More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1293 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1293  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  100 
 
 
101 aa  196  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1212  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  52.88 
 
 
106 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0142409  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3744  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  55.14 
 
 
110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1924  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  55.56 
 
 
100 aa  107  6e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.171281  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1306  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  58.06 
 
 
103 aa  106  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2049  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  53.54 
 
 
101 aa  103  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.879451  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2204  NADH dehydrogenase subunit K  53.92 
 
 
103 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1881  NADH dehydrogenase subunit K  53.92 
 
 
103 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2290  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  54.55 
 
 
101 aa  100  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5091  NADH dehydrogenase subunit K  56.31 
 
 
104 aa  100  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1159  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  54.84 
 
 
99 aa  100  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1413  putative transmembrane NADH dehydrogenase I (chain K) oxidoreductase protein  53.68 
 
 
102 aa  99.4  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.272363  normal  0.0563536 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2995  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  53.54 
 
 
101 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5414  NADH dehydrogenase subunit K  56.31 
 
 
104 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5536  NADH dehydrogenase subunit K  56.31 
 
 
104 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0475445 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5384  NADH dehydrogenase subunit K  56.31 
 
 
104 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.60096e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5418  NADH dehydrogenase subunit K  56.31 
 
 
104 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4975  NADH dehydrogenase subunit K  56.31 
 
 
104 aa  99.4  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0971  NADH dehydrogenase subunit K  54.17 
 
 
101 aa  99.4  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593359  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1565  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  52 
 
 
102 aa  99  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199091  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5469  NADH dehydrogenase subunit K  56.31 
 
 
104 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2052  NADH dehydrogenase subunit K  55.79 
 
 
101 aa  98.6  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0548  NADH dehydrogenase subunit K  55.79 
 
 
99 aa  98.2  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.530448  normal  0.623297 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0695  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  50.51 
 
 
100 aa  98.2  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3812  NADH dehydrogenase subunit K  55.34 
 
 
104 aa  98.6  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1511  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  52.63 
 
 
101 aa  97.8  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00505168 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5143  NADH dehydrogenase subunit K  55.34 
 
 
104 aa  97.8  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4993  NADH dehydrogenase subunit K  55.34 
 
 
104 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5943  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  49 
 
 
114 aa  97.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5535  NADH dehydrogenase subunit K  55.34 
 
 
104 aa  97.8  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3128  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  58.95 
 
 
100 aa  97.4  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1299  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  54.74 
 
 
101 aa  97.1  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162862  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3338  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  49.02 
 
 
107 aa  97.1  7e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.12599  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1503  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  50.53 
 
 
102 aa  97.1  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0163297  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, K subunit  43.56 
 
 
101 aa  96.7  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1039  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  51.02 
 
 
100 aa  96.3  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3248  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  48.48 
 
 
101 aa  96.3  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.798847  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0814  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  43.56 
 
 
101 aa  96.7  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_801  NADH:quinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)  43.56 
 
 
101 aa  96.7  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2039  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  47.42 
 
 
105 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0098763  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1152  NADH dehydrogenase subunit K  50.51 
 
 
101 aa  95.5  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3500  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  49.47 
 
 
102 aa  95.9  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1346  NADH dehydrogenase subunit K  57.73 
 
 
103 aa  95.9  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.948415  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3294  NADH dehydrogenase subunit K  51.92 
 
 
104 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4000  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  60.64 
 
 
100 aa  95.5  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.72795e-16 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5170  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  50.53 
 
 
102 aa  95.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.896952  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1540  NADH dehydrogenase subunit K  50 
 
 
99 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0449834  normal  0.109303 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0919  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  50 
 
 
100 aa  95.1  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3916  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  59.57 
 
 
100 aa  94.4  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1658  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  55.06 
 
 
100 aa  94.4  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.708964  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2928  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  53.68 
 
 
102 aa  94.7  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1570  NADH dehydrogenase subunit K  50 
 
 
99 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1594  NADH dehydrogenase subunit K  50 
 
 
99 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4072  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  50.53 
 
 
109 aa  94.4  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.035212  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4234  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  54.74 
 
 
100 aa  94  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341359  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6084  NADH dehydrogenase subunit K  55.79 
 
 
99 aa  94.4  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0807  NADH dehydrogenase I, K subunit  57 
 
 
136 aa  93.6  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0757  NADH dehydrogenase subunit K  56.57 
 
 
101 aa  93.6  9e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.588315  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3625  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  59.57 
 
 
100 aa  93.6  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.068454 
 
 
-
 
NC_004310  BR0812  NADH dehydrogenase subunit K  57 
 
 
102 aa  92.8  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.907264  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1994  NADH dehydrogenase subunit K  56.57 
 
 
101 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0298291  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3629  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  52.33 
 
 
100 aa  92.8  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2526  NADH dehydrogenase subunit K  56.57 
 
 
101 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.313411  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1188  NADH dehydrogenase subunit K  56.57 
 
 
101 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.288181  normal  0.242913 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1326  NADH dehydrogenase subunit K  59.6 
 
 
101 aa  92.8  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.341038  normal  0.0221651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7681  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  53.68 
 
 
99 aa  92.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1009  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  56.57 
 
 
101 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0939643  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4136  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  55.56 
 
 
101 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2413  NADH dehydrogenase subunit K  56 
 
 
102 aa  92  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.122214  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1110  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  48.42 
 
 
101 aa  92.8  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2051  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  47 
 
 
102 aa  92  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0671  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)-like protein  53.85 
 
 
156 aa  92.8  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1032  NADH dehydrogenase subunit K  54 
 
 
102 aa  92.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0984  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  54.74 
 
 
99 aa  92.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2234  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  58.59 
 
 
101 aa  92.8  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1075  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  56.57 
 
 
101 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.203782 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1273  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  47.37 
 
 
102 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.326847 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1204  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  56.57 
 
 
101 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2526  NADH dehydrogenase subunit K  54.64 
 
 
103 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4623  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  54 
 
 
104 aa  92  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0763865 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1752  NADH dehydrogenase subunit K  50.53 
 
 
101 aa  92  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504148  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2409  NADH dehydrogenase subunit K  55.21 
 
 
109 aa  91.7  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0549  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  50 
 
 
99 aa  92  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.924204  normal  0.59827 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3246  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  48.42 
 
 
102 aa  91.7  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.244776  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0882  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  47.37 
 
 
102 aa  91.7  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1875  NADH dehydrogenase subunit K  50 
 
 
99 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0967  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  47.37 
 
 
102 aa  91.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0704138 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3216  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  56.57 
 
 
102 aa  91.3  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03260  NADH dehydrogenase subunit K  54.74 
 
 
99 aa  91.3  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1101  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  51.58 
 
 
106 aa  91.3  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0711  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  46.53 
 
 
106 aa  90.9  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00926088  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3288  NADH dehydrogenase subunit K  54.9 
 
 
103 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274759  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01741  NADH dehydrogenase subunit K  51.96 
 
 
107 aa  91.3  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.359361  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1607  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  42.42 
 
 
105 aa  90.5  6e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.267693  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4400  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  55.56 
 
 
101 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4551  NADH dehydrogenase subunit K  54 
 
 
102 aa  90.5  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.348577  normal  0.172733 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1284  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  55.32 
 
 
99 aa  90.1  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1877  NADH dehydrogenase subunit K  53 
 
 
102 aa  90.1  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.446252  normal  0.260889 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0900  NADH dehydrogenase subunit K  52 
 
 
102 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0252714  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2875  NADH dehydrogenase subunit K  53.92 
 
 
103 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.542064  normal  0.368336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>