More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1475 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1475  aminotransferase  100 
 
 
363 aa  739    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2143  aminotransferase class I and II  31.99 
 
 
356 aa  162  7e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0155  aminotransferase class I and II  30.51 
 
 
372 aa  138  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1453  transaminase  29.07 
 
 
369 aa  137  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000422446  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22340  aminotransferase  29.19 
 
 
372 aa  135  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000310554  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2317  transaminase  29.65 
 
 
376 aa  133  3.9999999999999996e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1384  transaminase  26.82 
 
 
373 aa  131  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2419  aminotransferase  29.87 
 
 
396 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.181004  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05340  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  27.91 
 
 
377 aa  127  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0053  aminotransferase class I and II  29.71 
 
 
366 aa  125  9e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1580  aminotransferase class I and II  28.8 
 
 
382 aa  125  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.12368 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05193  aminotransferase function, hypothetical (Eurofung)  28.26 
 
 
409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1405  aminotransferase, class I and II  28.12 
 
 
362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.269129  normal  0.550876 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4257  transaminase  29.11 
 
 
374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01640  aminotransferase  25.5 
 
 
372 aa  119  9.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.278296  hitchhiker  0.0000000160919 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2069  transaminase  27.2 
 
 
374 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0152643 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0212  hypothetical protein  24.19 
 
 
362 aa  113  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01751  putative aminotransferase protein  30.07 
 
 
374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.787087 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5695  transaminase  28.72 
 
 
374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.679406 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3451  aminotransferase class I and II  26.48 
 
 
380 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00028237 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1338  aminotransferase class I and II  29.3 
 
 
377 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50446  Aspartate aminotransferase (Transaminase A) (AspAT)  26.71 
 
 
404 aa  107  4e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.566303 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2522  aminotransferase AlaT  28.79 
 
 
403 aa  106  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0098496  normal  0.421504 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2026  aminotransferase AlaT  28.7 
 
 
409 aa  105  9e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1994  aminotransferase AlaT  28.16 
 
 
427 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1540  aminotransferase AlaT  27.13 
 
 
409 aa  103  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1967  aminotransferase AlaT  27.41 
 
 
409 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000390932  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1447  aminotransferase class I and II  25.07 
 
 
368 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0268591  normal  0.142096 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1326  aminotransferase AlaT  27.94 
 
 
413 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0763036  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02420  aminotransferase AlaT  28.38 
 
 
423 aa  101  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_515  aminotransferase, DapL-like protein  26.53 
 
 
382 aa  101  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0945  aminotransferase class I and II  27.6 
 
 
392 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.090244  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1311  aminotransferase AlaT  28.4 
 
 
508 aa  100  3e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2197  aminotransferase AlaT  25.42 
 
 
412 aa  100  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141545  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0021  aminotransferase, classes I and II  26.33 
 
 
339 aa  99.8  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1876  aspartate aminotransferase  26.33 
 
 
339 aa  99.8  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1262  aminotransferase AlaT  27.94 
 
 
429 aa  99.8  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.30879  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1563  aminotransferase AlaT  29.27 
 
 
404 aa  99.4  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2271  aminotransferase AlaT  26.33 
 
 
412 aa  99.4  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2233  aminotransferase AlaT  26.33 
 
 
412 aa  99.4  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2397  aminotransferase AlaT  26.33 
 
 
415 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2560  aminotransferase AlaT  28.98 
 
 
410 aa  99  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.752509  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1237  aminotransferase AlaT  27.94 
 
 
412 aa  99  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0169651 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1872  aminotransferase AlaT  28.48 
 
 
403 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.866522  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2232  aminotransferase AlaT  26.27 
 
 
407 aa  98.2  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0248058  hitchhiker  0.00000226565 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01427  aminotransferase AlaT  28.48 
 
 
404 aa  98.2  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0549  aminotransferase  27.1 
 
 
380 aa  98.2  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1201  aminotransferase AlaT  27.62 
 
 
413 aa  97.8  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.895209  normal  0.0291272 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3207  aminotransferase AlaT  28.03 
 
 
410 aa  97.1  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004034  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  29.37 
 
