283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1359 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1359  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
906 aa  1885    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7497  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.89 
 
 
1243 aa  398  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122838  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02824  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03830)  30.81 
 
 
1270 aa  375  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0680096  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2133  glycoside hydrolase family protein  28.74 
 
 
1144 aa  343  1e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283843  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2275  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.82 
 
 
878 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.47 
 
 
984 aa  285  4.0000000000000003e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.37 
 
 
971 aa  270  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7540  Beta-galactosidase/beta- glucuronidase family protein  26.17 
 
 
962 aa  267  8e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.263418  normal  0.712319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.48 
 
 
1362 aa  209  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0884  Beta-mannosidase  22.97 
 
 
823 aa  149  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  25.71 
 
 
734 aa  144  9e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2021  glycoside hydrolase family protein  25.78 
 
 
724 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.07 
 
 
744 aa  128  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4085  glycoside hydrolase family protein  22.97 
 
 
763 aa  127  8.000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.128468  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0227  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.52 
 
 
813 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1802  Beta-mannosidase  20.72 
 
 
813 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1740  glycoside hydrolase family protein  24.64 
 
 
739 aa  117  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.336236 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03368  Beta-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT6]  21.72 
 
 
837 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.73086  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1756  Beta-mannosidase  24.66 
 
 
880 aa  112  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.994744  normal  0.0432556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4242  beta-mannosidase  23.15 
 
 
864 aa  110  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01640  beta-mannosidase  21.88 
 
 
860 aa  109  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.587297  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0255  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  20.85 
 
 
720 aa  108  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.381265 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2588  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  22.25 
 
 
819 aa  107  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1466  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.09 
 
 
835 aa  102  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13243  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25 
 
 
811 aa  102  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0037  beta-mannosidase  24.18 
 
 
831 aa  102  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4827  Beta-mannosidase  23.39 
 
 
824 aa  100  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13110  beta-mannosidase  21.11 
 
 
837 aa  99.4  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0915  beta-mannosidase  24.05 
 
 
840 aa  98.6  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2418  beta-mannosidase  21.9 
 
 
875 aa  96.7  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.6 
 
 
922 aa  95.5  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6180  beta-mannosidase protein  25.8 
 
 
812 aa  95.5  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10160  beta-mannosidase  23.48 
 
 
846 aa  91.7  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.998616 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0497  glycoside hydrolase family protein  21.88 
 
 
793 aa  91.3  7e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0169  mannosidase  20.45 
 
 
821 aa  89.4  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2094  Beta-mannosidase  22.19 
 
 
819 aa  89.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.494102 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2440  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  20.88 
 
 
845 aa  89.4  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.21652  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2529  Beta-mannosidase  21.89 
 
 
882 aa  89  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.869345  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0302  glycoside hydrolase family protein  18.91 
 
 
863 aa  89  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1473  glycoside hydrolase family protein  22.04 
 
 
816 aa  89  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  23.53 
 
 
1049 aa  87.4  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.86 
 
 
805 aa  87  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  23.01 
 
 
1015 aa  86.7  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  26.13 
 
 
815 aa  85.5  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.41 
 
 
986 aa  85.5  0.000000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43820  Glycoside hydrolase family 2 (Mannanase, beta-galactosidase)  22.81 
 
 
838 aa  84.7  0.000000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.893374  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  20.78 
 
 
794 aa  84  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.73 
 
 
813 aa  84  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  26.21 
 
 
972 aa  82.8  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.43 
 
 
781 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  24.6 
 
 
743 aa  82.8  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2333  beta-mannosidase protein  22.1 
 
 
819 aa  82  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0032  beta-mannosidase, putative  20.49 
 
 
861 aa  81.6  0.00000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2405  beta-mannosidase precursor  21.9 
 
 
815 aa  81.3  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5307  Beta-mannosidase  25.72 
 
 
799 aa  80.5  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1715  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  22.34 
 
 
882 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0140  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.52 
 
 
818 aa  80.5  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143076 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.27 
 
 
903 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  23.37 
 
 
1129 aa  79.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  23.19 
 
 
1019 aa  79  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3194  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.62 
 
 
905 aa  79  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0268  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.89 
 
 
843 aa  79  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.617215  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  23.46 
 
 
928 aa  78.6  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1167  glycoside hydrolase family protein  21.42 
 
 
786 aa  79  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2929  glycoside hydrolase family protein  23.36 
 
 
807 aa  79  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113519  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0128  glycoside hydrolase family protein  19.62 
 
 
871 aa  78.6  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.18 
 
 
824 aa  78.6  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2004  beta-mannosidase precursor  21.48 
 
 
891 aa  78.2  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000805644  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  23.68 
 
 
832 aa  78.2  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1724  Beta-mannosidase  22.83 
 
 
824 aa  78.2  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46466  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  23.36 
 
 
1175 aa  77.8  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  24.18 
 
 
781 aa  77.8  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4671  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  22.45 
 
 
845 aa  77  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1928  glycoside hydrolase family protein  19.61 
 
 
891 aa  77.4  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000726308  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  21.08 
 
 
827 aa  77.8  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  25.12 
 
 
1171 aa  77.4  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  24.73 
 
 
925 aa  76.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3722  beta-mannosidase  24.43 
 
 
829 aa  76.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225844  normal  0.26439 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  23.02 
 
 
932 aa  75.9  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5245  Beta-galactosidase  25 
 
 
670 aa  75.5  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  21.6 
 
 
1079 aa  75.1  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  22.36 
 
 
919 aa  74.7  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5363  glycoside hydrolase family protein  20.98 
 
 
853 aa  74.7  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  24.29 
 
 
859 aa  74.3  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2447  Beta-galactosidase  23.19 
 
 
677 aa  73.9  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  24.93 
 
 
873 aa  73.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  24.03 
 
 
888 aa  73.6  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4121  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.03 
 
 
826 aa  73.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.27 
 
 
1424 aa  72.8  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.94 
 
 
913 aa  72.8  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3792  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.99 
 
 
826 aa  72.4  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.296586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7055  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.44 
 
 
842 aa  72  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167983  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  23.66 
 
 
1355 aa  71.6  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0146  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.78 
 
 
817 aa  70.5  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.19 
 
 
837 aa  70.5  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2314  glycoside hydrolase family protein  22.06 
 
 
897 aa  70.1  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.742782  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0804  glycoside hydrolase family protein  25.28 
 
 
858 aa  69.7  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0061  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.86 
 
 
901 aa  69.7  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01360  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  24.77 
 
 
843 aa  70.1  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.81 
 
 
787 aa  69.3  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>