More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1355 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 296 aa  603  1.0000000000000001e-171  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3534  LysR substrate-binding protein  38.97 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1664  LysR substrate-binding protein  40.5 
 
 		 288 aa  192  7e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  38.06 
 
 		 301 aa  188  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  34.93 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  34.81 
 
 		 300 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0033  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 302 aa  180  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000417374  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2792  LysR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 307 aa  171  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 298 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1585  LysR family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 306 aa  170  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.173107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3053  LysR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.979958  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0383  transcriptional regulator, LysR family  36.9 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715241  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5310  transcriptional regulator, LysR family  36.18 
 
 		 294 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1453799999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0002  transcriptional regulator, LysR family  34.69 
 
 		 316 aa  166  4e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0382  LysR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 317 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5771  transcriptional regulator LysR family  32.85 
 
 		 307 aa  165  6.9999999999999995e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08961  transcriptional regulator, LysR family protein  35.51 
 
 		 312 aa  165  6.9999999999999995e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4222  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 302 aa  165  9e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79182  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5335  LysR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1013  LysR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0736859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5618  transcriptional regulator, LysR family  35.77 
 
 		 300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000121214 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5392  transcriptional regulator, LysR family  35.77 
 
 		 294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5341  transcriptional regulator, LysR family  35.77 
 
 		 294 aa  163  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4914  LysR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 294 aa  163  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1779  hydrogen peroxide-inducible genes activator  36.9 
 
 		 296 aa  163  3e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5012  LysR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 294 aa  163  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4681  transcriptional regulator, LysR family  36.62 
 
 		 304 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.468795  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 305 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5069  LysR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 294 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4901  LysR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 294 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5454  LysR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 294 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533779  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1708  LysR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 311 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211796 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0594  LysR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 321 aa  162  7e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4767  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 313 aa  162  8.000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1778  hydrogen peroxide-inducible genes activator  36.53 
 
 		 296 aa  161  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2522  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 319 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0196222  normal  0.718346 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1711  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316204  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0377  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 321 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2323  oxidative stress transcriptional regulator  35.14 
 
 		 301 aa  160  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.523521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0368  transcriptional regulator, LysR family  39.04 
 
 		 321 aa  160  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.257927  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3681  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 317 aa  160  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.555356  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5066  transcriptional regulator, LysR family  38.65 
 
 		 321 aa  159  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0354  transcriptional regulator OxyR  33.33 
 
 		 317 aa  159  7e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.241733  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  38.68 
 
 		 292 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1120  transcriptional regulator, LysR family  34.44 
 
 		 350 aa  159  7e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0017  LysR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 304 aa  159  8e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.163482 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3987  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 319 aa  158  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.273719 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0266  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1281  oxidative stress regulatory protein OxyR  35.31 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3464  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0472  LysR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3739  LysR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.717698  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0321  transcriptional regulator OxyR  33.33 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0711  transcriptional regulator, LysR family  37.07 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3802  LysR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.238076  normal  0.337014 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3806  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3358  oxidative stress regulatory protein OxyR  35.31 
 
 		 319 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1168  oxidative stress regulatory protein OxyR  34.31 
 
 		 319 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2390  oxidative stress regulatory protein OxyR  34.31 
 
 		 319 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2432  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 320 aa  156  4e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3924  transcriptional regulator, LysR family  33.21 
 
 		 316 aa  156  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3367  oxidative stress regulatory protein  35.31 
 
 		 319 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0672559  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2576  oxidative stress regulatory protein OxyR  34.31 
 
 		 319 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3324  oxidative stress regulatory protein OxyR  35.31 
 
 		 319 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519513  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0615  LysR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 319 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0307  oxidative stress regulatory protein OxyR  34.31 
 
 		 319 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2334  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 322 aa  155  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.618914 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4725  transcriptional regulator, LysR family  36.36 
 
 		 304 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3813  LysR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 319 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0640  LysR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 319 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2291  LysR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 320 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11333  normal  0.519031 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1279  LysR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3664  transcriptional regulator, LysR family  35.11 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2161  LysR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0803244  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0693  LysR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0589363  normal  0.107501 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0241  LysR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0594299  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2886  LysR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2661  LysR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.230449 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0725  LysR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3833  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48440  Transcriptional regulator, LysR family protein  36.76 
 
 		 311 aa  153  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0556278  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0036  LysR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 301 aa  153  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8459  LysR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 310 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.983783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2120  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 319 aa  152  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.526762  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1615  LysR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 311 aa  152  5.9999999999999996e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0196883 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03846  DNA-binding transcriptional dual regulator  33.21 
 
 		 305 aa  152  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.782076  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4025  transcriptional regulator, LysR family  33.21 
 
 		 305 aa  152  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4195  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  33.21 
 
 		 305 aa  152  7e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03795  hypothetical protein  33.21 
 
 		 305 aa  152  7e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4055  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  33.21 
 
 		 305 aa  152  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4503  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  33.21 
 
 		 305 aa  152  7e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.030834  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4448  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  33.21 
 
 		 305 aa  152  7e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5423  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  33.21 
 
 		 305 aa  152  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.748146 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4409  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  33.21 
 
 		 305 aa  152  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.386018  normal  0.0576457 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  34.29 
 
 		 300 aa  152  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  35.77 
 
 		 343 aa  152  8e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4718  hydrogen peroxide-inducible genes activator  32.93 
 
 		 299 aa  151  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5225  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5357  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.164156  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>