More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1313 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  100 
 
 
401 aa  833    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  57.51 
 
 
389 aa  484  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  56.22 
 
 
390 aa  483  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  57.51 
 
 
389 aa  484  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  57.76 
 
 
417 aa  479  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  55.27 
 
 
390 aa  478  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  57.18 
 
 
411 aa  479  1e-134  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  56.48 
 
 
390 aa  476  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  57.93 
 
 
417 aa  475  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  56.74 
 
 
390 aa  478  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3082  NADH dehydrogenase I, D subunit  56.41 
 
 
422 aa  466  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  53 
 
 
400 aa  450  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  53.75 
 
 
417 aa  436  1e-121  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  51.39 
 
 
404 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1152  NADH dehydrogenase I, D subunit  52.58 
 
 
413 aa  432  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0912  NADH dehydrogenase I, D subunit  54.38 
 
 
403 aa  430  1e-119  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  52.43 
 
 
414 aa  426  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1874  NADH dehydrogenase I, D subunit  52.17 
 
 
415 aa  423  1e-117  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598165  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  49.49 
 
 
397 aa  422  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0270  NADH dehydrogenase subunit D  51.24 
 
 
440 aa  422  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.877752  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0820  NADH dehydrogenase subunit D  50.12 
 
 
417 aa  417  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.205502  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  48.67 
 
 
417 aa  412  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1615  NADH dehydrogenase subunit D  48.43 
 
 
417 aa  409  1e-113  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0833647  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02730  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  49.87 
 
 
452 aa  410  1e-113  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0243  NADH dehydrogenase subunit D  48.43 
 
 
435 aa  408  1e-113  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3331  NADH dehydrogenase subunit D  50.65 
 
 
416 aa  409  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150101  normal  0.101451 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01290  NADH dehydrogenase subunit D  48.1 
 
 
435 aa  410  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.191542  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0483  NADH dehydrogenase I, D subunit  51.95 
 
 
426 aa  409  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1961  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.02 
 
 
417 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00447389  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0548  NADH dehydrogenase subunit D  48.18 
 
 
424 aa  406  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.899987  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4460  NADH dehydrogenase subunit D  49.75 
 
 
441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  48.67 
 
 
417 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  50.39 
 
 
791 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0272  NADH dehydrogenase subunit D  48.18 
 
 
435 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  50.13 
 
 
793 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1967  NADH dehydrogenase subunit D  48.67 
 
 
417 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0788296 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4062  NADH dehydrogenase subunit D  49.51 
 
 
441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.855736  normal  0.069193 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02414  hypothetical protein similar to NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor (Eurofung)  49.74 
 
 
475 aa  404  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.151267 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  50.65 
 
 
792 aa  404  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0924  NADH dehydrogenase subunit D  50.13 
 
 
406 aa  403  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  49.48 
 
 
390 aa  402  1e-111  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  48.43 
 
 
417 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1094  NADH dehydrogenase subunit D  47.94 
 
 
417 aa  404  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.402289  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1558  NADH dehydrogenase subunit D  50.52 
 
 
392 aa  403  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.970995  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1064  NADH dehydrogenase subunit D  48.18 
 
 
417 aa  403  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240648  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2155  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.91 
 
 
441 aa  403  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0284  NADH dehydrogenase I subunit D  49.04 
 
 
438 aa  402  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2027  NADH dehydrogenase subunit D  46.71 
 
 
436 aa  402  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127355  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0989  NADH dehydrogenase subunit D  48.91 
 
 
417 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.287966  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  48.43 
 
 
417 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2828  NADH dehydrogenase subunit D  47.39 
 
 
435 aa  403  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  48.43 
 
 
417 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0416  NADH dehydrogenase subunit D  47.94 
 
 
417 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1277  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.76 
 
 
444 aa  399  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.494921  normal  0.687145 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2059  NADH dehydrogenase subunit D  47.46 
 
 
417 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102892  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1504  NADH dehydrogenase subunit D  47.94 
 
 
417 aa  401  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00434712 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  47.94 
 
 
417 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  47.46 
 
 
417 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1826  NADH dehydrogenase subunit D  47.94 
 
 
417 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1293  NADH dehydrogenase subunit D  47.94 
 
 
417 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1438  NADH dehydrogenase subunit D  47.94 
 
 
417 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2562  NADH dehydrogenase subunit D  47.7 
 
 
417 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1031  NADH dehydrogenase subunit D  48.18 
 
 
417 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0235722  normal  0.1717 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2270  NADH dehydrogenase subunit D  48.43 
 
 
417 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0316798  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  49.61 
 
 
794 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  47.46 
 
 
417 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1406  NADH dehydrogenase subunit D  47.94 
 
 
417 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1133  NADH dehydrogenase subunit D  47.94 
 
 
417 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154075  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1302  NADH dehydrogenase subunit D  47.94 
 
 
417 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03190  NADH dehydrogenase subunit D  47.67 
 
 
460 aa  401  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  47.46 
 
 
417 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3253  NADH dehydrogenase subunit D  48.18 
 
 
417 aa  398  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.626895  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6091  NADH dehydrogenase subunit D  49.15 
 
 
457 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.489458  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  47.94 
 
 
417 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0734  NADH dehydrogenase subunit D  47.94 
 
 
417 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.301756  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1346  NADH dehydrogenase subunit D  47.22 
 
 
417 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00313693  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3507  NADH dehydrogenase subunit D  46.97 
 
 
417 aa  396  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  48.95 
 
 
388 aa  396  1e-109  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6679  NADH dehydrogenase subunit D  48.28 
 
 
483 aa  396  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0930  NADH dehydrogenase subunit D  46.73 
 
 
417 aa  396  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156514  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1442  NADH dehydrogenase subunit D  50.26 
 
 
408 aa  395  1e-109  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.331272  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0711  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.94 
 
 
417 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.577358  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1942  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  48.08 
 
 
787 aa  396  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1427  NADH dehydrogenase subunit D  47.46 
 
 
417 aa  395  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448612  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1747  NADH dehydrogenase subunit D  48.97 
 
 
408 aa  394  1e-108  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2833  NADH dehydrogenase subunit D  48.43 
 
 
417 aa  393  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2702  NADH dehydrogenase subunit D  48.43 
 
 
417 aa  394  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0875  NADH dehydrogenase subunit D  47.22 
 
 
417 aa  393  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0964  NADH dehydrogenase subunit D  46.73 
 
 
417 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389115  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0141  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.59 
 
 
408 aa  394  1e-108  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  48.84 
 
 
794 aa  393  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1888  NADH dehydrogenase subunit D  46.97 
 
 
417 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0541  NADH dehydrogenase subunit D  47.78 
 
 
482 aa  394  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.482391  normal  0.20204 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1496  NADH dehydrogenase subunit D  47.7 
 
 
417 aa  392  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1927  NADH dehydrogenase subunit D  48.72 
 
 
408 aa  392  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.371072  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2211  NADH dehydrogenase subunit D  46.97 
 
 
417 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.518232 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1561  NADH dehydrogenase subunit D  48.97 
 
 
408 aa  394  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0422295  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0977  NADH dehydrogenase subunit D  49.38 
 
 
459 aa  393  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0960  NADH dehydrogenase subunit D  47.22 
 
 
417 aa  393  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000966275 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  46.97 
 
 
417 aa  392  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.26222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>