More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1420 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1420  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  100 
 
 
446 aa  904    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  36.24 
 
 
439 aa  285  9e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1001  membrane-associated zinc metalloprotease  33.33 
 
 
438 aa  257  2e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1914  putative membrane-associated Zn-dependent protease  34.08 
 
 
446 aa  246  6.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0382298  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.33 
 
 
455 aa  213  7.999999999999999e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002753  membrane-associated zinc metalloprotease  32.11 
 
 
452 aa  210  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.422522  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1523  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.45 
 
 
455 aa  211  3e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24636  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03230  protease  32.26 
 
 
452 aa  210  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2420  protease EcfE  31.4 
 
 
452 aa  208  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0697135  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1844  hypothetical protein  31.82 
 
 
452 aa  208  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000001193  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2590  peptidase RseP  33.11 
 
 
466 aa  204  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0359861  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01380  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  31.81 
 
 
450 aa  202  7e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1530  peptidase RseP  32.9 
 
 
457 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00980857 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0263  zinc metallopeptidase RseP  31.97 
 
 
450 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0154737  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1534  protease ecfE  30.68 
 
 
454 aa  201  3e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000633641  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0261  zinc metallopeptidase RseP  31.97 
 
 
450 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.522145 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0245  zinc metallopeptidase RseP  31.97 
 
 
450 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0248  zinc metallopeptidase RseP  31.97 
 
 
450 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1350  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.18 
 
 
450 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.512727  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2878  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.62 
 
 
456 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126252  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1709  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.9 
 
 
457 aa  200  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.550772  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0245  zinc metallopeptidase RseP  31.97 
 
 
450 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00582579  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1166  membrane-associated zinc metalloprotease  31.59 
 
 
454 aa  199  7.999999999999999e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351032  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1488  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.63 
 
 
456 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000665578  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3158  zinc metallopeptidase RseP  32.69 
 
 
451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00293978  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00174  zinc metallopeptidase  32.54 
 
 
450 aa  197  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0881068  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3427  membrane-associated zinc metalloprotease  32.54 
 
 
450 aa  197  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000034207  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1636  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  31.34 
 
 
456 aa  197  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1749  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.16 
 
 
455 aa  197  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.853109  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2895  membrane-associated zinc metalloprotease  31.48 
 
 
456 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000920242  normal  0.27342 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3484  zinc metallopeptidase RseP  32.9 
 
 
450 aa  197  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00175231  normal  0.0731606 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00173  hypothetical protein  32.54 
 
 
450 aa  197  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.131717  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0186  zinc metallopeptidase RseP  32.54 
 
 
450 aa  197  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000411751  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2808  peptidase RseP  31.26 
 
 
456 aa  197  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000246609  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1541  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  32.19 
 
 
450 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521262  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0178  zinc metallopeptidase RseP  32.54 
 
 
450 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111428  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2973  zinc metallopeptidase RseP  31.24 
 
 
451 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0187  zinc metallopeptidase RseP  32.33 
 
 
450 aa  196  6e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000756829  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1490  RIP metalloprotease RseP  31.09 
 
 
450 aa  196  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1256  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.33 
 
 
450 aa  196  7e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000401781  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3783  zinc metallopeptidase RseP  32.11 
 
 
451 aa  196  9e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00251012  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1457  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.26 
 
 
456 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000042456  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17140  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.3 
 
 
450 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2681  peptidase RseP  31.28 
 
 
446 aa  196  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1279  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.87 
 
 
448 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196606  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2634  peptidase RseP  31.05 
 
 
456 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113842  normal  0.0898661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2701  peptidase RseP  31.05 
 
 
456 aa  195  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000971838  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0180  zinc metallopeptidase RseP  32.33 
 
 
450 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271457  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1447  membrane-associated zinc metalloprotease  31.09 
 
 
469 aa  194  3e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.843225  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1451  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  31.48 
 
 
452 aa  194  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1167  membrane-associated zinc metalloprotease  31.48 
 
