245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1406 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1406  hypothetical protein  100 
 
 
459 aa  933    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0324522 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0571  hypothetical protein  54.06 
 
 
503 aa  426  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1920  hypothetical protein  52.71 
 
 
525 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0785962  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3209  hypothetical protein  46.8 
 
 
456 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000788974  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2859  protein of unknown function DUF195  48.51 
 
 
512 aa  396  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3259  DNA recombination protein RmuC, putative  48.51 
 
 
486 aa  396  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1288  hypothetical protein  51.31 
 
 
554 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.624866  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0053  protein of unknown function DUF195  51.03 
 
 
531 aa  380  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.783995  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1860  hypothetical protein  44.74 
 
 
448 aa  365  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0527  hypothetical protein  50 
 
 
428 aa  362  7.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.946618  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1528  hypothetical protein  44.41 
 
 
417 aa  350  2e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2404  hypothetical protein  46 
 
 
462 aa  351  2e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5568  protein of unknown function DUF195  39.82 
 
 
473 aa  335  7.999999999999999e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110134  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3872  hypothetical protein  43.6 
 
 
493 aa  330  3e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0396  hypothetical protein  46.13 
 
 
402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000213037 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0178  protein of unknown function DUF195  41.69 
 
 
417 aa  327  3e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.309141 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3697  protein of unknown function DUF195  50.64 
 
 
364 aa  327  3e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.111371  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8478  hypothetical protein  47.56 
 
 
434 aa  325  7e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0251  hypothetical protein  41.67 
 
 
443 aa  325  9e-88  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26410  hypothetical protein  47.4 
 
 
434 aa  325  1e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0823467  normal  0.277767 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1093  protein of unknown function DUF195  47.61 
 
 
501 aa  322  7e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.193289  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5536  hypothetical protein  47.52 
 
 
378 aa  318  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3063  hypothetical protein  45.61 
 
 
443 aa  315  8e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0971  protein of unknown function DUF195  44.81 
 
 
479 aa  311  2e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000421648 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1103  protein of unknown function DUF195  42.9 
 
 
523 aa  307  3e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.813753 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0130  protein of unknown function DUF195  46.5 
 
 
474 aa  305  8.000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0942  protein of unknown function DUF195  42.17 
 
 
494 aa  303  4.0000000000000003e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1509  protein of unknown function DUF195  40.27 
 
 
442 aa  292  7e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  0.015225 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0882  hypothetical protein  44.76 
 
 
386 aa  289  8e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8270  protein of unknown function DUF195  47.1 
 
 
366 aa  280  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1078  hypothetical protein  45.64 
 
 
374 aa  280  5e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4385  protein of unknown function DUF195  42.5 
 
 
398 aa  278  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0827  hypothetical protein  45 
 
 
403 aa  276  7e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208315  normal  0.172585 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0232  hypothetical protein  40 
 
 
445 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.169599  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2898  hypothetical protein  37.01 
 
 
504 aa  262  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0132  hypothetical protein  38.68 
 
 
545 aa  261  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.326041 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1010  protein of unknown function DUF195  41.72 
 
 
387 aa  262  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3397  protein of unknown function DUF195  42.43 
 
 
391 aa  255  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.648521  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2055  hypothetical protein  36.97 
 
 
451 aa  251  2e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.655381  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4571  hypothetical protein  40.71 
 
 
431 aa  242  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22950  hypothetical protein  40.99 
 
 
399 aa  239  6.999999999999999e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20260  hypothetical protein  38.79 
 
 
390 aa  239  1e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140887  normal  0.2743 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1210  hypothetical protein  41.18 
 
 
467 aa  237  3e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0097  RmuC domain protein  43.62 
 
 
446 aa  233  4.0000000000000004e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.186787 
 
 
-
 
NC_002620  TC0212  hypothetical protein  35.59 
 
 
425 aa  226  7e-58  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.828645  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3111  protein of unknown function DUF195  41.13 
 
 
361 aa  223  4e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294839  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2547  protein of unknown function DUF195  37.5 
 
 
428 aa  222  9e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000236422 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16280  hypothetical protein  38.25 
 
 
419 aa  215  9.999999999999999e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2832  hypothetical protein  39.63 
 
