More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1088 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  100 
 
 		 880 aa  1774    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  48.42 
 
 		 884 aa  856    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.61 
 
 		 878 aa  377  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  33.82 
 
 		 811 aa  365  2e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  33.62 
 
 		 808 aa  352  1e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.79 
 
 		 855 aa  352  1e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  30.49 
 
 		 817 aa  352  2e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  32.48 
 
 		 796 aa  339  1.9999999999999998e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  29.81 
 
 		 887 aa  329  2.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.57 
 
 		 915 aa  327  4.0000000000000003e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.26 
 
 		 893 aa  322  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.97 
 
 		 871 aa  319  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.13 
 
 		 817 aa  317  6e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.43 
 
 		 913 aa  316  9.999999999999999e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  29.94 
 
 		 802 aa  313  1e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.66 
 
 		 822 aa  311  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.62 
 
 		 817 aa  312  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.09 
 
 		 807 aa  310  9e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  29.48 
 
 		 814 aa  310  1.0000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.34 
 
 		 888 aa  306  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  31.34 
 
 		 808 aa  305  3.0000000000000004e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.77 
 
 		 844 aa  301  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.22 
 
 		 919 aa  302  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.03 
 
 		 807 aa  298  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.85 
 
 		 846 aa  298  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  30.84 
 
 		 805 aa  298  3e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.41 
 
 		 874 aa  298  3e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.89 
 
 		 813 aa  296  9e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  30.53 
 
 		 797 aa  296  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.04 
 
 		 849 aa  295  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  30.07 
 
 		 804 aa  293  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.15 
 
 		 809 aa  291  5.0000000000000004e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  29.54 
 
 		 865 aa  290  7e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  29.93 
 
 		 869 aa  290  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.14 
 
 		 862 aa  289  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.27 
 
 		 882 aa  288  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  30.17 
 
 		 804 aa  286  9e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  29.81 
 
 		 798 aa  282  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.94 
 
 		 823 aa  281  4e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  31.21 
 
 		 809 aa  280  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  29.53 
 
 		 805 aa  279  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  29.98 
 
 		 848 aa  278  4e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.37 
 
 		 808 aa  277  8e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.14 
 
 		 805 aa  276  9e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.1 
 
 		 805 aa  274  7e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  29.59 
 
 		 809 aa  273  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.3 
 
 		 805 aa  272  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.78 
 
 		 816 aa  265  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  29.66 
 
 		 861 aa  265  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  28.52 
 
 		 844 aa  265  4e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  30.2 
 
 		 800 aa  264  4.999999999999999e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.16 
 
 		 883 aa  264  6e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  28.43 
 
 		 887 aa  263  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  29.99 
 
 		 808 aa  262  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  26.06 
 
 		 845 aa  258  3e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  28.07 
 
 		 821 aa  256  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.04 
 
 		 805 aa  255  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  29.13 
 
 		 810 aa  255  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  29.78 
 
 		 806 aa  254  7e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  29.35 
 
 		 803 aa  253  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  27.97 
 
 		 831 aa  252  3e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  28.61 
 
 		 803 aa  250  7e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  28.78 
 
 		 819 aa  249  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  30.17 
 
 		 835 aa  244  6e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  25.15 
 
 		 813 aa  243  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  28.43 
 
 		 816 aa  242  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  28.69 
 
 		 810 aa  240  6.999999999999999e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.95 
 
 		 812 aa  240  6.999999999999999e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  27.06 
 
 		 803 aa  239  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.91 
 
 		 879 aa  238  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  28.6 
 
 		 843 aa  236  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.33 
 
 		 821 aa  232  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  27.81 
 
 		 931 aa  232  3e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  29.1 
 
 		 808 aa  231  3e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  25.87 
 
 		 809 aa  218  5.9999999999999996e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.46 
 
 		 820 aa  215  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.08 
 
 		 828 aa  213  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.37 
 
 		 810 aa  207  8e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  23.74 
 
 		 810 aa  179  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  27.99 
 
 		 819 aa  179  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  23.98 
 
 		 810 aa  177  8e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3433  protein of unknown function DUF214  22.35 
 
 		 809 aa  120  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.560491  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  26.22 
 
 		 807 aa  115  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4594  protein of unknown function DUF214  24.89 
 
 		 813 aa  111  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1760  protein of unknown function DUF214  23.02 
 
 		 798 aa  108  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962231  normal  0.806233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4617  protein of unknown function DUF214  23.29 
 
 		 792 aa  107  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.214222 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4858  protein of unknown function DUF214  24.48 
 
 		 809 aa  107  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0512952 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3764  protein of unknown function DUF214  23.28 
 
 		 714 aa  105  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5137  protein of unknown function DUF214  25.38 
 
 		 792 aa  104  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.11243 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3505  ABC transporter, permease protein  23.52 
 
 		 804 aa  103  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.084112  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2954  protein of unknown function DUF214  24.62 
 
 		 803 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  22.22 
 
 		 770 aa  102  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0927  protein of unknown function DUF214  25.95 
 
 		 797 aa  101  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16153  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4610  protein of unknown function DUF214  22.12 
 
 		 798 aa  101  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.22275 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1806  protein of unknown function DUF214  23.13 
 
 		 790 aa  100  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0658  protein of unknown function DUF214  25.21 
 
 		 793 aa  101  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442095  normal  0.737711 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3271  protein of unknown function DUF214  24.62 
 
 		 795 aa  99.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal  0.0322761 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4847  protein of unknown function DUF214  23.2 
 
 		 818 aa  99.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.119483  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0603  protein of unknown function DUF214  23.61 
 
 		 809 aa  98.2  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.237353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0957  protein of unknown function DUF214  22.22 
 
 		 785 aa  97.4  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439448  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>