 
452 aa  194  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1452  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.85 
 
 
456 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00139274  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4075  membrane-associated zinc metalloprotease  32.25 
 
 
450 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1961  membrane-associated zinc metalloprotease  30 
 
 
469 aa  192  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1355  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.92 
 
 
456 aa  192  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000225455  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1108  peptidase RseP  31.96 
 
 
450 aa  192  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200515  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5322  peptidase RseP  30.32 
 
 
456 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430006  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0169  zinc metallopeptidase RseP  32.11 
 
 
450 aa  190  4e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000438283  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2541  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.16 
 
 
449 aa  189  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0948  zinc metallopeptidase RseP  31.42 
 
 
451 aa  189  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000214354  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1856  peptidase RseP  30.21 
 
 
454 aa  189  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0076  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.73 
 
 
454 aa  187  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1387  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.68 
 
 
480 aa  187  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.0100882 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3274  membrane-associated zinc metalloprotease  30.87 
 
 
461 aa  188  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000455239  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1560  membrane-associated zinc metalloprotease EcfE  30.41 
 
 
452 aa  187  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2628  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.89 
 
 
453 aa  187  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000538528  normal  0.548541 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0981  peptidase RseP  32.61 
 
 
443 aa  187  3e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.238067  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2045  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31 
 
 
462 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3353  zinc metallopeptidase RseP  32.25 
 
 
451 aa  187  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0274947  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1153  membrane-associated zinc metalloprotease  31.25 
 
 
450 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386407  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0084  membrane-associated zinc metalloprotease  30.86 
 
 
453 aa  187  4e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.47842  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1914  membrane-associated zinc metalloprotease  31 
 
 
462 aa  187  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1598  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  31.47 
 
 
452 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0714  zinc metallopeptidase RseP  31.68 
 
 
450 aa  186  9e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000864253  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4179  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.47 
 
 
450 aa  186  9e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.97 
 
 
451 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2171  membrane-associated zinc metalloprotease  29.07 
 
 
454 aa  184  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0792  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.14 
 
 
454 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.534623  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6065  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.28 
 
 
457 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2012  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.28 
 
 
457 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1146  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  30.04 
 
 
456 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106908  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0079  membrane-associated zinc metalloprotease  30.59 
 
 
453 aa  183  6e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.736118  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2032  membrane-associated zinc metalloprotease  30.06 
 
 
457 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1689  peptidase RseP  31.25 
 
 
461 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0450  membrane-associated zinc metalloprotease  29.58 
 
 
428 aa  182  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000160258  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3154  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.46 
 
 
461 aa  181  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000101225  hitchhiker  0.00850689 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1073  zinc metallopeptidase RseP  30.19 
 
 
451 aa  180  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00125076  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1020  zinc metallopeptidase RseP  30.19 
 
 
451 aa  180  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000073944  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1797  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.02 
 
 
479 aa  180  5.999999999999999e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.88903  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3428  zinc metallopeptidase RseP  30.19 
 
 
451 aa  179  5.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000803412  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38920  membrane-associated zinc metallopeptidase MucP  30.47 
 
 
450 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.241633  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0534  protease EcfE  28.27 
 
 
459 aa  177  2e-43  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.196657  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2448  membrane-associated zinc metalloprotease  30.89 
 
 
461 aa  177  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699947  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0009  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.78 
 
 
453 aa  177  4e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000631419  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4131  membrane-associated zinc metalloprotease  31.47 
 
 
438 aa  176  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.158582 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1277  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.61 
 
 
456 aa  176  8e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.358202  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1264  membrane-associated zinc metalloprotease  30.09 
 
 
456 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1331  membrane-associated zinc metalloprotease  29.76 
 
 
462 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5920  membrane-associated zinc metalloprotease  31.29 
 
 
438 aa  174  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.928218  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3176  membrane-associated zinc metalloprotease  29.89 
 
 
444 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.836726 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>