More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1465 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
691 aa  1417    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  38.51 
 
 
645 aa  413  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  37.6 
 
 
647 aa  410  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  38.72 
 
 
636 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  36.29 
 
 
643 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  34.59 
 
 
639 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  35.4 
 
 
609 aa  372  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  36.91 
 
 
642 aa  369  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  36.93 
 
 
640 aa  363  7.0000000000000005e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  36.95 
 
 
646 aa  362  1e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  36.74 
 
 
681 aa  353  4e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  35.48 
 
 
636 aa  351  2e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  35.66 
 
 
634 aa  347  5e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  34.78 
 
 
619 aa  344  4e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  35.08 
 
 
611 aa  342  2e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  34.62 
 
 
627 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  33.97 
 
 
618 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  33.45 
 
 
610 aa  335  2e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2219  penicillin-binding protein 2  34.15 
 
 
600 aa  333  8e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  35.08 
 
 
678 aa  333  9e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3149  peptidoglycan glycosyltransferase  34.22 
 
 
618 aa  332  1e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000790878  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  33.05 
 
 
618 aa  332  2e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  35.29 
 
 
662 aa  331  2e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  33.45 
 
 
618 aa  332  2e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  33.45 
 
 
618 aa  332  2e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  33.05 
 
 
618 aa  330  4e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  35.57 
 
 
627 aa  330  5.0000000000000004e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  33.17 
 
 
618 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  33.45 
 
 
618 aa  330  6e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  33.45 
 
 
618 aa  330  6e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  33.45 
 
 
618 aa  330  6e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  33.45 
 
 
618 aa  330  6e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  34.11 
 
 
631 aa  329  9e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.09 
 
 
618 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  32.45 
 
 
610 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  33.5 
 
 
630 aa  326  9e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  34.32 
 
 
602 aa  324  3e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  35.02 
 
 
629 aa  324  4e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  34.33 
 
 
610 aa  323  5e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 
618 aa  323  6e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  34.89 
 
 
629 aa  323  8e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  33.8 
 
 
645 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  34.37 
 
 
664 aa  321  3.9999999999999996e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08390  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.91 
 
 
640 aa  320  3.9999999999999996e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.630549  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  33.94 
 
 
630 aa  320  7e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  34.62 
 
 
629 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  34.62 
 
 
629 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  34.38 
 
 
631 aa  317  4e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3451  penicillin-binding protein 2  35.38 
 
 
691 aa  317  6e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  33.28 
 
 
597 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  34.84 
 
 
640 aa  315  1.9999999999999998e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  33.22 
 
 
629 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  34.21 
 
 
631 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2823  penicillin-binding protein 2  32.1 
 
 
755 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.774814 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  33.86 
 
 
809 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  33.86 
 
 
803 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2024  peptidoglycan glycosyltransferase  32.95 
 
 
635 aa  313  5.999999999999999e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0252806  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  35.11 
 
 
646 aa  313  9e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0855  peptidoglycan glycosyltransferase  32.93 
 
 
618 aa  313  1e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000272636  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  33.17 
 
 
629 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  33.06 
 
 
673 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  35.46 
 
 
646 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0590  penicillin-binding protein 2  34.77 
 
 
687 aa  310  4e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.253689  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0671  peptidoglycan glycosyltransferase  34.77 
 
 
687 aa  310  4e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.195303  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  33.94 
 
 
630 aa  310  5e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  33.75 
 
 
802 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  33.75 
 
 
802 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  33.75 
 
 
802 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  33.75 
 
 
802 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0286  penicillin-binding protein 2  32.76 
 
 
655 aa  310  6.999999999999999e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  33.7 
 
 
803 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  31.95 
 
 
602 aa  310  8e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  31.95 
 
 
602 aa  310  8e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  33.16 
 
 
646 aa  309  9e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  33.6 
 
 
802 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2187  peptidoglycan glycosyltransferase  33.15 
 
 
595 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1715  penicillin-binding protein  31.97 
 
 
652 aa  308  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  33.04 
 
 
607 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  32.89 
 
 
633 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 
630 aa  307  3e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04259  penicillin-binding protein 2  33.11 
 
 
686 aa  307  3e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.209813  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  32.64 
 
 
771 aa  307  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  32.43 
 
 
767 aa  307  5.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0501  penicillin-binding protein 2  32.39 
 
 
679 aa  306  7e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109803 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  30.65 
 
 
640 aa  306  8.000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  32.34 
 
 
586 aa  306  1.0000000000000001e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  31.93 
 
 
630 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  32.75 
 
 
800 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2022  peptidoglycan glycosyltransferase  32.95 
 
 
667 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238074  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3741  penicillin-binding protein 2  32.95 
 
 
631 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0357  penicillin-binding protein 2  32.76 
 
 
681 aa  303  5.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  33.77 
 
 
801 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0664  penicillin-binding protein  31.44 
 
 
612 aa  303  6.000000000000001e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164685  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  33.22 
 
 
619 aa  303  8.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2848  peptidoglycan glycosyltransferase  32.36 
 
 
626 aa  303  9e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.209414  hitchhiker  0.000000241166 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  33.13 
 
 
662 aa  303  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  33.76 
 
 
801 aa  302  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  32.5 
 
 
637 aa  301  2e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1513  cell elongation specific D,D-transpeptidase  31.61 
 
 
615 aa  301  2e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0564593  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  33.61 
 
 
801 aa  300  4e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>