More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1149 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1149  major facilitator transporter  100 
 
 
407 aa  810    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299661  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0303  major facilitator transporter  41.35 
 
 
402 aa  291  2e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.421003  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1520  major facilitator transporter  40.81 
 
 
412 aa  272  7e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.880561 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0897  MFS drug efflux pump  41.38 
 
 
381 aa  271  1e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1734  major facilitator superfamily MFS_1  43.92 
 
 
414 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156711  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1894  major facilitator transporter  44.41 
 
 
395 aa  264  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1661  major facilitator superfamily MFS_1  43.92 
 
 
414 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0192814  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2213  major facilitator superfamily transporter  44.71 
 
 
384 aa  259  8e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0023669  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68930  putative permease  39.19 
 
 
397 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.770778  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4412  major facilitator transporter  37.93 
 
 
434 aa  203  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388207  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3949  major facilitator transporter  37.93 
 
 
417 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0881757  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8091  major facilitator superfamily MFS_1  36.15 
 
 
408 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5519  major facilitator transporter  36.84 
 
 
398 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.752642  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5883  major facilitator transporter  36.84 
 
 
398 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6392  major facilitator transporter  36.84 
 
 
398 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.319868 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4820  major facilitator transporter  35.37 
 
 
425 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2342  major facilitator superfamily MFS_1  42.89 
 
 
393 aa  190  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1955  major facilitator superfamily MFS_1  32.97 
 
 
393 aa  189  7e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135687  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 
397 aa  189  7e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1359  major facilitator transporter  36.51 
 
 
400 aa  189  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0713352  normal  0.0663225 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1825  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 
407 aa  188  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.010235  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0558  major facilitator transporter  34.48 
 
 
384 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257784  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2555  major facilitator superfamily MFS_1  34 
 
 
434 aa  186  6e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0238485  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5298  major facilitator transporter  34.31 
 
 
413 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3378  major facilitator transporter  35.31 
 
 
441 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4989  major facilitator transporter  35.31 
 
 
441 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1898  major facilitator superfamily MFS_1  31.66 
 
 
424 aa  182  9.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1443  major facilitator transporter  33.33 
 
 
416 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01565  predicted transporter  33.25 
 
 
417 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2047  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 
417 aa  178  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349329  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0857  major facilitator superfamily MFS_1  32.8 
 
 
403 aa  179  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2034  major facilitator transporter  33.25 
 
 
417 aa  178  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01555  hypothetical protein  33.25 
 
 
417 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1670  major facilitator family transporter  33.25 
 
 
417 aa  178  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1604  major facilitator family transporter  33.6 
 
 
417 aa  179  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1803  major facilitator family transporter  33.25 
 
 
417 aa  178  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2281  major facilitator transporter  32.62 
 
 
421 aa  178  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5565  major facilitator transporter  35.43 
 
 
402 aa  177  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1120  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 
405 aa  177  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2306  major facilitator family transporter  32.98 
 
 
417 aa  177  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.200396 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3403  major facilitator transporter  34.83 
 
 
426 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5112  major facilitator superfamily protein  32.78 
 
 
418 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0694  major facilitator family transporter  32.81 
 
 
452 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.188061  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4358  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 
412 aa  173  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  32.56 
 
 
425 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3069  putative transporter transmembrane protein  36.17 
 
 
428 aa  172  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.517563  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03772  MFS transporter  32.53 
 
 
426 aa  172  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1035  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 
410 aa  172  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0512  major facilitator transporter  32.55 
 
 
452 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.388393  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1294  major facilitator transporter  34.82 
 
 
400 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.556112  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0444  major facilitator family transporter  34.83 
 
 
433 aa  171  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.420207  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3894  major facilitator transporter  34.17 
 
 
445 aa  170  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0416  general substrate transporter  30.99 
 
 
424 aa  171  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4629  major facilitator superfamily MFS_1  32.23 
 
 
499 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.458536  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  33.05 
 
 
414 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5122  major facilitator transporter  32.58 
 
 
414 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3147  major facilitator family transporter  32.88 
 
 
397 aa  169  9e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2900  major facilitator family transporter  32.88 
 
 
397 aa  169  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1472  major facilitator family transporter  32.88 
 
 
397 aa  169  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2045  major facilitator superfamily MFS_1  31.48 
 
 
404 aa  169  9e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.588816  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0116  major facilitator family transporter  32.88 
 
 
397 aa  169  9e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0529  major facilitator transporter  32.88 
 
 
397 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.318385  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5767  major facilitator family transporter  32.86 
 
 
438 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.554362  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3226  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 
410 aa  169  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1917  major facilitator transporter  32.91 
 
 
417 aa  168  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66510  putative MFS transporter  32.86 
 
 
438 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4017  major facilitator transporter  32.53 
 
 
387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5217  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 
404 aa  166  8e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877552  normal  0.0536068 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2333  major facilitator family transporter  31.48 
 
 
438 aa  166  8e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1968  major facilitator superfamily MFS_1  31.48 
 
 
438 aa  166  8e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.878316  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2135  major facilitator superfamily MFS_1  31.46 
 
 
425 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0420  major facilitator transporter  32.54 
 
 
422 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  31.83 
 
 
414 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3349  major facilitator superfamily MFS_1  37.25 
 
 
429 aa  162  7e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.735046 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4750  major facilitator transporter  31.81 
 
 
404 aa  162  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5292  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 
407 aa  161  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.479452 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2343  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 
422 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2800  major facilitator transporter  29.77 
 
 
399 aa  160  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0403  major facilitator family transporter  34.75 
 
 
537 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0357  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 
431 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3269  major facilitator family transporter  34.18 
 
 
481 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2156  major facilitator family transporter  33.51 
 
 
429 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0208  major facilitator family transporter  34.46 
 
 
428 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0220  major facilitator family transporter  33.51 
 
 
429 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3414  major facilitator family transporter  33.51 
 
 
429 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2933  major facilitator family transporter  33.51 
 
 
429 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3002  major facilitator superfamily MFS_1  36.69 
 
 
448 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.571362  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4159  major facilitator superfamily MFS_1  31.73 
 
 
387 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.297695  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0181  major facilitator family transporter  33.33 
 
 
526 aa  156  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0770  major facilitator superfamily MFS_1  33.04 
 
 
440 aa  155  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1853  inner membrane transport protein YnfM  32.34 
 
 
417 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2042  major facilitator superfamily MFS_1  31.53 
 
 
422 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316098  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2561  major facilitator superfamily MFS_1  32.56 
 
 
428 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000580351 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1597  inner membrane transport protein YnfM  32.34 
 
 
417 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1656  inner membrane transport protein YnfM  32.34 
 
 
417 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4365  major facilitator transporter  31.14 
 
 
406 aa  153  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1588  inner membrane transport protein YnfM  32.07 
 
 
417 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1686  inner membrane transport protein YnfM  32.07 
 
 
417 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1070  MFS transporter  31.21 
 
 
402 aa  151  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0642  major facilitator superfamily MFS_1  31.36 
 
 
422 aa  149  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>