50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0890 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0890  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
446 aa  878    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267642  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3669  polysaccharide biosynthesis protein  22.69 
 
 
501 aa  74.7  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1344  polysaccharide biosynthesis protein  23.51 
 
 
488 aa  70.9  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  21.23 
 
 
504 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3796  polysaccharide biosynthesis protein  21.96 
 
 
478 aa  68.2  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3973  polysaccharide biosynthesis protein  25.15 
 
 
488 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4394  polysaccharide biosynthesis protein  25.15 
 
 
488 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3556  polysaccharide biosynthesis protein  25.15 
 
 
488 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225239  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1706  polysaccharide biosynthesis family protein  24.85 
 
 
488 aa  67  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974383  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1073  polysaccharide biosynthesis protein  23.5 
 
 
492 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.610845 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0545  polysaccharide biosynthesis family protein  24.85 
 
 
484 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2289  polysaccharide biosynthesis protein  24.85 
 
 
484 aa  67  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2428  polysaccharide biosynthesis protein  24.85 
 
 
484 aa  67  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1873  polysaccharide biosynthesis family protein  24.85 
 
 
484 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1665  polysaccharide biosynthesis family protein  24.85 
 
 
484 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702931  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0753  polysaccharide biosynthesis family protein  24.85 
 
 
488 aa  67  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0694  polysaccharide biosynthesis family protein  25.44 
 
 
488 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.731179  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2229  polysaccharide transporter  24.48 
 
 
488 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2518  polysaccharide exporter, (PST) family  25.15 
 
 
486 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0230734 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2112  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
498 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.306384 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1969  polysaccharide biosynthesis protein  23.58 
 
 
488 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3866  polysaccharide biosynthesis protein  25.15 
 
 
488 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.377761  normal  0.957657 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  27.31 
 
 
504 aa  61.6  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1637  polysaccharide biosynthesis protein  22.87 
 
 
504 aa  61.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3362  polysaccharide biosynthesis protein  25.15 
 
 
488 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0076  polysaccharide biosynthesis protein  24.35 
 
 
499 aa  60.1  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.160586  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0079  polysaccharide biosynthesis protein  24.35 
 
 
499 aa  60.1  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.75242  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3487  polysaccharide biosynthesis protein  24.02 
 
 
424 aa  59.7  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0265796 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4609  polysaccharide biosynthesis protein  25.74 
 
 
488 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286147  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  22.94 
 
 
489 aa  57.8  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  25.6 
 
 
429 aa  55.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2770  polysaccharide biosynthesis protein  26.7 
 
 
460 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  26.3 
 
 
511 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  24.86 
 
 
446 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0678  polysaccharide biosynthesis protein  23.42 
 
 
499 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1572  polysaccharide biosynthesis protein  23.21 
 
 
502 aa  50.1  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3233  polysaccharide biosynthesis protein  24.45 
 
 
473 aa  50.1  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  24.07 
 
 
427 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2211  polysaccharide biosynthesis protein  19.02 
 
 
494 aa  47.8  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167884  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0958  polysaccharide biosynthesis protein  22.78 
 
 
517 aa  47.4  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.393592  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2844  polysaccharide biosynthesis protein  18.87 
 
 
457 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1424  transporter, putative  24.93 
 
 
938 aa  46.2  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3859  polysaccharide biosynthesis protein  24.76 
 
 
461 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201275  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3073  polysaccharide biosynthesis protein  22.73 
 
 
491 aa  44.3  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0704  polysaccharide biosynthesis protein  24.08 
 
 
423 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.786824  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0869  polysaccharide biosynthesis protein  26.77 
 
 
509 aa  44.3  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1759  polysaccharide biosynthesis protein  21.98 
 
 
423 aa  44.3  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1689  polysaccharide biosynthesis protein  31.11 
 
 
452 aa  43.5  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.267444 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  28.95 
 
 
482 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0667  polysaccharide biosynthesis protein  26.02 
 
 
476 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.529656 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>