More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0976 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0976  amino acid transporter  100 
 
 		 470 aa  934    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046598 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3036  amino acid transporter  33.41 
 
 		 464 aa  226  5.0000000000000005e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0805799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3114  amino acid transporter  30.67 
 
 		 446 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11160  predicted protein  29.63 
 
 		 433 aa  111  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.882711  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1497  amino acid permease-associated region  30.03 
 
 		 440 aa  110  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.649602  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1526  amino acid permease-associated region  30.03 
 
 		 440 aa  110  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0740999  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2701  amino acid transporter  25.69 
 
 		 489 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3835  amino acid transporter  29.74 
 
 		 439 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  26.05 
 
 		 438 aa  103  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  26.19 
 
 		 438 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  26.19 
 
 		 438 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  26.19 
 
 		 438 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  26.19 
 
 		 438 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  26.19 
 
 		 438 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  26.19 
 
 		 437 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  26.19 
 
 		 437 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  27.73 
 
 		 443 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9233  predicted protein  28.42 
 
 		 353 aa  102  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00000123745  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  28.83 
 
 		 429 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0084  threonine transporter  26.44 
 
 		 387 aa  100  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  26.19 
 
 		 437 aa  98.2  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0718  amino acid permease family protein  28.93 
 
 		 473 aa  97.8  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  25.53 
 
 		 436 aa  97.4  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0678  amino acid transporter  28.62 
 
 		 421 aa  95.5  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.633232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  25.52 
 
 		 439 aa  95.1  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0567  amino acid transporter  25.44 
 
 		 452 aa  92.8  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0228349 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  29.2 
 
 		 455 aa  92  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2763  ethanolamine transproter  25.68 
 
 		 441 aa  90.9  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0105915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  27.25 
 
 		 485 aa  91.3  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0445  amino acid permease  25.07 
 
 		 426 aa  90.1  8e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000397922  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1307  amino acid permease-associated region  27.59 
 
 		 445 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.678061 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0536  amino acid permease-associated region  30.04 
 
 		 435 aa  88.6  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.555012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  29.28 
 
 		 753 aa  88.2  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  25.07 
 
 		 443 aa  87  6e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  26.46 
 
 		 461 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2262  putative transport protein  25.61 
 
 		 470 aa  85.9  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  24.85 
 
 		 435 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2346  amino acid permease-associated region  26.74 
 
 		 447 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2931  ethanolamine transproter  26.43 
 
 		 479 aa  85.9  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3386  amino acid permease-associated region  27.61 
 
 		 482 aa  85.5  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.944667  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4821  ethanolamine transproter  25 
 
 		 445 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2206  amino acid permease-associated region  26.12 
 
 		 452 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218547  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3197  ethanolamine permease  27.13 
 
 		 480 aa  85.1  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1030  amino acid permease-associated region  26.2 
 
 		 474 aa  84  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0422459  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1345  amino acid permease-associated region  26.72 
 
 		 521 aa  84  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000295081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  27.66 
 
 		 473 aa  84  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  29.89 
 
 		 460 aa  83.6  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2279  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 382 aa  83.2  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665264  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  27.7 
 
 		 474 aa  82.4  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4037  ethanolamine transproter  26.24 
 
 		 486 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.521145  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8502  ethanolamine transproter  24.59 
 
 		 457 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633292  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  26.45 
 
 		 440 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  27.18 
 
 		 503 aa  81.3  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1535  amino acid permease  27.91 
 
 		 496 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  27.3 
 
 		 770 aa  80.5  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5443  amino acid permease-associated region  23.95 
 
 		 463 aa  80.5  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.863947 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0126  ethanolamine transproter  25.14 
 
 		 461 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.921777 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02485  hypothetical protein  23.39 
 
 		 475 aa  80.1  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0128  ethanolamine transproter  24.29 
 
 		 470 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1294  ethanolamine transproter  24.63 
 
 		 467 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3308  putative amino acid transporter  24.29 
 
 		 470 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3285  amino acid transporter  24.62 
 
 		 522 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0118  ethanolamine transproter  24.29 
 
 		 470 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  24.61 
 
 		 444 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3940  putative ethanolamine permease  24.86 
 
 		 469 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.867607  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2981  ethanolamine permease, putative  24.86 
 
 		 469 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0142  ethanolamine permease  24.86 
 
 		 469 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0935  amino acid transporter  28.32 
 
 		 500 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.801985 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3283  ethanolamine transporter  24.86 
 
 		 469 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1557  putative ethanolamine permease  24.86 
 
 		 469 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2927  ethanolamine permease  24.58 
 
 		 470 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11790  putative amino acid transporter  26.25 
 
 		 482 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0380626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0142  ethanolamine transproter  24.58 
 
 		 470 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3442  ethanolamine transproter  26.59 
 
 		 469 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.477393 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0128  ethanolamine transproter  24.58 
 
 		 470 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3045  putative ethanolamine permease  24.86 
 
 		 469 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3325  putative ethanolamine permease  24.86 
 
 		 469 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0336  amino acid permease-associated region  26.35 
 
 		 433 aa  78.2  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733586 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1907  amino acid permease-associated region  26.2 
 
 		 486 aa  78.6  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5504  amino acid permease-associated region  28.03 
 
 		 500 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  25.59 
 
 		 453 aa  77.8  0.0000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1848  ethanolamine transporter  24.41 
 
 		 479 aa  77.8  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.079886  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4445  ethanolamine transporter, EAT family, APC superfamily  23.23 
 
 		 467 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.697181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3588  amino acid permease-associated region  28.03 
 
 		 494 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0708  amino acid permease-associated region  26.05 
 
 		 480 aa  77.4  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000156631 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4779  amino acid permease-associated region  28.03 
 
 		 494 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0020  ethanolamine transproter  23.8 
 
 		 467 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5190  putative amino acid transporter  27.82 
 
 		 458 aa  77  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2299  amino acid permease-associated region  25.93 
 
 		 463 aa  77  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2416  ethanolamine permease, putative  23.43 
 
 		 455 aa  76.6  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.452743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0046  amino acid permease-associated region  26.02 
 
 		 481 aa  76.6  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003630  amino acid/polyamine  23.61 
 
 		 475 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1083  ethanolamine permease  25.78 
 
 		 482 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0006  ethanolamine transproter  24.08 
 
 		 467 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56424  hitchhiker  0.00761028 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3333  amino acid transporter  26.39 
 
 		 480 aa  76.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.326771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5198  amino acid permease-associated region  27.66 
 
 		 441 aa  76.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.043341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4486  ethanolamine permease  24.82 
 
 		 467 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787946  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4869  ethanolamine transproter  24.82 
 
 		 467 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154328  normal  0.109482 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1492  amino acid permease-associated region  26.53 
 
 		 431 aa  76.3  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.993916  normal  0.460323 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4573  ethanolamine transproter  24.82 
 
 		 467 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0966577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>