More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0823 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0823  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 502 aa  1023    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 748 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  28.9 
 
 		 4079 aa  102  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 377 aa  93.6  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0915  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 		 324 aa  92.8  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.48 
 
 		 878 aa  87  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.09 
 
 		 810 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.55 
 
 		 364 aa  83.6  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  21.8 
 
 		 750 aa  80.5  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  30.13 
 
 		 267 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  26.41 
 
 		 1069 aa  79  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.57 
 
 		 3145 aa  77.8  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 405 aa  77  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  30.16 
 
 		 808 aa  75.5  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  24.15 
 
 		 795 aa  75.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 		 399 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0424  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 313 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.446862  normal  0.0100173 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  28.21 
 
 		 519 aa  73.6  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.88 
 
 		 632 aa  73.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  23.11 
 
 		 614 aa  73.2  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.72 
 
 		 296 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  23.35 
 
 		 649 aa  71.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  31.01 
 
 		 550 aa  71.2  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.09 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  23.17 
 
 		 860 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 		 968 aa  71.2  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  27.46 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  23.74 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  25.46 
 
 		 486 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  33.1 
 
 		 626 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.36 
 
 		 689 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  28.06 
 
 		 1737 aa  69.3  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  23.02 
 
 		 594 aa  68.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  33.1 
 
 		 614 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  21.36 
 
 		 725 aa  68.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  31.58 
 
 		 626 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  33.1 
 
 		 614 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  33.1 
 
 		 614 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.94 
 
 		 839 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  27.57 
 
 		 535 aa  68.2  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  23.86 
 
 		 566 aa  68.2  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  25.56 
 
 		 462 aa  67.4  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.13 
 
 		 818 aa  67.4  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  32.39 
 
 		 614 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  32.39 
 
 		 626 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 1127 aa  67.4  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.79 
 
 		 784 aa  67  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  32.39 
 
 		 614 aa  67  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  24.5 
 
 		 634 aa  67  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.17 
 
 		 363 aa  67  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.17 
 
 		 363 aa  67  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0523  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.15246  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.29 
 
 		 1676 aa  66.6  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.51 
 
 		 1022 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.57 
 
 		 927 aa  66.6  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  24.91 
 
 		 1979 aa  66.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0959  TPR repeat-containing protein  27.71 
 
 		 199 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.31 
 
 		 1056 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3925  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 		 1180 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  26.25 
 
 		 676 aa  66.6  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.5 
 
 		 988 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  25 
 
 		 561 aa  65.5  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  22.66 
 
 		 685 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 		 605 aa  65.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  22.99 
 
 		 543 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.67 
 
 		 293 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0911  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 		 515 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.19098  hitchhiker  0.00518464 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 		 568 aa  65.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  23.57 
 
 		 436 aa  65.1  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  24.75 
 
 		 733 aa  64.7  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  21.95 
 
 		 887 aa  65.1  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  23.05 
 
 		 465 aa  64.7  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  28.23 
 
 		 585 aa  64.3  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 		 4489 aa  64.3  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0990  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.16 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113297  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3220  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 		 1178 aa  64.3  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.166794 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 636 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.04 
 
 		 624 aa  63.9  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 639 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 637 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 		 635 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 		 635 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1609  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.994867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  23.94 
 
 		 567 aa  63.2  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  23.02 
 
 		 1138 aa  63.5  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 		 611 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  22.97 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.57 
 
 		 572 aa  63.5  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  21.3 
 
 		 448 aa  63.5  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.1 
 
 		 2240 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.94 
 
 		 1056 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.97 
 
 		 249 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  24.6 
 
 		 561 aa  63.2  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  23.72 
 
 		 397 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 		 3560 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1019  TPR repeat-containing protein  24.21 
 
 		 273 aa  63.2  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  25.7 
 
 		 635 aa  62.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.17 
 
 		 249 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>