49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1118 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1118  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  370  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000113456 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0128  hypothetical protein  70.95 
 
 
187 aa  231  7.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0145  hypothetical protein  69.83 
 
 
187 aa  229  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1181  hypothetical protein  67.42 
 
 
184 aa  192  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.581092  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2751  hypothetical protein  59.88 
 
 
178 aa  172  2.9999999999999996e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4936  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  34.66 
 
 
190 aa  81.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272462 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3569  hypothetical protein  40.67 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0853  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  37.14 
 
 
238 aa  71.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2867  hypothetical protein  33.73 
 
 
255 aa  69.3  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2568  hypothetical protein  35.39 
 
 
421 aa  69.7  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.605817  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0942  hypothetical protein  33.14 
 
 
255 aa  67.8  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.410236  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0202  hypothetical protein  31.82 
 
 
172 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0916  hypothetical protein  41.67 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2385  hypothetical protein  31.11 
 
 
177 aa  64.7  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3235  hypothetical protein  26.63 
 
 
182 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0885199 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0807  hypothetical protein  48.78 
 
 
162 aa  62  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387772 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4049  hypothetical protein  32.91 
 
 
183 aa  60.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07990  hypothetical protein  36.88 
 
 
160 aa  55.8  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.744035  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4299  hypothetical protein  46.62 
 
 
201 aa  55.5  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0140  hypothetical protein  33.33 
 
 
257 aa  54.7  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3611  hypothetical protein  45.56 
 
 
281 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0486  hypothetical protein  37.97 
 
 
159 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0280674  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1077  hypothetical protein  29.88 
 
 
255 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2182  hypothetical protein  25.29 
 
 
158 aa  53.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596109  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0262  hypothetical protein  28.67 
 
 
187 aa  52.8  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3958  hypothetical protein  45.03 
 
 
274 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.161528 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1454  hypothetical protein  32.34 
 
 
165 aa  52.4  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.390893  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5410  hypothetical protein  29.1 
 
 
204 aa  52  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.891019 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5578  hypothetical protein  41.52 
 
 
198 aa  52  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0388  hypothetical protein  30.81 
 
 
213 aa  52  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.68163 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2068  hypothetical protein  35.37 
 
 
176 aa  50.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0134546 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0872  hypothetical protein  30.95 
 
 
201 aa  48.5  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1054  putative permease  35.8 
 
 
201 aa  48.5  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0130  hypothetical protein  25.14 
 
 
184 aa  47.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.722331  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5139  signal transduction histidine kinase LytS  37.06 
 
 
522 aa  46.6  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5131  putative transmembrane protein  32.41 
 
 
171 aa  46.2  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2874  hypothetical protein  30.99 
 
 
232 aa  43.9  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4729  hypothetical protein  35.88 
 
 
204 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5439  hypothetical protein  28.02 
 
 
193 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.627744 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1260  hypothetical protein  27 
 
 
243 aa  42.4  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5073  hypothetical protein  25 
 
 
197 aa  42.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191555  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0195  putative transmembrane protein  34.55 
 
 
170 aa  42  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386415  normal  0.4903 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2700  hypothetical protein  35.11 
 
 
169 aa  41.6  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3236  hypothetical protein  27.39 
 
 
163 aa  41.6  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1167  hypothetical protein  26.06 
 
 
193 aa  41.6  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1115  hypothetical protein  30.59 
 
 
176 aa  41.6  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000737552  normal  0.471201 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2701  hypothetical protein  35.11 
 
 
169 aa  41.6  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0214  hypothetical protein  34.38 
 
 
170 aa  41.2  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000429039 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0555  hypothetical protein  29.27 
 
 
183 aa  41.2  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.913643 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>