More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1389 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1389  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  100 
 
 
550 aa  1120    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.531963  normal  0.0257718 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1494  sensory box histidine kinase  34.24 
 
 
550 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102326  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1634  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.71 
 
 
538 aa  265  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1396  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.39 
 
 
547 aa  264  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2592  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.9 
 
 
539 aa  259  7e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2679  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 
544 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
526 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4825  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 
582 aa  239  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0670  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.48 
 
 
546 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0451507  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0119  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 
571 aa  233  7.000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.412791  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 
525 aa  233  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 
525 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2146  two component signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 
559 aa  221  3e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 
543 aa  206  6e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.57 
 
 
549 aa  203  8e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 
970 aa  183  6e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0828  sensory histidine kinase AtoS  34.52 
 
 
613 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.167481 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  31.94 
 
 
621 aa  178  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2908  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.97 
 
 
604 aa  172  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.293686  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.45 
 
 
598 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2821  sensory box histidine kinase  31.97 
 
 
604 aa  171  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2943  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
586 aa  171  4e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0016  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.17 
 
 
679 aa  170  5e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.225702  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2808  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 
595 aa  168  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.277541  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2787  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.39 
 
 
365 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220649  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0675  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 
855 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2057  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.84 
 
 
747 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376311  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1972  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.84 
 
 
747 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466348  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1139  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.22 
 
 
578 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1952  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.25 
 
 
752 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.664907  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0915  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.15 
 
 
362 aa  161  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.115848  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1004  sensory box histidine kinase  31.75 
 
 
363 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1907  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40.59 
 
 
747 aa  157  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2492  sensory box histidine kinase  33.14 
 
 
830 aa  156  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.1 
 
 
804 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3120  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.12 
 
 
561 aa  156  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2148  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 
729 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1311  sensory histidine kinase AtoS  30.03 
 
 
614 aa  154  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0841  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.91 
 
 
744 aa  153  7e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1628  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 
929 aa  153  8e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  38.39 
 
 
458 aa  151  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3078  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.07 
 
 
369 aa  151  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
378 aa  150  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1751  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 
671 aa  150  5e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0768  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 
673 aa  150  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670648  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  37.95 
 
 
458 aa  150  8e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  37.95 
 
 
458 aa  149  9e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  37.95 
 
 
458 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1384  sensory histidine kinase AtoS  32.08 
 
 
617 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1736  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 
738 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0213  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 
722 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100019 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2698  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.99 
 
 
438 aa  148  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  37.5 
 
 
458 aa  148  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  37.5 
 
 
458 aa  147  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5473  sensor protein ZraS  37.5 
 
 
458 aa  148  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.548998  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
655 aa  147  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1138  histidine kinase  37.55 
 
 
234 aa  147  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  37.05 
 
 
465 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2454  histidine kinase  38.43 
 
 
367 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000691569  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 
592 aa  146  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3275  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 
631 aa  146  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  39.64 
 
 
673 aa  145  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0414  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.01 
 
 
581 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1745  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.66 
 
 
424 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0824  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.47 
 
 
616 aa  145  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125796 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1841  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 
832 aa  144  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193006  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  37.92 
 
 
1215 aa  144  6e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1658  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.83 
 
 
579 aa  143  6e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0362267  normal  0.337398 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1511  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 
575 aa  144  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 
372 aa  143  8e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  38.76 
 
 
499 aa  143  9e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1167  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 
551 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  29.2 
 
 
608 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.2 
 
 
608 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  29.2 
 
 
608 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  29.2 
 
 
608 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
515 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  29.64 
 
 
608 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  29.73 
 
 
611 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2848  histidine kinase  34.68 
 
 
481 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
1519 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0865128  normal  0.147126 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  29.2 
 
 
608 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 
671 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414779  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 
367 aa  141  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.49679  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2293  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.17 
 
 
782 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1016  sensor protein ZraS  37.22 
 
 
450 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0625472  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0285  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 
867 aa  140  7.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00119398  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 
364 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1404  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.15 
 
 
361 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000236023 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 
662 aa  139  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2806  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.15 
 
 
361 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  35.9 
 
 
674 aa  138  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  38.49 
 
 
655 aa  138  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 
510 aa  139  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1970  sensory box histidine kinase  31.54 
 
 
415 aa  138  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.645732  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 
829 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2240  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 
672 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.48 
 
 
556 aa  139  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2115  sporulation kinase  32.94 
 
 
801 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1985  histidine kinase  36.57 
 
 
672 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>