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  28.8 
 
 
588 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  29.25 
 
 
574 aa  190  5.999999999999999e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  30.61 
 
 
524 aa  189  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  28.94 
 
 
528 aa  187  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  28.62 
 
 
593 aa  187  6e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  28.29 
 
 
599 aa  186  7e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  28.74 
 
 
528 aa  186  9e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  31.39 
 
 
1891 aa  182  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  27.73 
 
 
814 aa  183  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  31.39 
 
 
587 aa  181  4.999999999999999e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  29.74 
 
 
533 aa  180  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  29.7 
 
 
526 aa  177  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  30 
 
 
1021 aa  176  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  30.47 
 
 
477 aa  174  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  26.42 
 
 
589 aa  173  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  28.79 
 
 
614 aa  172  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  29.64 
 
 
609 aa  172  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  30.68 
 
 
481 aa  170  8e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  26.28 
 
 
493 aa  169  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  26.81 
 
 
582 aa  169  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4288  alpha amylase catalytic region  31.71 
 
 
588 aa  169  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  29.57 
 
 
488 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  27.27 
 
 
2638 aa  164  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  26.85 
 
 
499 aa  165  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  27.12 
 
 
1005 aa  164  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  27.07 
 
 
586 aa  164  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  28.51 
 
 
462 aa  163  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.9 
 
 
1855 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  29.11 
 
 
487 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  27.35 
 
 
586 aa  162  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01890  cyclomaltodextrin glucanotransferase  28.83 
 
 
564 aa  161  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.773956  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  28.76 
 
 
575 aa  161  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  27.94 
 
 
522 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  27.02 
 
 
752 aa  160  5e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  27.1 
 
 
481 aa  160  6e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  28.33 
 
 
481 aa  160  8e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  27.98 
 
 
586 aa  159  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  26.22 
 
 
1942 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  27.77 
 
 
586 aa  158  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  26.14 
 
 
622 aa  158  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  26.04 
 
 
604 aa  157  5.0000000000000005e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  27.07 
 
 
583 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002973  maltodextrin glucosidase  25.43 
 
 
608 aa  157  6e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  27.48 
 
 
1017 aa  157  7e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  27.47 
 
 
509 aa  156  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  27.88 
 
 
600 aa  155  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  26.3 
 
 
586 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  28.73 
 
 
925 aa  155  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  29.14 
 
 
593 aa  155  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  27.31 
 
 
586 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  27.18 
 
 
515 aa  154  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  26.99 
 
 
586 aa  153  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  27.05 
 
 
545 aa  154  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  27.09 
 
 
586 aa  153  8e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  27.09 
 
 
586 aa  153  8e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  27.09 
 
 
586 aa  153  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  27.22 
 
 
481 aa  153  8.999999999999999e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  28.76 
 
 
635 aa  153  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2186  alpha amylase, catalytic region  27.39 
 
 
576 aa  152  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  29.05 
 
 
595 aa  153  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  25.34 
 
 
481 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  26.87 
 
 
586 aa  152  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  23.78 
 
 
610 aa  152  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  27.67 
 
 
549 aa  152  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  23.62 
 
 
610 aa  151  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.07 
 
 
1975 aa  151  4e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  26.99 
 
 
586 aa  151  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  27.4 
 
 
541 aa  150  6e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  27.66 
 
 
541 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  29.52 
 
 
578 aa  149  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  28.47 
 
 
589 aa  148  3e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.38 
 
 
2068 aa  147  5e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  29.66 
 
 
742 aa  147  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  26.24 
 
 
486 aa  147  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>