More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1417 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1417  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  100 
 
 
267 aa  551  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0645618 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  56.02 
 
 
256 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  52.42 
 
 
263 aa  266  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.89 
 
 
249 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  50.8 
 
 
266 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.04 
 
 
247 aa  261  8.999999999999999e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.07 
 
 
249 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.07 
 
 
249 aa  256  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.43 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.43 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
249 aa  249  4e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 
249 aa  248  6e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2471  undecaprenyl diphosphate synthase  49.59 
 
 
259 aa  248  8e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  49.4 
 
 
264 aa  248  9e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.32 
 
 
256 aa  248  9e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  50.63 
 
 
247 aa  247  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
249 aa  247  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.97 
 
 
246 aa  247  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.95 
 
 
258 aa  246  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.21 
 
 
258 aa  245  6e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  49.17 
 
 
246 aa  244  6.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.79 
 
 
258 aa  244  9e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.79 
 
 
258 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.79 
 
 
258 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.79 
 
 
258 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.79 
 
 
258 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.79 
 
 
258 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  51.06 
 
 
240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.79 
 
 
258 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  48.37 
 
 
257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.64 
 
 
246 aa  242  5e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.58 
 
 
249 aa  242  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.68 
 
 
259 aa  241  7e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1346  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.37 
 
 
256 aa  241  9e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000376647  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1320  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.37 
 
 
256 aa  241  9e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.07 
 
 
251 aa  240  2e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.96 
 
 
258 aa  240  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.21 
 
 
248 aa  240  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.96 
 
 
257 aa  240  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.85 
 
 
257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  46.96 
 
 
252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1956  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
228 aa  239  4e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10910  undecaprenyl diphosphate synthase  44.56 
 
 
289 aa  239  4e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.183526  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  49.36 
 
 
245 aa  238  5e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03233  undecaprenyl diphosphate synthase  52.17 
 
 
251 aa  238  8e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.08 
 
 
258 aa  238  8e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0827  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.95 
 
 
256 aa  238  9e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000549234  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.49 
 
 
249 aa  236  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.69 
 
 
249 aa  236  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  47.08 
 
 
248 aa  237  2e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.21 
 
 
246 aa  236  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
254 aa  235  4e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1631  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.97 
 
 
260 aa  236  4e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.060942  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.79 
 
 
251 aa  236  4e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0464  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  55.22 
 
 
248 aa  235  6e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.75 
 
 
260 aa  235  6e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3411  undecaprenyl pyrophosphate synthetase (di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase)  47.33 
 
 
260 aa  235  6e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.49 
 
 
246 aa  235  6e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002750  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.3 
 
 
251 aa  235  7e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  48.95 
 
 
244 aa  234  9e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1557  undecaprenyl diphosphate synthase  47.7 
 
 
254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243823  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3725  undecaprenyl diphosphate synthase  51.25 
 
 
251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3585  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.83 
 
 
251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3651  undecaprenyl diphosphate synthase  51.25 
 
 
251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.86266  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09951  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.79 
 
 
265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801732 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0685  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.15 
 
 
259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000229491  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0983  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.37 
 
 
241 aa  233  3e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017531  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3706  undecaprenyl diphosphate synthase  50.83 
 
 
255 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.95 
 
 
252 aa  232  4.0000000000000004e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.57 
 
 
258 aa  232  4.0000000000000004e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3929  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
236 aa  231  6e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.709304  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
260 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2048  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
260 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1261  undecaprenyl diphosphate synthase  50.43 
 
 
260 aa  230  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.12657  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23600  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.72 
 
 
259 aa  230  2e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2031  undecaprenyl diphosphate synthase  50.43 
 
 
260 aa  230  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  47.86 
 
 
241 aa  230  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
236 aa  229  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.15 
 
 
243 aa  229  3e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  48.5 
 
 
251 aa  229  4e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  47.04 
 
 
254 aa  229  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.58 
 
 
267 aa  229  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 
255 aa  229  5e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  46.38 
 
 
240 aa  229  5e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  48.71 
 
 
272 aa  228  6e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0690  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.4 
 
 
270 aa  228  6e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000341789  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0979  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.09 
 
 
254 aa  228  7e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00602167  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2579  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
260 aa  228  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93392  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2489  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
260 aa  228  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1439  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.79 
 
 
256 aa  228  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000108865 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0709  undecaprenyl diphosphate synthase  45.69 
 
 
259 aa  227  1e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0105503  unclonable  0.000000024348 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10941  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.91 
 
 
266 aa  227  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.291205  normal  0.66612 
 
 
-
 
NC_002936  DET0373  undecaprenyl diphosphate synthase  46.75 
 
 
236 aa  226  2e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.72 
 
 
254 aa  227  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5325  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.57 
 
 
260 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00863948  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.58 
 
 
267 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1558  undecaprenyl diphosphate synthase  47.39 
 
 
271 aa  227  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445031  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.09 
 
 
249 aa  226  2e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  49.15 
 
 
260 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1782  undecaprenyl diphosphate synthase  48.95 
 
 
248 aa  227  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>