271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0971 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  100 
 
 		 666 aa  1357    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5176  amidohydrolase  30.78 
 
 		 686 aa  243  9e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167618  normal  0.830849 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3211  amidohydrolase  32.28 
 
 		 680 aa  224  4.9999999999999996e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361649  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0535  amidohydrolase family protein  30.3 
 
 		 672 aa  220  7.999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2416  amidohydrolase  29.09 
 
 		 702 aa  177  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0066037  normal  0.0385776 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3085  amidohydrolase family protein  27.67 
 
 		 694 aa  171  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2681  amidohydrolase  30.12 
 
 		 692 aa  155  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  28.43 
 
 		 478 aa  144  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  29.7 
 
 		 438 aa  143  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3066  amidohydrolase  29.58 
 
 		 490 aa  139  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  28.07 
 
 		 440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2922  amidohydrolase  30.14 
 
 		 511 aa  134  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  32.92 
 
 		 470 aa  134  5e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2344  amidohydrolase  30.21 
 
 		 485 aa  134  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.684912  normal  0.818181 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2556  amidohydrolase  28.51 
 
 		 483 aa  131  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  27.49 
 
 		 568 aa  124  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  28.57 
 
 		 448 aa  120  7.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11210  amidohydrolase  30.28 
 
 		 456 aa  119  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170748  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1186  amidohydrolase  27.71 
 
 		 512 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000825037 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  28.38 
 
 		 1071 aa  114  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  28.64 
 
 		 1078 aa  114  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2661  amidohydrolase  27.9 
 
 		 484 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  26.42 
 
 		 1005 aa  111  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  26.71 
 
 		 1111 aa  110  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3381  amidohydrolase  25.37 
 
 		 455 aa  109  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.571146 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  26.11 
 
 		 1084 aa  108  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  28.23 
 
 		 1138 aa  107  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0268  amidohydrolase  25.37 
 
 		 451 aa  107  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.863034  normal  0.27554 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0618  amidohydrolase  25.86 
 
 		 496 aa  106  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210154 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  26.4 
 
 		 1062 aa  107  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  27.35 
 
 		 438 aa  106  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2881  amidohydrolase  29.47 
 
 		 819 aa  105  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  26.38 
 
 		 585 aa  104  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  28.18 
 
 		 1113 aa  100  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  27.29 
 
 		 433 aa  100  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  26.51 
 
 		 1062 aa  100  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0258  amidohydrolase  26.86 
 
 		 441 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0639139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  26.44 
 
 		 407 aa  99.4  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  25.29 
 
 		 1067 aa  99.4  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  24.01 
 
 		 1066 aa  96.3  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  24.33 
 
 		 1060 aa  96.3  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5309  amidohydrolase  25.81 
 
 		 543 aa  95.5  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal  0.749654 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  27.54 
 
 		 1059 aa  95.1  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1060  amidohydrolase  25.22 
 
 		 438 aa  94.7  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132044 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  24.69 
 
 		 1014 aa  94.4  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  26.51 
 
 		 426 aa  93.2  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  23.78 
 
 		 1065 aa  92.8  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  25 
 
 		 1062 aa  89.7  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  25.91 
 
 		 444 aa  87.8  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  26.3 
 
 		 1042 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0594  amidohydrolase  24.94 
 
 		 480 aa  85.9  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251478 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  24.94 
 
 		 434 aa  85.1  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  26.91 
 
 		 1040 aa  84.3  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  26 
 
 		 433 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  26.83 
 
 		 1010 aa  83.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  26.91 
 
 		 1042 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  25.11 
 
 		 407 aa  82  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0868  amidohydrolase  46.23 
 
 		 351 aa  80.9  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2208  amidohydrolase  25.97 
 
 		 440 aa  79.7  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00166067 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  24.38 
 
 		 437 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  26.48 
 
 		 429 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  23.61 
 
 		 441 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  27.1 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  24.2 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  27.23 
 
 		 440 aa  77.4  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2475  amidohydrolase  28.87 
 
 		 397 aa  76.6  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  26.29 
 
 		 1031 aa  76.6  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  26.19 
 
 		 426 aa  75.9  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  26.36 
 
 		 444 aa  75.9  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  24.94 
 
 		 430 aa  74.3  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3987  amidohydrolase  24.88 
 
 		 435 aa  73.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3491  Pro-Hyp dipeptidase  23.8 
 
 		 426 aa  72.8  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  26.71 
 
 		 459 aa  72.4  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  26.54 
 
 		 423 aa  72  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  23.96 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  23.99 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  25.7 
 
 		 432 aa  70.5  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  26.05 
 
 		 444 aa  70.1  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  22.81 
 
 		 431 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4683  amidohydrolase  29.72 
 
 		 540 aa  68.2  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.524351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  24.31 
 
 		 455 aa  68.2  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4905  amidohydrolase  44 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  25.28 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  29.17 
 
 		 1069 aa  67  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  21.83 
 
 		 401 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  23.94 
 
 		 412 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09041  imidazolonepropionase  24.31 
 
 		 411 aa  65.9  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11911  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  25.55 
 
 		 423 aa  66.2  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  24.15 
 
 		 433 aa  66.2  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  23.15 
 
 		 418 aa  65.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02779  conserved hypothetical protein  24.59 
 
 		 493 aa  65.1  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.243832  normal  0.291851 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0015  amidohydrolase  28.43 
 
 		 598 aa  65.1  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5667  amidohydrolase:amidohydrolase-like  42.67 
 
 		 529 aa  64.7  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1803  amidohydrolase  36.46 
 
 		 1052 aa  64.7  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000234818 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  34.48 
 
 		 1062 aa  64.7  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  34.48 
 
 		 1062 aa  64.3  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  25.52 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  28.43 
 
 		 1062 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  23.31 
 
 		 413 aa  63.5  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1275  amidohydrolase  24.38 
 
 		 415 aa  63.5  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>