 
403 aa  209  9e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0691  hypothetical protein  30.6 
 
 
532 aa  204  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12181  hypothetical protein  30.03 
 
 
531 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.282455  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2040  hypothetical protein  29.34 
 
 
548 aa  183  5.0000000000000004e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0614  hypothetical protein  30.29 
 
 
640 aa  177  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0286081 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4070  hypothetical protein  29.81 
 
 
504 aa  175  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1659  hypothetical protein  29.64 
 
 
492 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000440717  decreased coverage  0.00162326 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4351  RmuC domain-containing protein family  30.56 
 
 
491 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00339657  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51000  hypothetical protein  29.72 
 
 
453 aa  171  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000148678  hitchhiker  0.000000161097 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2433  hypothetical protein  30.36 
 
 
513 aa  170  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1724  hypothetical protein  29.72 
 
 
492 aa  169  7e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000410334  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4176  DNA recombination protein RmuC  29.13 
 
 
475 aa  168  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0130671 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4215  DNA recombination protein RmuC  29.13 
 
 
475 aa  168  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178154 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4147  protein of unknown function DUF195  28.91 
 
 
475 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3666  hypothetical protein  29.46 
 
 
492 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000475221  normal  0.0538787 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5273  DNA recombination protein RmuC  28.91 
 
 
475 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.244142  normal  0.243215 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4056  DNA recombination protein RmuC  28.91 
 
 
475 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4353  DNA recombination protein RmuC  28.91 
 
 
475 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03725  predicted recombination limiting protein  28.91 
 
 
475 aa  167  4e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03674  hypothetical protein  28.91 
 
 
475 aa  167  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0646  hypothetical protein  27.34 
 
 
480 aa  167  5e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.932654  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4304  DNA recombination protein RmuC  29.07 
 
 
475 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1291  hypothetical protein  29.64 
 
 
495 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719972  normal  0.7676 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1249  hypothetical protein  30.41 
 
 
495 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0088018  normal  0.121564 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001928  DNA recombination protein RmuC  31.3 
 
 
510 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1694  hypothetical protein  29.64 
 
 
495 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.141195  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0441  hypothetical protein  31.35 
 
 
527 aa  165  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.870826  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4026  hypothetical protein  29.64 
 
 
495 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000512387  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2995  DNA recombination protein RumC  28.61 
 
 
506 aa  164  4.0000000000000004e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01951  RmuC  29.66 
 
 
429 aa  164  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4200  DNA recombination protein RmuC  30.26 
 
 
476 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4296  DNA recombination protein RmuC  30.26 
 
 
476 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4356  DNA recombination protein RmuC  30.26 
 
 
476 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881162  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4177  DNA recombination protein RmuC  30.26 
 
 
476 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.608265  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1035  protein of unknown function DUF195  28.23 
 
 
612 aa  163  6e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000597215  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4249  DNA recombination protein RmuC  30.26 
 
 
476 aa  163  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4248  protein of unknown function DUF195  30.5 
 
 
518 aa  162  8.000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2620  hypothetical protein  29.85 
 
 
498 aa  162  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.27226  normal  0.225065 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00561  hypothetical protein  30.41 
 
 
510 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0015  protein of unknown function DUF195  28.99 
 
 
448 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.567486  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3961  DNA recombination protein RmuC  29.22 
 
 
485 aa  162  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1623  putative alpha helix chain  30.52 
 
 
462 aa  161  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.577151  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0033  RmuC domain-containing protein  26.84 
 
 
432 aa  160  3e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1894  hypothetical protein  30.5 
 
 
520 aa  160  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4057  hypothetical protein  30.4 
 
 
520 aa  160  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0145  protein of unknown function DUF195  27.82 
 
 
420 aa  159  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549267  normal  0.154744 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2033  RmuC domain-containing protein  28.5 
 
 
530 aa  159  1e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1321  hypothetical protein  29.15 
 
 
427 aa  158  2e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0133  hypothetical protein  29.51 
 
 
424 aa  158  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273434  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1087  hypothetical protein  27.25 
 
 
630 aa  157  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3916  protein of unknown function DUF195  28.87 
 
 
513 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.705842  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1614  DNA recombination protein rmuC  27.13 
 
 
535 aa  156  6e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>