More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1466 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 363 aa  721    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  40.69 
 
 		 380 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  40.62 
 
 		 366 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  39.83 
 
 		 366 aa  263  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  39.55 
 
 		 366 aa  262  6e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  37.6 
 
 		 366 aa  261  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  39.89 
 
 		 365 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  41.67 
 
 		 373 aa  255  9e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  41.39 
 
 		 373 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  41.69 
 
 		 388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  38.33 
 
 		 366 aa  248  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  39.06 
 
 		 371 aa  246  4e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  38.16 
 
 		 366 aa  245  8e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  40 
 
 		 366 aa  245  8e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2497  rod shape-determining protein RodA  41.67 
 
 		 373 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.689415  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  37.32 
 
 		 369 aa  241  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  38.59 
 
 		 365 aa  236  4e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  37.05 
 
 		 376 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  42.65 
 
 		 412 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  36.77 
 
 		 367 aa  233  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  38.92 
 
 		 371 aa  231  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1371  rod shape-determining protein RodA  41.71 
 
 		 373 aa  229  6e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0444396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  39.08 
 
 		 377 aa  228  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5928  rod shape-determining protein RodA  37.98 
 
 		 378 aa  226  5.0000000000000005e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  36.53 
 
 		 374 aa  224  2e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  35.24 
 
 		 421 aa  223  4.9999999999999996e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  35 
 
 		 417 aa  223  4.9999999999999996e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  36.41 
 
 		 373 aa  223  6e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  35.66 
 
 		 378 aa  222  7e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1554  rod shape-determining protein RodA  40.16 
 
 		 357 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  37.2 
 
 		 378 aa  219  5e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0474  rod shape-determining protein RodA  36.24 
 
 		 378 aa  219  5e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268193  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  38.81 
 
 		 387 aa  219  6e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2816  cell cycle protein  37.94 
 
 		 374 aa  219  7e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  36.63 
 
 		 368 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  35.01 
 
 		 367 aa  218  1e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  34.32 
 
 		 419 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  37.11 
 
 		 382 aa  218  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0956  rod shape-determining protein RodA  36.31 
 
 		 382 aa  216  4e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215548  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  36.86 
 
 		 370 aa  216  7e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  38.44 
 
 		 371 aa  215  9e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  38.46 
 
 		 369 aa  215  9e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1493  rod shape-determining protein RodA  36.61 
 
 		 385 aa  215  9e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  35.71 
 
 		 371 aa  214  9.999999999999999e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  39.94 
 
 		 384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  34.41 
 
 		 379 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  36.57 
 
 		 370 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  39.66 
 
 		 371 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  36.29 
 
 		 372 aa  213  4.9999999999999996e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  33.92 
 
 		 407 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  35.88 
 
 		 368 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1543  rod shape-determining protein RodA  38.87 
 
 		 401 aa  212  7e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.391462  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  36.94 
 
 		 368 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  33.08 
 
 		 417 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  33.08 
 
 		 417 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0568  rod shape-determining protein RodA  31.62 
 
 		 421 aa  210  3e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2662  rod shape-determining protein RodA  37.02 
 
 		 398 aa  209  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  37.95 
 
 		 372 aa  209  4e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  36.63 
 
 		 372 aa  209  5e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  39.81 
 
 		 370 aa  209  7e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  36.61 
 
 		 372 aa  209  8e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  37.25 
 
 		 364 aa  208  9e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  40.62 
 
 		 371 aa  208  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  36.02 
 
 		 390 aa  208  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  37.25 
 
 		 403 aa  208  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  36.75 
 
 		 374 aa  208  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0659  rod shape-determining protein RodA  34.45 
 
 		 386 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2950  cell wall shape-determining protein  37.68 
 
 		 370 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00101238  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1850  cell wall shape-determining protein  37.68 
 
 		 370 aa  207  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  36.03 
 
 		 367 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  36.03 
 
 		 367 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3022  cell wall shape-determining protein  37.68 
 
 		 370 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00135301  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  36.11 
 
 		 379 aa  208  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  36.03 
 
 		 367 aa  207  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0930  rod shape-determining protein RodA  36.25 
 
 		 371 aa  207  3e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2218  rod shape-determining protein RodA  38.23 
 
 		 373 aa  206  4e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  35.47 
 
 		 368 aa  206  5e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1730  rod shape-determining protein RodA  32.56 
 
 		 407 aa  206  5e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0257403  decreased coverage  0.00417518 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2824  rod shape-determining protein RodA  38.27 
 
 		 371 aa  205  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.806923 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14200  cell division membrane protein  35.08 
 
 		 405 aa  204  1e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  37.9 
 
 		 373 aa  204  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  35.92 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  37.21 
 
 		 368 aa  203  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0264  rod shape-determining protein RodA  39.81 
 
 		 366 aa  203  4e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.068566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1091  cell wall shape-determining protein  38.63 
 
 		 370 aa  203  4e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 		 388 aa  203  4e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  34.97 
 
 		 368 aa  203  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  35.12 
 
 		 373 aa  202  5e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  36.05 
 
 		 368 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  36.05 
 
 		 368 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  36.05 
 
 		 368 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1234  rod shape-determining protein RodA  34.55 
 
 		 366 aa  202  7e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  37.1 
 
 		 368 aa  202  7e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0695  cell wall shape-determining protein  37.5 
 
 		 370 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0799  cell wall shape-determining protein  37.5 
 
 		 370 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0574935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0741  cell wall shape-determining protein  37.5 
 
 		 370 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.175825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  36.05 
 
 		 368 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0755  cell wall shape-determining protein  37.5 
 
 		 370 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.850126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0777  cell division protein FtsW  34.8 
 
 		 361 aa  202  8e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.968195  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0654  cell wall shape-determining protein  37.5 
 
 		 370 aa  202  8e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038599  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>