201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0898 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  100 
 
 
783 aa  1636    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5548  Alpha-glucosidase  44.07 
 
 
951 aa  505  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.426673  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1004  glycoside hydrolase family 31  35.63 
 
 
791 aa  480  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.667554  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00115  alpha-xylosidase  44.08 
 
 
969 aa  477  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732111  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1292  glycoside hydrolase family protein  43.99 
 
 
944 aa  474  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0279218  normal  0.0671724 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2500  Holliday junction DNA helicase RuvB  40.27 
 
 
973 aa  452  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.297419  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  38.81 
 
 
806 aa  449  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  34.85 
 
 
770 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3277  glycoside hydrolase family protein  36.25 
 
 
974 aa  372  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3221  glycoside hydrolase family protein  34.25 
 
 
995 aa  357  5e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.179721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2608  glycoside hydrolase family 31  35.28 
 
 
695 aa  355  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805177  normal  0.759517 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0019  glycosy hydrolase family protein  34.84 
 
 
679 aa  348  2e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0278482  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00280  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03140)  34.59 
 
 
661 aa  348  3e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0244988 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0520  alpha-glucosidase  34.28 
 
 
668 aa  347  5e-94  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.284712  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0045  glycoside hydrolase, family 31  35.08 
 
 
679 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229343  normal  0.24021 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0046  glycoside hydrolase, family 31  35.08 
 
 
679 aa  345  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118014  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0045  glycoside hydrolase, family 31  35.08 
 
 
679 aa  345  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0046  glycoside hydrolase, family 31  35.08 
 
 
679 aa  345  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.39622  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0044  glycoside hydrolase, family 31  35.08 
 
 
679 aa  345  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.228548  decreased coverage  0.00512205 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02870  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  36.41 
 
 
690 aa  343  7e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07120  conserved hypothetical protein  33.5 
 
 
699 aa  338  1.9999999999999998e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.845548 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  29.75 
 
 
801 aa  324  4e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09480  glycoside hydrolase family 31  36.8 
 
 
840 aa  317  4e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000232453  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  29.64 
 
 
836 aa  316  8e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  29.36 
 
 
821 aa  303  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  28.4 
 
 
777 aa  302  2e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  29.68 
 
 
785 aa  302  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  31.88 
 
 
1024 aa  295  3e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  28.24 
 
 
779 aa  295  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  28.01 
 
 
799 aa  288  2.9999999999999996e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  26.76 
 
 
752 aa  286  8e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  29.37 
 
 
776 aa  284  4.0000000000000003e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  27.12 
 
 
828 aa  284  5.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  29.52 
 
 
779 aa  280  7e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  29.92 
 
 
794 aa  278  3e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  32.03 
 
 
779 aa  273  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  27.31 
 
 
836 aa  270  1e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  28.65 
 
 
803 aa  270  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  28.77 
 
 
768 aa  266  1e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  27.27 
 
 
797 aa  265  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  28.51 
 
 
792 aa  264  4e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  27.34 
 
 
845 aa  244  5e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  28.37 
 
 
806 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  28.93 
 
 
760 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  30.02 
 
 
839 aa  239  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  27.49 
 
 
765 aa  236  9e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  26 
 
 
746 aa  235  3e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  30.05 
 
 
695 aa  232  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  27.36 
 
 
825 aa  231  4e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  28.17 
 
 
765 aa  231  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  27.27 
 
 
788 aa  228  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  26.8 
 
 
821 aa  226  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  27.1 
 
 
743 aa  222  1.9999999999999999e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  29.01 
 
 
795 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1643  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  27.5 
 
 
791 aa  220  8.999999999999998e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03521  conserved hypothetical protein  28.36 
 
 
795 aa  219  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03472  hypothetical protein  28.36 
 
 
795 aa  219  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  27.96 
 
 
828 aa  218  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1312  glucan 1,3-alpha-glucosidase  29.65 
 
 
787 aa  216  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  28.62 
 
 
764 aa  214  4.9999999999999996e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  25.81 
 
 
798 aa  214  7e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  27.11 
 
 
764 aa  213  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  30.02 
 
 
757 aa  212  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3598  Alpha-glucosidase  27.5 
 
 
790 aa  206  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000274  normal  0.390231 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2626  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  26.87 
 
 
788 aa  204  7e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  27.45 
 
 
771 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  27.26 
 
 
778 aa  203  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  28.39 
 
 
794 aa  203  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  26.37 
 
 
780 aa  203  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2352  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  27.15 
 
 
788 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1956  glycoside hydrolase family protein  26.61 
 
 
927 aa  201  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.289429  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2781  glycoside hydrolase family protein  28.48 
 
 
799 aa  201  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413294  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1794  Alpha-glucosidase  25.91 
 
 
687 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.761488  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0977  Alpha-glucosidase  26.7 
 
 
791 aa  199  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0924  glycosy hydrolase family protein  27.4 
 
 
791 aa  199  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  27.06 
 
 
775 aa  198  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  27.09 
 
 
816 aa  198  4.0000000000000005e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1872  Alpha-glucosidase  27.2 
 
 
806 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00900175  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  24.74 
 
 
770 aa  197  6e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  25.66 
 
 
779 aa  196  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  28.78 
 
 
799 aa  196  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  27.03 
 
 
760 aa  196  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32530  Alpha-glucosidase II; Alpha-xylosidase  28.59 
 
 
823 aa  195  4e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.725216  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3360  glycosy hydrolase family protein  26.86 
 
 
789 aa  194  4e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0133  glycoside hydrolase family 31  25.1 
 
 
798 aa  194  5e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3358  Alpha-glucosidase  26.84 
 
 
806 aa  194  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032039  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  27.32 
 
 
749 aa  192  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  26.13 
 
 
772 aa  191  5.999999999999999e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2044  Alpha-glucosidase  26.24 
 
 
685 aa  191  5.999999999999999e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1108  Alpha-glucosidase  26.04 
 
 
728 aa  190  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.910405  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4208  glycoside hydrolase family protein  26.69 
 
 
806 aa  189  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0739255  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4158  glycoside hydrolase family protein  26.69 
 
 
806 aa  189  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00315991 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  24.8 
 
 
772 aa  189  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  27.53 
 
 
804 aa  188  3e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2087  Alpha-glucosidase  28.55 
 
 
762 aa  188  4e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.290545  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  27.29 
 
 
780 aa  188  4e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3867  Alpha-glucosidase  27.65 
 
 
784 aa  187  4e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.191857 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0793  Alpha-glucosidase  25.35 
 
 
700 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15100  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  25.33 
 
 
816 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  27.49 
 
 
766 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>