More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1285 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  100 
 
 
913 aa  1841    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.46 
 
 
915 aa  463  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.35 
 
 
849 aa  449  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.62 
 
 
874 aa  423  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.33 
 
 
844 aa  422  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.72 
 
 
855 aa  404  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  34.27 
 
 
814 aa  387  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.46 
 
 
919 aa  376  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.57 
 
 
823 aa  358  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.97 
 
 
822 aa  358  3.9999999999999996e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.83 
 
 
888 aa  355  2.9999999999999997e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  34.28 
 
 
831 aa  354  4e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  34.04 
 
 
796 aa  353  1e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  32.64 
 
 
869 aa  347  7e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  30.96 
 
 
802 aa  345  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.33 
 
 
817 aa  345  2e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  31.54 
 
 
821 aa  344  5e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.46 
 
 
805 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  34.9 
 
 
808 aa  337  3.9999999999999995e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  32.53 
 
 
845 aa  337  5e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.54 
 
 
884 aa  337  9e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.74 
 
 
813 aa  332  3e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.6 
 
 
816 aa  332  3e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  33.97 
 
 
811 aa  331  3e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.65 
 
 
809 aa  330  8e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  34.68 
 
 
803 aa  330  1.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.49 
 
 
871 aa  328  4.0000000000000003e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  30.98 
 
 
797 aa  326  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.26 
 
 
805 aa  326  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.1 
 
 
882 aa  326  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.99 
 
 
878 aa  325  3e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  32.3 
 
 
805 aa  322  1.9999999999999998e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.57 
 
 
828 aa  322  3e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  33.49 
 
 
809 aa  321  5e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.23 
 
 
807 aa  320  7e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.19 
 
 
862 aa  318  3e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  32.47 
 
 
804 aa  318  3e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.31 
 
 
807 aa  317  5e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.97 
 
 
817 aa  317  6e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.84 
 
 
805 aa  314  4.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.66 
 
 
805 aa  313  6.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  30.74 
 
 
798 aa  313  1e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.67 
 
 
821 aa  311  2.9999999999999997e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  31.62 
 
 
817 aa  311  4e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  31.95 
 
 
804 aa  310  5.9999999999999995e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.76 
 
 
808 aa  306  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  32.44 
 
 
819 aa  305  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  32.02 
 
 
805 aa  305  3.0000000000000004e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  34.6 
 
 
848 aa  303  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.21 
 
 
893 aa  301  3e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  32.69 
 
 
808 aa  300  6e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.45 
 
 
880 aa  300  6e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  31.35 
 
 
887 aa  298  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  32.51 
 
 
806 aa  295  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  30.22 
 
 
810 aa  294  5e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  31.8 
 
 
887 aa  289  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.06 
 
 
812 aa  285  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  31.92 
 
 
808 aa  281  3e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  32.22 
 
 
843 aa  281  4e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  30.07 
 
 
809 aa  277  8e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.45 
 
 
883 aa  276  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.96 
 
 
810 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  30.36 
 
 
803 aa  275  3e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.37 
 
 
879 aa  275  4.0000000000000004e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  31.8 
 
 
808 aa  273  8.000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  32.55 
 
 
810 aa  273  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  29.07 
 
 
803 aa  259  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  31.59 
 
 
861 aa  258  4e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  30.97 
 
 
800 aa  257  6e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.24 
 
 
846 aa  257  7e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  28.76 
 
 
865 aa  253  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  30.98 
 
 
844 aa  250  9e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  30.71 
 
 
835 aa  246  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  28.98 
 
 
816 aa  241  2.9999999999999997e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.72 
 
 
820 aa  235  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  29.27 
 
 
931 aa  220  7.999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  29.43 
 
 
819 aa  217  9e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  25.39 
 
 
813 aa  207  7e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  24.68 
 
 
809 aa  192  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  23.97 
 
 
807 aa  187  5e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  23.9 
 
 
810 aa  185  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  25.26 
 
 
810 aa  181  4e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0140  protein of unknown function DUF214  24.43 
 
 
816 aa  171  6e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  23.88 
 
 
770 aa  166  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3271  protein of unknown function DUF214  24.5 
 
 
795 aa  160  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal  0.0322761 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0948  protein of unknown function DUF214  24.36 
 
 
797 aa  159  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1450  protein of unknown function DUF214  27.1 
 
 
789 aa  158  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.264856  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1753  protein of unknown function DUF214  24.48 
 
 
801 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2978  protein of unknown function DUF214  24.49 
 
 
788 aa  156  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4849  protein of unknown function DUF214  24.81 
 
 
802 aa  155  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.011256  normal  0.10572 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0957  protein of unknown function DUF214  24.4 
 
 
785 aa  154  7e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439448  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1806  protein of unknown function DUF214  23.44 
 
 
790 aa  153  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4591  protein of unknown function DUF214  24.97 
 
 
795 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597016  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5431  protein of unknown function DUF214  24.29 
 
 
800 aa  149  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4624  protein of unknown function DUF214  22.97 
 
 
811 aa  149  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.41173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4858  protein of unknown function DUF214  25.23 
 
 
809 aa  147  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0512952 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  24.56 
 
 
805 aa  147  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4844  protein of unknown function DUF214  24.17 
 
 
793 aa  147  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357668  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  26.14 
 
 
795 aa  146  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2089  protein of unknown function DUF214  24.91 
 
 
794 aa  146  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>