More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1309 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1309  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  100 
 
 		 788 aa  1634    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3617  molybdopterin oxidoreductase  32.76 
 
 		 850 aa  429  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1538  molybdopterin oxidoreductase  35.47 
 
 		 879 aa  404  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1155  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.7 
 
 		 823 aa  397  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3087  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  34.44 
 
 		 913 aa  393  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  33.71 
 
 		 899 aa  391  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.18 
 
 		 898 aa  390  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3349  NADH dehydrogenase I, G subunit, putative  35.38 
 
 		 828 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.407234  normal  0.217544 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.59 
 
 		 893 aa  387  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4238  molybdopterin oxidoreductase  32.46 
 
 		 828 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1043  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  34.11 
 
 		 903 aa  382  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0509  Fe(III) reductase, alpha subunit  30.83 
 
 		 844 aa  377  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3920  molybdopterin oxidoreductase  34.73 
 
 		 821 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.403816  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3022  Fe(III) reductase, alpha subunit  31.5 
 
 		 831 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0344  NADH dehydrogenase I, G subunit, putative  33.38 
 
 		 826 aa  368  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.07 
 
 		 893 aa  369  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.58 
 
 		 904 aa  363  4e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4004  molybdopterin oxidoreductase  33.33 
 
 		 821 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08061e-23 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3639  molybdopterin oxidoreductase  31.7 
 
 		 843 aa  361  3e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.424964  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3389  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.09 
 
 		 923 aa  359  9.999999999999999e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.86 
 
 		 901 aa  355  1e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.19 
 
 		 900 aa  354  4e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3132  molybdopterin oxidoreductase  32.28 
 
 		 815 aa  349  1e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.42 
 
 		 905 aa  347  5e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2237  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  34.09 
 
 		 918 aa  342  2e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.01 
 
 		 886 aa  342  2e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.51 
 
 		 920 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0660  molybdopterin oxidoreductase  31.31 
 
 		 822 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.672989  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0544  NADH dehydrogenase subunit G  33.19 
 
 		 835 aa  337  7e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.242771  normal  0.39762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6676  NADH dehydrogenase subunit G  33.9 
 
 		 815 aa  337  7e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3552  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.29 
 
 		 960 aa  334  3e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2185  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.29 
 
 		 960 aa  334  4e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.602321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2249  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.46 
 
 		 903 aa  333  6e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.580662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1809  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.29 
 
 		 960 aa  332  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4457  NADH dehydrogenase subunit G  33.9 
 
 		 839 aa  332  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0673  molybdopterin oxidoreductase  31.4 
 
 		 822 aa  332  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01358e-20 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1708  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.06 
 
 		 959 aa  331  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0287  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  33.9 
 
 		 801 aa  330  6e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4487  NADH dehydrogenase subunit G  33.53 
 
 		 799 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.293671  normal  0.0319104 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4552  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  34.06 
 
 		 818 aa  328  3e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6088  NADH dehydrogenase subunit G  32.95 
 
 		 863 aa  327  7e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.012959 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0031  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.92 
 
 		 1000 aa  326  1e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1622  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.04 
 
 		 984 aa  324  3e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.437101  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1280  NADH-quinone oxidoreductase chain G  32.38 
 
 		 797 aa  323  6e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.47873 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2902  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.77 
 
 		 984 aa  323  6e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679741  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0450  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.91 
 
 		 984 aa  323  7e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.858013  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0967  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.91 
 
 		 984 aa  323  7e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3012  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  30.77 
 
 		 984 aa  323  7e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.467116  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0180  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.91 
 
 		 984 aa  323  7e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2595  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.91 
 
 		 984 aa  323  7e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.619743  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25280  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.73 
 
 		 911 aa  321  3e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0556633 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4059  NADH dehydrogenase subunit G  32.77 
 
 		 839 aa  320  5e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.785313 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2964  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.63 
 
 		 984 aa  320  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3089  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.97 
 
 		 959 aa  319  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0661  molybdopterin oxidoreductase  30.36 
 
 		 808 aa  319  1e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0552  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.59 
 
 		 983 aa  319  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.918724  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1031  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.59 
 
 		 983 aa  319  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52357  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.32 
 
 		 983 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.656443 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0724  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.09 
 
 		 948 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.696908  normal  0.792249 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0389  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.83 
 
 		 944 aa  318  3e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0623  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.86 
 
 		 948 aa  318  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.816724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0895  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.26 
 
 		 983 aa  317  4e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.99873  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0907  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.26 
 
 		 983 aa  317  6e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.979482  decreased coverage  0.00925571 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4024  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.49 
 
 		 966 aa  316  9e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0590  molybdopterin oxidoreductase  32.1 
 
 		 807 aa  315  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.726223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0727  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.93 
 
 		 979 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216931  normal  0.398444 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2897  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.79 
 
 		 959 aa  315  2.9999999999999996e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2274  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.14 
 
 		 956 aa  313  6.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.217783 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2710  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  32.58 
 
 		 884 aa  313  6.999999999999999e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1391  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.6 
 
 		 947 aa  312  2e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5059  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  33.58 
 
 		 830 aa  312  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.697317  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2058  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.24 
 
 		 967 aa  311  2.9999999999999997e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.896651  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4406  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.2 
 
 		 950 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2366  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.04 
 
 		 983 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.739285 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4869  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.07 
 
 		 950 aa  311  4e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0187329 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2383  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.65 
 
 		 959 aa  311  4e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7685  NADH dehydrogenase subunit G  33.24 
 
 		 839 aa  310  5e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0843  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.51 
 
 		 994 aa  310  8e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3925  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.84 
 
 		 959 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.97 
 
 		 782 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2689  NADH dehydrogenase subunit G  32.29 
 
 		 827 aa  309  2.0000000000000002e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  31.97 
 
 		 782 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4645  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.32 
 
 		 948 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03220  NADH dehydrogenase subunit G  31.7 
 
 		 829 aa  308  3e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0591623  normal  0.693511 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4144  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.83 
 
 		 983 aa  308  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4097  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.43 
 
 		 959 aa  308  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4914  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.8 
 
 		 950 aa  308  3e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.263268 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0980  NADH dehydrogenase subunit G  31.91 
 
 		 854 aa  308  4.0000000000000004e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1598  NADH dehydrogenase subunit G  33.53 
 
 		 801 aa  306  7e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1574  NADH dehydrogenase subunit G  33.53 
 
 		 801 aa  306  7e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  32.24 
 
 		 797 aa  306  7e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.4 
 
 		 906 aa  306  1.0000000000000001e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0963  NADH dehydrogenase subunit G  31.74 
 
 		 715 aa  306  1.0000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.409091  normal  0.052717 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0641  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.82 
 
 		 979 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3636  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.84 
 
 		 959 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.234983 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13172  NADH dehydrogenase subunit G  33.73 
 
 		 806 aa  305  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1148  NADH dehydrogenase subunit G  32.09 
 
 		 784 aa  304  4.0000000000000003e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0967  NADH dehydrogenase subunit G  33.62 
 
 		 791 aa  303  6.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0699273  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3598  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.12 
 
 		 979 aa  303  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0619  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.96 
 
 		 956 aa  303  9e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.961077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>