218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1273 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1273  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  854    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  69.8 
 
 		 406 aa  601  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0224  RTCB protein  65.77 
 
 		 406 aa  552  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5869  hypothetical protein  65.35 
 
 		 409 aa  552  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1946  hypothetical protein  64.3 
 
 		 409 aa  553  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1193  hypothetical protein  64.55 
 
 		 408 aa  552  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0576  hypothetical protein  65.76 
 
 		 401 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60650  hypothetical protein  65.01 
 
 		 404 aa  545  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5225  hypothetical protein  65.01 
 
 		 404 aa  545  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0404  hypothetical protein  63.57 
 
 		 411 aa  544  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0487  protein of unknown function UPF0027  63.08 
 
 		 411 aa  542  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3829  hypothetical protein  64.39 
 
 		 407 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2417  hypothetical protein  64.15 
 
 		 428 aa  536  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0769394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4671  hypothetical protein  64.39 
 
 		 407 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3692  hypothetical protein  64.39 
 
 		 407 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3587  hypothetical protein  64.15 
 
 		 411 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.588472 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4421  protein of unknown function UPF0027  62.9 
 
 		 407 aa  531  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0293  protein of unknown function UPF0027  64.32 
 
 		 408 aa  529  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3701  RtcB protein  64.66 
 
 		 408 aa  530  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5432  hypothetical protein  63.9 
 
 		 407 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3896  RtcB protein  64.48 
 
 		 408 aa  530  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03272  hypothetical protein  64.07 
 
 		 408 aa  526  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103712  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  64.07 
 
 		 408 aa  527  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0293  hypothetical protein  64.07 
 
 		 408 aa  526  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03224  hypothetical protein  64.07 
 
 		 408 aa  526  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0813124  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3618  RtcB protein  64.07 
 
 		 408 aa  526  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3827  hypothetical protein  64.21 
 
 		 405 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3890  RtcB protein  64.21 
 
 		 405 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3801  RtcB protein  63.57 
 
 		 408 aa  523  1e-147  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.586783  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0013  protein of unknown function UPF0027  63.37 
 
 		 407 aa  519  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3720  conserved protein RtcB  64.21 
 
 		 405 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0678  hypothetical protein  61.76 
 
 		 412 aa  517  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1473  hypothetical protein  60.85 
 
 		 410 aa  504  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.375634  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0498  hypothetical protein  60.05 
 
 		 430 aa  505  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3893  protein of unknown function UPF0027  57.07 
 
 		 406 aa  465  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0273  Fis family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 398 aa  445  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0858  hypothetical protein  56.58 
 
 		 404 aa  445  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1873  hypothetical protein  56.97 
 
 		 398 aa  435  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  55.8 
 
 		 398 aa  431  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2130  protein of unknown function UPF0027  55.31 
 
 		 398 aa  431  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  52.64 
 
 		 395 aa  388  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2770  protein of unknown function UPF0027  48.77 
 
 		 393 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0530  protein of unknown function UPF0027  49.14 
 
 		 393 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1357  hypothetical protein  51.76 
 
 		 395 aa  376  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3418  hypothetical protein  48.27 
 
 		 393 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  50.75 
 
 		 402 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  49.87 
 
 		 384 aa  365  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3926  hypothetical protein  48.03 
 
 		 407 aa  357  2.9999999999999997e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.449305  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  50.13 
 
 		 398 aa  355  6.999999999999999e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  47.7 
 
 		 399 aa  350  2e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  49.49 
 
 		 395 aa  348  1e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5947  hypothetical protein  48.87 
 
 		 395 aa  345  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1934  protein of unknown function UPF0027  46.84 
 
 		 410 aa  344  2e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2265  protein of unknown function UPF0027  47.98 
 
 		 397 aa  338  7e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000176241  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0012  protein of unknown function UPF0027  46.27 
 
 		 409 aa  335  5.999999999999999e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0543  protein of unknown function UPF0027  45.78 
 
 		 388 aa  335  7.999999999999999e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1410  protein of unknown function UPF0027  47.57 
 
 		 389 aa  333  3e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3119  hypothetical protein  44.1 
 
 		 388 aa  328  9e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1716  protein of unknown function UPF0027  47.56 
 
 		 390 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.115138  normal  0.0983851 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4478  protein of unknown function UPF0027  47.61 
 
 		 394 aa  322  9.999999999999999e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00757416 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3677  protein of unknown function UPF0027  46.89 
 
 		 385 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5339  hypothetical protein  44.44 
 
 		 384 aa  315  8e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.535527  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1648  protein of unknown function UPF0027  49.39 
 
 		 715 aa  313  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1675  protein of unknown function UPF0027  49.39 
 
 		 715 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.445004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05440  hypothetical protein  44.55 
 
 		 407 aa  305  6e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  40.05 
 
 		 396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1279  protein of unknown function UPF0027  36.18 
 
 		 372 aa  210  4e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000928274  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  33.41 
 
 		 473 aa  182  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2904  hypothetical protein  33.59 
 
 		 470 aa  177  4e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2130  hypothetical protein  34.28 
 
 		 399 aa  170  5e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.549422  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3385  protein of unknown function UPF0027  32.84 
 
 		 462 aa  169  8e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3458  hypothetical protein  33.85 
 
 		 463 aa  169  8e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.235018  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  30.82 
 
 		 462 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2291  protein of unknown function UPF0027  33.25 
 
 		 475 aa  166  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0703  hypothetical protein  30.77 
 
 		 480 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2835  hypothetical protein  32.07 
 
 		 470 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3725  protein of unknown function UPF0027  30.89 
 
 		 508 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.471294 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4745  hypothetical protein  32.99 
 
 		 473 aa  162  7e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256245  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  28.5 
 
 		 443 aa  162  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  30.09 
 
 		 480 aa  161  2e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  30.09 
 
 		 480 aa  161  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  30.5 
 
 		 480 aa  160  3e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0250  hypothetical protein  31.27 
 
 		 396 aa  160  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00470202  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1619  hypothetical protein  29.79 
 
 		 485 aa  159  6e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.691717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1492  protein of unknown function UPF0027  31.55 
 
 		 512 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00457459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  29.55 
 
 		 473 aa  158  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3800  protein of unknown function UPF0027  30.17 
 
 		 391 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0823  hypothetical protein  29.12 
 
 		 486 aa  157  4e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.521188  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0374  protein of unknown function UPF0027  29.85 
 
 		 477 aa  157  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2546  protein of unknown function UPF0027  30.6 
 
 		 400 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1393  hypothetical protein  29.69 
 
 		 485 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  30.65 
 
 		 447 aa  156  6e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0835  hypothetical protein  31.38 
 
 		 465 aa  156  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.500441  normal  0.402596 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1265  RtcB  29.8 
 
 		 477 aa  156  6e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.268683  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4508  hypothetical protein  31.59 
 
 		 408 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314055 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0699  protein of unknown function UPF0027  32.14 
 
 		 474 aa  154  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.142692  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0903  hypothetical protein  30.44 
 
 		 475 aa  154  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354068  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12650  hypothetical protein  30.56 
 
 		 432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000105377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1306  protein of unknown function UPF0027  32.48 
 
 		 439 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560605 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2183  protein of unknown function UPF0027  30.44 
 
 		 451 aa  154  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00364968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>