282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1462 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
359 aa  723    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  36.15 
 
 
272 aa  150  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  30 
 
 
274 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  30.51 
 
 
274 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  35 
 
 
357 aa  133  5e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  31.67 
 
 
277 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  31.25 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  32.2 
 
 
274 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  34.82 
 
 
283 aa  125  9e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  36.41 
 
 
273 aa  124  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  34.15 
 
 
281 aa  124  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  32.46 
 
 
272 aa  123  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  32.87 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  30.43 
 
 
274 aa  120  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  30.53 
 
 
291 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  30.91 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  30.09 
 
 
291 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2462  rod shape-determining protein MreC  31.25 
 
 
274 aa  114  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.416735  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  29.65 
 
 
291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  29.17 
 
 
291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  35.07 
 
 
274 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 
285 aa  110  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  31.84 
 
 
317 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  34.21 
 
 
315 aa  104  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  29.73 
 
 
338 aa  104  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  26.18 
 
 
304 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0145  rod shape-determining protein MreC  29.3 
 
 
359 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811267  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  28.36 
 
 
306 aa  101  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2185  rod shape-determining protein MreC  30.38 
 
 
304 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  32.09 
 
 
302 aa  100  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2293  rod shape-determining protein MreC  29.29 
 
 
357 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0161  rod shape-determining protein MreC  29.29 
 
 
357 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.749008  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  29.29 
 
 
357 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  29.29 
 
 
357 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0180  rod shape-determining protein MreC  29.29 
 
 
357 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0169  rod shape-determining protein MreC  29.29 
 
 
357 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  29.29 
 
 
357 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  26.48 
 
 
285 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  33.82 
 
 
286 aa  97.1  4e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  31.88 
 
 
288 aa  97.1  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 
296 aa  95.9  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  33.64 
 
 
271 aa  94.7  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  33.79 
 
 
249 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  33.79 
 
 
249 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  33.48 
 
 
288 aa  94  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  25.57 
 
 
336 aa  93.2  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  26.85 
 
 
292 aa  93.2  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  29.15 
 
 
275 aa  93.2  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  33.99 
 
 
286 aa  92.8  9e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  31.67 
 
 
288 aa  92.4  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  25.27 
 
 
324 aa  90.1  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  34.69 
 
 
257 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  28.47 
 
 
287 aa  90.1  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  26.76 
 
 
283 aa  89.7  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  28.42 
 
 
288 aa  89.7  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  28.11 
 
 
367 aa  89.7  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  26.74 
 
 
306 aa  89.7  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  27.5 
 
 
369 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 
256 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  31.68 
 
 
292 aa  87.8  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  26.94 
 
 
300 aa  87  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 
286 aa  87  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  24.39 
 
 
367 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  26.5 
 
 
369 aa  87  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  30.15 
 
 
267 aa  86.7  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3049  rod shape-determining protein MreC  26.4 
 
 
356 aa  86.3  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3166  rod shape-determining protein MreC  26.4 
 
 
356 aa  86.3  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0280823  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  29.06 
 
 
288 aa  85.9  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0163  rod shape-determining protein MreC  28.21 
 
 
296 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2821  rod shape-determining protein MreC  31.28 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  23.36 
 
 
307 aa  85.1  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  26.8 
 
 
346 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  26.4 
 
 
358 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  27.41 
 
 
355 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  26.4 
 
 
358 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  26.4 
 
 
358 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  27.84 
 
 
348 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3646  rod shape-determining protein MreC  26.98 
 
 
311 aa  83.6  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0082  rod shape-determining protein MreC  25.11 
 
 
311 aa  82  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  27.32 
 
 
348 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1460  rod shape-determining protein MreC  30.61 
 
 
273 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590087  hitchhiker  0.00000334343 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0711  rod shape-determining protein MreC  27.06 
 
 
276 aa  82  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0740  rod shape-determining protein MreC  29.33 
 
 
281 aa  81.3  0.00000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.394484  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1389  rod shape-determining protein MreC  31.88 
 
 
283 aa  80.9  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3387  Rod shape-determining protein MreC  30.26 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165741  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0261  rod shape-determining protein MreC  30.43 
 
 
281 aa  80.1  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  32.21 
 
 
249 aa  80.1  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  25.18 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1406  rod shape-determining protein MreC  27.83 
 
 
278 aa  79.7  0.00000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.27011  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  27.8 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  26.07 
 
 
311 aa  79  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  29.25 
 
 
251 aa  78.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0503  rod shape-determining protein MreC  27.93 
 
 
312 aa  78.2  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00353407 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  32.69 
 
 
276 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  26.09 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  28.84 
 
 
292 aa  78.2  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  25.95 
 
 
282 aa  77.8  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1875  rod shape-determining protein MreC  26.76 
 
 
274 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.813624  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  25.93 
 
 
285 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>