 
377 aa  97.1  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1830  aminotransferase AlaT  28.03 
 
 
409 aa  96.7  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3843  aminotransferase AlaT  26.97 
 
 
403 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0237926  normal  0.409513 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3983  aminotransferase AlaT  27.58 
 
 
403 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2387  aminotransferase AlaT  26.03 
 
 
414 aa  96.3  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0536  L-aspartate aminotransferase  25.54 
 
 
396 aa  96.3  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1779  aminotransferase, classes I and II  26.55 
 
 
403 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0842  aminotransferase AlaT  26.07 
 
 
426 aa  95.9  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.387526  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2327  aminotransferase AlaT  27.58 
 
 
403 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218058  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5220  aminotransferase AlaT  27.85 
 
 
411 aa  95.9  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0739506  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3366  aminotransferase AlaT  26.14 
 
 
432 aa  95.5  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1481  aminotransferase AlaT  27.58 
 
 
403 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27500  aminotransferase AlaT  27.58 
 
 
403 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0223  normal  0.0677346 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5709  aspartate transaminase  26.22 
 
 
393 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3615  aminotransferase AlaT  26.84 
 
 
403 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.222479 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1911  aminotransferase AlaT  27.44 
 
 
426 aa  94.7  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  24.53 
 
 
410 aa  94.7  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0619  aminotransferase AlaT  26.76 
 
 
404 aa  94.7  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1447  aminotransferase AlaT  27.58 
 
 
403 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0541953  normal  0.418968 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0027  alanine aminotransferase  31.58 
 
 
400 aa  95.1  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2553  aminotransferase AlaT  27.13 
 
 
404 aa  94  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1232  aminotransferase  26.33 
 
 
399 aa  94.4  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3601  aminotransferase AlaT  27.58 
 
 
405 aa  94  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.16413 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3721  aspartate aminotransferase  26.45 
 
 
396 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.764242 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0962  aminotransferase  26.25 
 
 
393 aa  93.6  5e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1393  aminotransferase class I and II  29.05 
 
 
373 aa  93.6  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0111  putative aspartate transaminase  25.87 
 
 
401 aa  93.2  6e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2185  aminotransferase class I and II  25.89 
 
 
396 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.909298  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02215  aspartate aminotransferase  27.13 
 
 
405 aa  92  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1366  aminotransferase class I and II  27.13 
 
 
405 aa  92  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.465492  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2666  aminotransferase AlaT  27.13 
 
 
405 aa  92  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.180875  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3429  aminotransferase AlaT  27.13 
 
 
405 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.412347  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2439  aminotransferase AlaT  27.13 
 
 
405 aa  92  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1552  aminotransferase AlaT  32.74 
 
 
409 aa  92  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1362  aminotransferase AlaT  27.13 
 
 
405 aa  92  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.594502 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02175  hypothetical protein  27.13 
 
 
405 aa  92  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1479  aminotransferase  26.67 
 
 
397 aa  92  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1565  aminotransferase class I and II  27.68 
 
 
404 aa  92.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114117  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2583  aminotransferase AlaT  27.13 
 
 
405 aa  92  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.45985  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3310  aminotransferase AlaT  26.52 
 
 
404 aa  92  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000424805  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65770  aspartate transaminase  25.08 
 
 
393 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0893618  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1973  aminotransferase, class I and II  24.83 
 
 
429 aa  92  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.238227  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2445  aminotransferase AlaT  27.13 
 
 
405 aa  92  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0576  aminotransferase, classes I and II  25.51 
 
 
383 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3621  hypothetical protein  27.74 
 
 
389 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5156  aminotransferase AlaT  25.71 
 
 
412 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.32187  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0437  aminotransferase AlaT  26.67 
 
 
418 aa  91.3  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1993  aminotransferase AlaT  30.59 
 
 
404 aa  91.3  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000340923  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1391  aminotransferase AlaT  27.44 
 
 
404 aa  91.7  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0903  aminotransferase AlaT  24.68 
 
 
429 aa  90.9  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1047  aminotransferase AlaT  24.68 
 
 
429 aa  90.9  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>